当前蛋白身份：P26744
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3LJ5 Full Length Bacteriophage P22 Portal Protein 提交 2010-01-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
1–725（725 aa）
片段：UNP residues 1-725
链 B
1–725（725 aa）
片段：UNP residues 1-725
链 C
1–725（725 aa）
片段：UNP residues 1-725
链 D
1–725（725 aa）
片段：UNP residues 1-725
链 E
1–725（725 aa）
片段：UNP residues 1-725
链 F
1–725（725 aa）
片段：UNP residues 1-725
链 G
1–725（725 aa）
片段：UNP residues 1-725
链 H
1–725（725 aa）
片段：UNP residues 1-725
链 I
1–725（725 aa）
片段：UNP residues 1-725
链 J
1–725（725 aa）
片段：UNP residues 1-725
链 K
1–725（725 aa）
片段：UNP residues 1-725
链 L
1–725（725 aa）
片段：UNP residues 1-725
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；30% tert-Butanol, 70mM sodium chloride, 2.5% PEG 400, 0.1M sodium acetate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 7.50 Å R-free 0.263 |
| 4V4K Bacteriophage P22 Portal Protein bound to middle Tail Factor GP4. This file contain the second biological assembly 提交 2010-04-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 M
1–602（602 aa）
片段：UNP RESIDUES 1-602
链 N
1–602（602 aa）
片段：UNP RESIDUES 1-602
链 O
1–602（602 aa）
片段：UNP RESIDUES 1-602
链 P
1–602（602 aa）
片段：UNP RESIDUES 1-602
链 Q
1–602（602 aa）
片段：UNP RESIDUES 1-602
链 R
1–602（602 aa）
片段：UNP RESIDUES 1-602
链 S
1–602（602 aa）
片段：UNP RESIDUES 1-602
链 T
1–602（602 aa）
片段：UNP RESIDUES 1-602
链 U
1–602（602 aa）
片段：UNP RESIDUES 1-602
链 V
1–602（602 aa）
片段：UNP RESIDUES 1-602
链 W
1–602（602 aa）
片段：UNP RESIDUES 1-602
链 X
1–602（602 aa）
片段：UNP RESIDUES 1-602
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6；20% PEG 8000, 0.1M (NH4)2HPO4, 0.1M MES, PH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298K
|
分辨率 3.25 Å R-free 0.236 |
| 4V4K Bacteriophage P22 Portal Protein bound to middle Tail Factor GP4. This file contain the second biological assembly 提交 2010-04-19 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
1–602（602 aa）
片段：UNP RESIDUES 1-602
链 B
1–602（602 aa）
片段：UNP RESIDUES 1-602
链 C
1–602（602 aa）
片段：UNP RESIDUES 1-602
链 D
1–602（602 aa）
片段：UNP RESIDUES 1-602
链 E
1–602（602 aa）
片段：UNP RESIDUES 1-602
链 F
1–602（602 aa）
片段：UNP RESIDUES 1-602
链 G
1–602（602 aa）
片段：UNP RESIDUES 1-602
链 H
1–602（602 aa）
片段：UNP RESIDUES 1-602
链 I
1–602（602 aa）
片段：UNP RESIDUES 1-602
链 J
1–602（602 aa）
片段：UNP RESIDUES 1-602
链 K
1–602（602 aa）
片段：UNP RESIDUES 1-602
链 L
1–602（602 aa）
片段：UNP RESIDUES 1-602
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6；20% PEG 8000, 0.1M (NH4)2HPO4, 0.1M MES, PH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298K
|
分辨率 3.25 Å R-free 0.236 |
| 5GAI Probabilistic Structural Models of Mature P22 Bacteriophage Portal, Hub, and Tailspike proteins 提交 2015-12-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric（27） 与蛋白数一致 |
链 A
5–725（721 aa）
链 B
5–725（721 aa）
链 C
5–725（721 aa）
链 D
5–725（721 aa）
链 E
5–725（721 aa）
链 F
5–725（721 aa）
链 G
5–725（721 aa）
链 H
5–725（721 aa）
链 I
5–725（721 aa）
链 J
5–725（721 aa）
链 W
5–725（721 aa）
链 X
5–725（721 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blot for 2 seconds before plunging.
