当前蛋白身份：P19934
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1S62 Solution structure of the Escherichia coli TolA C-terminal domain 提交 2004-01-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
325–421（97 aa）
片段：C-terminal domain (residues 325-421)
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.8；300 K；离子强度（mmCIF原始值）100mN NaCl, 50mM NaPO4；压力 ambient
NMR测量条件
pH 6.8；300 K；离子强度（mmCIF原始值）50mN NaCl, 50mM NaPO4；压力 ambient
NMR测量条件
pH 6.8；300 K；离子强度（mmCIF原始值）500mN NaCl, 50mM NaPO4；压力 ambient
NMR样品组成
1.4mM U-15N, 100mN NaCl, 50mM NaPO4, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5mM U-15N,13C, 50mN NaCl, 50mM NaPO4, Complete protease inhibitor (Boehringer), 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.7mM U-15N, 500mN NaCl, 50mM NaPO4, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 1TOL FUSION OF N-TERMINAL DOMAIN OF THE MINOR COAT PROTEIN FROM GENE III IN PHAGE M13, AND C-TERMINAL DOMAIN OF E. COLI PROTEIN-TOLA 提交 1999-05-17 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
295–421（127 aa）
片段：N-TERMINAL DOMAIN OF MINOR COAT PROTEIN AND C-TERMINAL DOMAIN OF TOLA
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；PROTEIN AT CONCENTRATION 8-12 MG/ML IN 50 MM HEPES (PH=7.5) WITH ADDITION OF DTT C=2MM, WAS CRYSTALLIZED USING VAPOR DIFFUSION FROM THE SITTING OR HANGING DROP, WITH THE SOLUTION CONTAINING 25% PEG4000, 0.08M TRIS (PH=8.5), AND 0.15 M SODIUM ACETATE AS A PRECIPITANT. BEFORE SETTING THE DROPS, PROTEIN SOLUTION WAS MIXED WITH THE PRECIPITANT IN THE RATIO 1:1. CRYSTALS WERE GROWING BEST AT TEMPERATURE 15 DEGREES CELSIUS.
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分辨率 1.85 Å R-free 0.293 |
| 3QDP Structural characterization of the interaction of colicin A, colicin N, and TolB with TolAIII translocon 提交 2011-01-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
302–421（120 aa）
片段：TolA domain III, residues 302-421
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NO3 NITRATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.28；293 K；0.2 M NaNO3, 2.2 M ammonium sulphate, pH 5.28, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
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分辨率 2.15 Å R-free 0.225 |
| 3QDR Structural characterization of the interaction of colicin A, colicin N, and TolB with the TolAIII translocon 提交 2011-01-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
302–421（120 aa）
片段：TolA domain III, residues 302-421
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.2 M K2HPO4, 2.2 M ammonium sulphate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
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分辨率 2.65 Å R-free 0.273 |
| 9DDM E. coli TolAQR conformation I 提交 2024-08-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 F
2–421（420 aa）
链 G
2–421（420 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.94 Å |
| 9DDN E. coli TolAQR conformation II 提交 2024-08-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 F
2–421（420 aa）
链 G
2–421（420 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.18 Å |
| 9K49 Cryo-EM structure of inner membrane TolQRA complex in CYMAL-6-Neopentyl Glycol detergent micelles 提交 2024-10-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 H
1–421（421 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；Phosphate-buffered saline (PBS) buffer at pH 7.5 (20 mM PBS pH 7.5, 300 mM NaCl) with 20 mM Imidazole and 0.04 mM CYMAL-6 Neopentyl Glycol detergent
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 9KCH Cryo-EM structure of inner membrane TolQRA complex in CYMAL-6-Neopentyl Glycol detergent micelles 提交 2024-11-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 H
1–421（421 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；Phosphate-buffered saline (PBS) buffer at pH 7.5 (20 mM PBS pH 7.5, 300 mM NaCl) with 20 mM Imidazole and 0.04 mM CYMAL-6 Neopentyl Glycol detergent
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.19 Å |
| 9KPZ Structure of TolQRA complex at pH 5.4 from E.coli 提交 2024-11-24 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 H
2–421（420 aa）
链 I
2–421（420 aa）
链 J
2–421（420 aa）
链 K
2–421（420 aa）
链 L
2–421（420 aa）
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未记录 | 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 5.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.18 Å |
| 9KQ0 Structure of TolQRA complex at pH 8.0 from E.coli 提交 2024-11-24 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 H
2–421（420 aa）
链 I
2–421（420 aa）
链 J
2–421（420 aa）
链 K
2–421（420 aa）
链 L
2–421（420 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 9QUQ cryo-EM structure of TolQR conformation2 in SMA nanodiscs 提交 2025-04-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 H
1–421（421 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.28 Å |
| 9QVD cryo-EM structure of TolQRA in nanodiscs 提交 2025-04-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 H
1–421（421 aa）
链 I
1–421（421 aa）
链 J
1–421（421 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.52 Å |