当前蛋白身份：P21146
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1OMW Crystal Structure of the complex between G Protein-Coupled Receptor Kinase 2 and Heterotrimeric G Protein beta 1 and gamma 2 subunits 提交 2003-02-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–689（689 aa）
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突变：S670A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.75；277 K；PEG 3350, Sodium Chloride, CHAPS, ATP, Magnesium Chloride, Mastoparan , MES pH 5.75, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.252 |
| 1YM7 G Protein-Coupled Receptor Kinase 2 (GRK2) 提交 2005-01-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–689（689 aa）
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突变：S670A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；278 K；HEPES, phosphoserine, sodium Chloride, Glycerol, PEG 8000, Urea, Dithiothreitol, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K
|
分辨率 4.50 Å R-free 0.279 |
| 1YM7 G Protein-Coupled Receptor Kinase 2 (GRK2) 提交 2005-01-20 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–689（689 aa）
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突变：S670A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；278 K；HEPES, phosphoserine, sodium Chloride, Glycerol, PEG 8000, Urea, Dithiothreitol, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K
|
分辨率 4.50 Å R-free 0.279 |
| 1YM7 G Protein-Coupled Receptor Kinase 2 (GRK2) 提交 2005-01-20 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–689（689 aa）
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突变：S670A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；278 K；HEPES, phosphoserine, sodium Chloride, Glycerol, PEG 8000, Urea, Dithiothreitol, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K
|
分辨率 4.50 Å R-free 0.279 |
| 1YM7 G Protein-Coupled Receptor Kinase 2 (GRK2) 提交 2005-01-20 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1–689（689 aa）
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突变：S670A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；278 K；HEPES, phosphoserine, sodium Chloride, Glycerol, PEG 8000, Urea, Dithiothreitol, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K
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分辨率 4.50 Å R-free 0.279 |
| 2BCJ Crystal Structure of G Protein-Coupled Receptor Kinase 2 in Complex with Galpha-q and Gbetagamma Subunits 提交 2005-10-19 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–689（689 aa）
片段：residues 28-689
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突变：S670A | MG MAGNESIUM ION × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；9% PEG8000, 1M NaCl, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.06 Å R-free 0.292 |
| 3PSC Bovine GRK2 in complex with Gbetagamma subunits 提交 2010-12-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–689（689 aa）
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突变：S670A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；9% PEG3350, 200 mM NaCl, 100 mM MES pH 6.5, 1 mM ATP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
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分辨率 2.67 Å R-free 0.257 |
| 3PVU Bovine GRK2 in complex with Gbetagamma subunits and a selective kinase inhibitor (CMPD101) 提交 2010-12-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–689（689 aa）
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突变：S670A | QRW 3-({[4-methyl-5-(pyridin-4-yl)-4H-1,2,4-triazol-3-yl]methyl}amino)-N-[2-(trifluoromethyl)benzyl]benzamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.25；277 K；7% PEG3350, 200 mM NaCl, 100 mM MES pH 5.25, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.48 Å R-free 0.274 |
| 3PVW Bovine GRK2 in complex with Gbetagamma subunits and a selective kinase inhibitor (CMPD103A) 提交 2010-12-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–689（689 aa）
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突变：S670A | QRX N-(2,6-difluorobenzyl)-3-({[4-propyl-5-(pyrimidin-4-yl)-4H-1,2,4-triazol-3-yl]methyl}amino)benzamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.25；277 K；7% PEG3350, 250 mM NaCl, 100 mM MES pH 6.25, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