|
分辨率 10.50 Å |
| 5JJ1 Structure of the Immature Procapsid Conformation of P22 Portal Protein 提交 2016-04-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
1–602（602 aa）
片段：UNP residues 1-602
链 B
1–602（602 aa）
片段：UNP residues 1-602
链 C
1–602（602 aa）
片段：UNP residues 1-602
链 D
1–602（602 aa）
片段：UNP residues 1-602
链 E
1–602（602 aa）
片段：UNP residues 1-602
链 F
1–602（602 aa）
片段：UNP residues 1-602
链 G
1–602（602 aa）
片段：UNP residues 1-602
链 H
1–602（602 aa）
片段：UNP residues 1-602
链 I
1–602（602 aa）
片段：UNP residues 1-602
链 J
1–602（602 aa）
片段：UNP residues 1-602
链 K
1–602（602 aa）
片段：UNP residues 1-602
链 L
1–602（602 aa）
片段：UNP residues 1-602
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；5% PEG 8,000, 10 mM Cesium Chloride
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.315 |
| 5JJ3 Refined Structure of the Mature Virion Conformation of P22 Portal Protein 提交 2016-04-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
1–725（725 aa）
链 B
1–725（725 aa）
链 C
1–725（725 aa）
链 D
1–725（725 aa）
链 E
1–725（725 aa）
链 F
1–725（725 aa）
链 G
1–725（725 aa）
链 H
1–725（725 aa）
链 I
1–725（725 aa）
链 J
1–725（725 aa）
链 K
1–725（725 aa）
链 L
1–725（725 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；30% tert-butanol, 70 mM sodium chloride, 2.5% PEG400 in 0.1 M sodium acetate
|
分辨率 7.00 Å R-free 0.260 |
| 8EAO Cryo-EM structure of the in-situ gp1-gp4 complex from bacteriophage P22 提交 2022-08-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 B
6–626（621 aa）
链 D
6–626（621 aa）
链 F
6–626（621 aa）
链 H
6–626（621 aa）
链 J
6–626（621 aa）
链 L
6–626（621 aa）
链 N
6–626（621 aa）
链 P
6–626（621 aa）
链 R
6–626（621 aa）
链 T
6–626（621 aa）
链 V
6–626（621 aa）
链 X
6–626（621 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8TVU In situ cryo-EM structure of bacteriophage P22 portal protein: head-to-tail protein complex at 3.0A resolution 提交 2023-08-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
1–725（725 aa）
链 B
1–725（725 aa）
链 D
1–725（725 aa）
链 F
1–725（725 aa）
链 H
1–725（725 aa）
链 J
1–725（725 aa）
链 L
1–725（725 aa）
链 N
1–725（725 aa）
链 P
1–725（725 aa）
链 R
1–725（725 aa）
链 T
1–725（725 aa）
链 W
1–725（725 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8U10 In situ cryo-EM structure of bacteriophage P22 gp1:gp4:gp5:gp10:gp9 N-term complex in conformation 1 at 3.2A resolution 提交 2023-08-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：58-meric（58） 与蛋白数一致 |
链 a
1–725（725 aa）
链 b
1–725（725 aa）
链 c
1–725（725 aa）
链 d
1–725（725 aa）
链 e
1–725（725 aa）
链 f
1–725（725 aa）
链 g
1–725（725 aa）
链 h
1–725（725 aa）
链 i
1–725（725 aa）
链 j
1–725（725 aa）
链 k
1–725（725 aa）
链 l
1–725（725 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8U11 In situ cryo-EM structure of bacteriophage P22 gp1:gp5:gp4: gp10: gp9 N-term complex in conformation 2 at 3.1A resolution 提交 2023-08-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：58-meric（58） 与蛋白数一致 |
链 a
1–725（725 aa）
链 b
1–725（725 aa）
链 c
1–725（725 aa）
链 d
1–725（725 aa）
链 e
1–725（725 aa）
链 f
1–725（725 aa）
链 g
1–725（725 aa）
链 h
1–725（725 aa）
链 i
1–725（725 aa）
链 j
1–725（725 aa）
链 k
1–725（725 aa）
链 l
1–725（725 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9KYW The scaffold C-loop of phage P22 提交 2024-12-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
1–725（725 aa）
链 L
1–725（725 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.70 Å |
| 9PDP In situ cryoEM structure of bacteriophage P22 portal barrel 提交 2025-06-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
602–710（109 aa）
链 B
602–710（109 aa）
链 C
602–710（109 aa）
链 D
602–710（109 aa）
链 E
602–710（109 aa）
链 F
602–710（109 aa）
链 G
602–710（109 aa）
链 H
602–710（109 aa）
链 I
602–710（109 aa）
链 J
602–710（109 aa）
链 K
602–710（109 aa）
链 L
602–710（109 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.83 Å |
| 9PGG Cryo-EM structure of bacteriophage P22 gp1-gp5-gp4 complex at 2.76 angstrom 提交 2025-07-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：39-meric（39） 与蛋白数一致 |
链 Bb
1–725（725 aa）
链 Bd
1–725（725 aa）
链 Bf
1–725（725 aa）
链 Bh
1–725（725 aa）
链 Bj
1–725（725 aa）
链 Bl
1–725（725 aa）
链 Bn
1–725（725 aa）
链 Bp
1–725（725 aa）
链 Br
1–725（725 aa）
链 Bt
1–725（725 aa）
链 Bv
1–725（725 aa）
链 Bx
1–725（725 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.76 Å |