当前蛋白身份：P21784
重新检索
差异标签只比较当前检索结果；所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2JWO A PHD finger motif in the C-terminus of RAG2 modulates recombination activity 提交 2007-10-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
414–487（74 aa）
片段：PHD finger motif: Residues 414-487
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.2；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient
NMR样品组成
0.5 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] RAG2 PHD domain, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2V83 Crystal structure of RAG2-PHD finger in complex with H3K4me3 peptide 提交 2007-08-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
414–487（74 aa）
片段：RESIDUES 414-487
链 B
414–487（74 aa）
片段：RESIDUES 414-487
链 C
414–487（74 aa）
片段：RESIDUES 414-487
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；10% PEG 5000 MONOMETHYL ETHER, 0.1 M BIS-TRIS PH 6.5 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298K.
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.230 |
| 2V85 Crystal structure of RAG2-PHD finger in complex with H3R2me1K4me3 peptide 提交 2007-08-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
414–487（74 aa）
片段：RESIDUES 414-487
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION. HANGING DROP. 20% PEG 3350, 0.2 M POTASSIUM THIOCYANATE
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.197 |
| 2V85 Crystal structure of RAG2-PHD finger in complex with H3R2me1K4me3 peptide 提交 2007-08-02 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
414–487（74 aa）
片段：RESIDUES 414-487
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION. HANGING DROP. 20% PEG 3350, 0.2 M POTASSIUM THIOCYANATE
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.197 |
| 2V86 Crystal structure of RAG2-PHD finger in complex with H3R2me2aK4me3 peptide 提交 2007-08-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
414–487（74 aa）
片段：RESIDUES 414-487
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；VAPOR DIFFUSION. HANGING DROP. 28% PEG 20,000, 0.1M MES PH 6.5, 3% ISOPROPANOL TEMPERATURE 293K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.211 |
| 2V86 Crystal structure of RAG2-PHD finger in complex with H3R2me2aK4me3 peptide 提交 2007-08-02 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
414–487（74 aa）
片段：RESIDUES 414-487
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；VAPOR DIFFUSION. HANGING DROP. 28% PEG 20,000, 0.1M MES PH 6.5, 3% ISOPROPANOL TEMPERATURE 293K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.211 |
| 2V87 Crystal structure of RAG2-PHD finger in complex with H3R2me2sK4me3 peptide 提交 2007-08-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
414–487（74 aa）
片段：RESIDUES 414-487
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；VAPOR DIFFUSION. HANGING DROP. 22% PEG 3350, 120-240 MM OF POTASSIUM FORMATE. TEMPERATURE 293K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.208 |
| 2V87 Crystal structure of RAG2-PHD finger in complex with H3R2me2sK4me3 peptide 提交 2007-08-02 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
414–487（74 aa）
片段：RESIDUES 414-487
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；VAPOR DIFFUSION. HANGING DROP. 22% PEG 3350, 120-240 MM OF POTASSIUM FORMATE. TEMPERATURE 293K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.208 |
| 2V88 Crystal structure of RAG2-PHD finger in complex with H3R2me2sK4me2 peptide 提交 2007-08-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
414–487（74 aa）
片段：RESIDUES 414-487
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；VAPOR DIFFUSION. HANGING DROP. 22% PEG 3350, 120-240 MM POTASSIUM FLUORIDE. TEMPERATURE 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.232 |
| 2V88 Crystal structure of RAG2-PHD finger in complex with H3R2me2sK4me2 peptide 提交 2007-08-03 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
414–487（74 aa）
片段：RESIDUES 414-487
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；VAPOR DIFFUSION. HANGING DROP. 22% PEG 3350, 120-240 MM POTASSIUM FLUORIDE. TEMPERATURE 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.232 |
| 2V89 Crystal structure of RAG2-PHD finger in complex with H3K4me3 peptide at 1.1A resolution 提交 2007-08-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
414–487（74 aa）
片段：RESIDUES 414-487
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；CRYSTALS OF COMPLEX WERE OBTAINED AT 3 MG/ML PROTEIN CONCENTRATION AND 1:1.5 MOLAR RATIO OF PROTEIN TO PEPTIDE USING HANGING DROP AND VAPOR DIFFUSION TECHNIQUE AT 293K. PRECIPITANT SOLUTION: 26% PEG 3350, 0.18M POTASSIUM THIOCYANATE.
|
分辨率 1.10 Å R-free 0.155 |
| 2V89 Crystal structure of RAG2-PHD finger in complex with H3K4me3 peptide at 1.1A resolution 提交 2007-08-03 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
414–487（74 aa）
片段：RESIDUES 414-487
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；CRYSTALS OF COMPLEX WERE OBTAINED AT 3 MG/ML PROTEIN CONCENTRATION AND 1:1.5 MOLAR RATIO OF PROTEIN TO PEPTIDE USING HANGING DROP AND VAPOR DIFFUSION TECHNIQUE AT 293K. PRECIPITANT SOLUTION: 26% PEG 3350, 0.18M POTASSIUM THIOCYANATE.