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分辨率 2.49 Å R-free 0.285 |
| 3UZS Structure of the C13.28 RNA Aptamer Bound to the G Protein-Coupled Receptor Kinase 2-Heterotrimeric G Protein Beta 1 and Gamma 2 Subunit Complex 提交 2011-12-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–689（689 aa）
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突变：S670A | MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；100 mM Tris pH 8.5, 200 mM NaCl and 3% PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
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分辨率 4.52 Å R-free 0.268 |
| 3UZT Structure of the C13.18 RNA Aptamer in Complex with G Protein-Coupled Receptor Kinase 2 提交 2011-12-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–689（689 aa）
|
突变：S670A | MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；277 K；100 mM MES pH 5.9, 100 mM NaCl and 5% PEG 3350 supplemented with 0.1 M glycine, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.51 Å R-free 0.317 |
| 5HE0 Bovine GRK2 in complex with Gbetagamma subunits and CCG215022 提交 2016-01-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
30–670（641 aa）
片段：UNP residues 30-670
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突变：S670A | 453 (4S)-4-{4-fluoro-3-[(pyridin-2-ylmethyl)carbamoyl]phenyl}-N-(1H-indazol-5-yl)-6-methyl-2-oxo-1,2,3,4-tetrahydropyrimidine-5-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；50 mM MES, 0.8-1.2 M sodium chloride, 8-16% PEG3350
|
分辨率 2.56 Å R-free 0.264 |
| 5HE2 Bovine GRK2 in complex with Gbetagamma subunits and CCG224406 提交 2016-01-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
30–670（641 aa）
片段：UNP residues 30-670
|
突变：S670A | F0S (4~{S})-4-[3-[(2,6-dimethoxyphenyl)methylcarbamoyl]-4-fluoranyl-phenyl]-~{N}-(1~{H}-indazol-5-yl)-6-methyl-2-oxidanylidene-3,4-dihydro-1~{H}-pyrimidine-5-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；50 mM MES, 0.8-1.2 M sodium chloride, 8-16% PEG3350
|
分辨率 2.79 Å R-free 0.277 |
| 5HE3 Bovine GRK2 in complex with Gbetagamma subunits and CCG224411 提交 2016-01-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
30–670（641 aa）
片段：UNP residues 30-670
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 FF1 (4~{S})-4-[3-[2-(2,6-dimethylphenyl)ethylcarbamoyl]-4-fluoranyl-phenyl]-~{N}-(1~{H}-indazol-5-yl)-6-methyl-2-oxidanylidene-3,4-dihydro-1~{H}-pyrimidine-5-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；50 mM MES, 0.8-1.2 M sodium chloride, 8-16% PEG3350
|
分辨率 2.74 Å R-free 0.257 |
| 5UKM bovine GRK2 in complex with human Gbetagamma subunits and CCG258208 (14as) 提交 2017-01-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–689（689 aa）
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突变：S670A | T0E 5-[(3S,4R)-3-{[(2H-1,3-benzodioxol-5-yl)oxy]methyl}piperidin-4-yl]-2-fluoro-N-[(1H-pyrazol-5-yl)methyl]benzamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CMT O-METHYLCYSTEINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；100 mM MES, 0.2 M NaCl, 8-10% PEG3350
|
分辨率 3.03 Å R-free 0.252 |
| 8JPB cryo-EM structure of NTSR1-GRK2-Galpha(q) complexes 1 提交 2023-06-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 G
2–689（688 aa）
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突变：A292P,R295I,S455D | STU STAUROSPORINE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 SRW 2-[{2-(1-fluorocyclopropyl)-4-[4-(2-methoxyphenyl)piperidin-1-yl]quinazolin-6-yl}(methyl)amino]ethan-1-ol × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.07 Å |
| 8JPC cryo-EM structure of NTSR1-GRK2-Galpha(q) complexes 2 提交 2023-06-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 G
2–689（688 aa）
|
突变：A292P,R295I,S455D | SRW 2-[{2-(1-fluorocyclopropyl)-4-[4-(2-methoxyphenyl)piperidin-1-yl]quinazolin-6-yl}(methyl)amino]ethan-1-ol × 1 STU STAUROSPORINE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.07 Å |
| 8JPD Focused refinement structure of GRK2 in NTSR1-GRK2-Galpha(q) complexes 提交 2023-06-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 G
2–689（688 aa）
|
突变：A292P,R295I,S455D | STU STAUROSPORINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.81 Å |