|
分辨率 1.10 Å R-free 0.155 |
| 4WWX Crystal structure of the core RAG1/2 recombinase 提交 2014-11-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 X
2–350（349 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；100 mM MES (pH 7.1), 10-15% PEG 3350, 200 mM tribasic ammonium citrate (pH 7.0), 100 mM KCl
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.259 |
| 4WWX Crystal structure of the core RAG1/2 recombinase 提交 2014-11-12 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 Y
2–350（349 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；100 mM MES (pH 7.1), 10-15% PEG 3350, 200 mM tribasic ammonium citrate (pH 7.0), 100 mM KCl
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.259 |
| 5ZDZ Hairpin Forming Complex, RAG1/2-Nicked 12RSS/23RSS complex in Ca2+ 提交 2018-02-25 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–387（387 aa）
片段：UNP residues 1-387
|
突变：M1V | CA CALCIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 K POTASSIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；100mM MES (pH 6.8), 15% PEG 3350, 200mM Potassium formate
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.242 |
| 5ZDZ Hairpin Forming Complex, RAG1/2-Nicked 12RSS/23RSS complex in Ca2+ 提交 2018-02-25 | Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：pentameric（5） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–387（387 aa）
片段：UNP residues 1-387
|
突变：M1V | CA CALCIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 K POTASSIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；100mM MES (pH 6.8), 15% PEG 3350, 200mM Potassium formate
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.242 |
| 5ZE0 Hairpin Forming Complex, RAG1/2-Nicked(with Dideoxy) 12RSS/23RSS complex in Mg2+ 提交 2018-02-25 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–387（387 aa）
片段：UNP residues 1-387
|
突变：M1V | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 K POTASSIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；100mM MES (pH 6.8), 15% PEG 3350, 200 mM Potassium formate.
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.234 |
| 5ZE0 Hairpin Forming Complex, RAG1/2-Nicked(with Dideoxy) 12RSS/23RSS complex in Mg2+ 提交 2018-02-25 | Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：pentameric（5） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–387（387 aa）
片段：UNP residues 1-387
|
突变：M1V | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 K POTASSIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；100mM MES (pH 6.8), 15% PEG 3350, 200 mM Potassium formate.
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.234 |
| 5ZE1 Hairpin Forming Complex, RAG1/2-Nicked 12RSS/23RSS complex in 2mM Mn2+ for 10 min at 4'C 提交 2018-02-25 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–387（387 aa）
片段：UNP residues 1-387
|
突变：M1V | ZN ZINC ION × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 K POTASSIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；100mM MES (pH 6.8), 15% PEG 3350, 200mM Potassium formate
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.232 |
| 5ZE1 Hairpin Forming Complex, RAG1/2-Nicked 12RSS/23RSS complex in 2mM Mn2+ for 10 min at 4'C 提交 2018-02-25 | Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：pentameric（5） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–387（387 aa）
片段：UNP residues 1-387
|
突变：M1V | ZN ZINC ION × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2 K POTASSIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；100mM MES (pH 6.8), 15% PEG 3350, 200mM Potassium formate
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.232 |
| 5ZE2 Hairpin Complex, RAG1/2-hairpin 12RSS/23RSS complex in 5mM Mn2+ for 2 min at 4'C 提交 2018-02-25 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–387（387 aa）
片段：UNP residues 1-387
|
突变：M1V | ZN ZINC ION × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 K POTASSIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；100mM MES (pH 6.8), 15% PEG 3350, 200mM Potassium formate
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.237 |
| 5ZE2 Hairpin Complex, RAG1/2-hairpin 12RSS/23RSS complex in 5mM Mn2+ for 2 min at 4'C 提交 2018-02-25 | Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：pentameric（5） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–387（387 aa）
片段：UNP residues 1-387
|
突变：M1V | ZN ZINC ION × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 K POTASSIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；100mM MES (pH 6.8), 15% PEG 3350, 200mM Potassium formate
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.237 |
| 6CG0 Cryo-EM structure of mouse RAG1/2 HFC complex (3.17 A) 提交 2018-02-19 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：undecameric（11） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–520（520 aa）
链 D
1–520（520 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.17 Å |
| 6CIJ Cryo-EM structure of mouse RAG1/2 HFC complex containing partial HMGB1 linker(3.9 A) 提交 2018-02-24 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：undecameric（11） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–520（520 aa）
链 D
1–520（520 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 6CIK Pre-Reaction Complex, RAG1(E962Q)/2-intact/nicked 12/23RSS complex in Mn2+ 提交 2018-02-24 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–359（359 aa）
链 D
1–359（359 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；277 K；12-16% PEG 3350, 200 mM NaNO3, 50 mM HEPES, pH 6.9
|
分辨率 3.15 Å R-free 0.249 |
| 6CIL PRE-REACTION COMPLEX, RAG1(E962Q)/2-INTACT/INTACT 12/23RSS COMPLEX IN MN2+ 提交 2018-02-24 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–359（359 aa）
链 D
1–359（359 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；277 K；18% PEG3350, 200 mM KNO3, 50 mM HEPES pH 6.9
|
分辨率 4.15 Å R-free 0.231 |
| 6CIM Pre-Reaction Complex, RAG1(E962Q)/2-nicked/intact 12/23RSS complex in Mn2+ 提交 2018-02-24 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–359（359 aa）
链 D
1–359（359 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；277 K；18% PEG3350, 200 mM KNO3, 50 mM HEPES pH 6.9
|
分辨率 3.60 Å R-free 0.254 |
| 6OEM Cryo-EM structure of mouse RAG1/2 PRC complex (DNA0) 提交 2019-03-27 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–527（527 aa）
链 D
1–527（527 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 6OEN Cryo-EM structure of mouse RAG1/2 PRC complex (DNA1) 提交 2019-03-27 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–527（527 aa）
链 D
1–527（527 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.30 Å |
| 6OEO Cryo-EM structure of mouse RAG1/2 NFC complex (DNA1) 提交 2019-03-27 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–527（527 aa）
链 D
1–527（527 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.69 Å |
| 6OEP Cryo-EM structure of mouse RAG1/2 12RSS-NFC/23RSS-PRC complex (DNA1) 提交 2019-03-27 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–527（527 aa）
链 D
1–527（527 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 6OEQ Cryo-EM structure of mouse RAG1/2 12RSS-PRC/23RSS-NFC complex (DNA1) 提交 2019-03-27 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–527（527 aa）
链 D
1–527（527 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.30 Å |
| 6OER Cryo-EM structure of mouse RAG1/2 NFC complex (DNA2) 提交 2019-03-27 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–527（527 aa）
链 D
1–527（527 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.29 Å |
| 6OES Cryo-EM structure of mouse RAG1/2 STC complex (without NBD domain) 提交 2019-03-27 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–527（527 aa）
链 D
1–527（527 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.06 Å |
| 6OET Cryo-EM structure of mouse RAG1/2 STC complex 提交 2019-03-27 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–527（527 aa）
链 D
1–527（527 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 6V0V Cryo-EM structure of mouse WT RAG1/2 NFC complex (DNA0) 提交 2019-11-19 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–520（520 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.61 Å |
| 6XNX Structure of RAG1 (R848M/E649V)-RAG2-DNA Strand Transfer Complex (Dynamic-Form) 提交 2020-07-05 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 B
3–361（359 aa）
链 D
3–361（359 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6；20 mM HEPES pH7.6, 0.5 mM TCEP, 5 mM MgCl2 and 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 6XNY Structure of RAG1 (R848M/E649V)-RAG2-DNA Strand Transfer Complex (Paired-Form) 提交 2020-07-05 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 B
3–361（359 aa）
链 D
3–361（359 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6；20 mM HEPES pH7.6, 0.5 mM TCEP, 5 mM MgCl2 and 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 6XNZ Structure of RAG1 (R848M/E649V)-RAG2-DNA Target Capture Complex 提交 2020-07-05 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 B
3–361（359 aa）
链 D
3–361（359 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6；20 mM HEPES pH7.6, 0.5 mM TCEP, 5 mM MgCl2 and 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 9JPU CryoEM structure of mouse RAG SEC-PHD 提交 2024-09-26 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–527（527 aa）
链 D
1–527（527 aa）
链 E
1–527（527 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.25 Å |
| 9JPX CryoEM structure of mouse RAG SEC-0 提交 2024-09-26 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–527（527 aa）
链 D
1–527（527 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.95 Å |
| 9JQN CryoEM structure of mouse RAG SEC-2DNA 提交 2024-09-27 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：dodecameric（12） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–527（527 aa）
链 D
1–527（527 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.03 Å |
| 9JTS CryoEM structure of mouse RAG SEC-1DNA (12RSS side) 提交 2024-10-07 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–527（527 aa）
链 D
1–527（527 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.36 Å |
| 9JTU CryoEM structure of mouse RAG SEC-1DNA (23RSS side) 提交 2024-10-07 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–527（527 aa）
链 D
1–527（527 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.43 Å |