当前蛋白身份:P26746
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4V4K Bacteriophage P22 Portal Protein bound to middle Tail Factor GP4. This file contain the second biological assembly 提交 2010-04-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 24 PDB 声明:24-meric(24) 与蛋白数一致 |
链 k
1–166(166 aa)
片段:UNP RESIDUES 1-166
链 l
1–166(166 aa)
片段:UNP RESIDUES 1-166
链 m
1–166(166 aa)
片段:UNP RESIDUES 1-166
链 n
1–166(166 aa)
片段:UNP RESIDUES 1-166
链 o
1–166(166 aa)
片段:UNP RESIDUES 1-166
链 p
1–166(166 aa)
片段:UNP RESIDUES 1-166
链 q
1–166(166 aa)
片段:UNP RESIDUES 1-166
链 r
1–166(166 aa)
片段:UNP RESIDUES 1-166
链 s
1–166(166 aa)
片段:UNP RESIDUES 1-166
链 t
1–166(166 aa)
片段:UNP RESIDUES 1-166
链 u
1–166(166 aa)
片段:UNP RESIDUES 1-166
链 v
1–166(166 aa)
片段:UNP RESIDUES 1-166
|
突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6;20% PEG 8000, 0.1M (NH4)2HPO4, 0.1M MES, PH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298K
|
分辨率 3.25 Å R-free 0.236 |
| 4V4K Bacteriophage P22 Portal Protein bound to middle Tail Factor GP4. This file contain the second biological assembly 提交 2010-04-19 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 24 PDB 声明:24-meric(24) 与蛋白数一致 |
链 Y
1–166(166 aa)
片段:UNP RESIDUES 1-166
链 Z
1–166(166 aa)
片段:UNP RESIDUES 1-166
链 a
1–166(166 aa)
片段:UNP RESIDUES 1-166
链 b
1–166(166 aa)
片段:UNP RESIDUES 1-166
链 c
1–166(166 aa)
片段:UNP RESIDUES 1-166
链 d
1–166(166 aa)
片段:UNP RESIDUES 1-166
链 e
1–166(166 aa)
片段:UNP RESIDUES 1-166
链 f
1–166(166 aa)
片段:UNP RESIDUES 1-166
链 g
1–166(166 aa)
片段:UNP RESIDUES 1-166
链 h
1–166(166 aa)
片段:UNP RESIDUES 1-166
链 i
1–166(166 aa)
片段:UNP RESIDUES 1-166
链 j
1–166(166 aa)
片段:UNP RESIDUES 1-166
|
突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6;20% PEG 8000, 0.1M (NH4)2HPO4, 0.1M MES, PH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298K
|
分辨率 3.25 Å R-free 0.236 |
| 5GAI Probabilistic Structural Models of Mature P22 Bacteriophage Portal, Hub, and Tailspike proteins 提交 2015-12-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric(27) 与蛋白数一致 |
链 K
5–150(146 aa)
链 L
5–150(146 aa)
链 M
5–150(146 aa)
链 N
5–150(146 aa)
链 O
5–150(146 aa)
链 P
5–150(146 aa)
链 Q
5–150(146 aa)
链 R
5–150(146 aa)
链 S
5–150(146 aa)
链 T
5–150(146 aa)
链 U
5–150(146 aa)
链 V
5–150(146 aa)
|
突变:P150A 突变:P150A 突变:P150A 突变:P150A 突变:P150A 突变:P150A 突变:P150A 突变:P150A 突变:P150A 突变:P150A 突变:P150A 突变:P150A | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blot for 2 seconds before plunging.
|
分辨率 10.50 Å |
| 8EAO Cryo-EM structure of the in-situ gp1-gp4 complex from bacteriophage P22 提交 2022-08-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 24 PDB 声明:24-meric(24) 与蛋白数一致 |
链 A
3–151(149 aa)
链 C
3–151(149 aa)
链 E
3–151(149 aa)
链 G
3–151(149 aa)
链 I
3–151(149 aa)
链 K
3–151(149 aa)
链 M
3–151(149 aa)
链 O
3–151(149 aa)
链 Q
3–151(149 aa)
链 S
3–151(149 aa)
链 U
3–151(149 aa)
链 W
3–151(149 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8EB7 Cryo-EM structure of the in-situ gp4-gp10-gp9N from bacteriophage P22 提交 2022-08-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 36 PDB 声明:36-meric(36) 与蛋白数一致 |
链 E
2–151(150 aa)
链 G
2–151(150 aa)
链 H
2–151(150 aa)
链 I
2–151(150 aa)
链 J
2–151(150 aa)
链 K
2–151(150 aa)
链 L
2–151(150 aa)
链 M
2–151(150 aa)
链 N
2–151(150 aa)
链 O
2–151(150 aa)
链 P
2–151(150 aa)
链 Q
2–151(150 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 8TVU In situ cryo-EM structure of bacteriophage P22 portal protein: head-to-tail protein complex at 3.0A resolution 提交 2023-08-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 24 PDB 声明:24-meric(24) 与蛋白数一致 |
链 C
1–166(166 aa)
链 E
1–166(166 aa)
链 G
1–166(166 aa)
链 I
1–166(166 aa)
链 K
1–166(166 aa)
链 M
1–166(166 aa)
链 O
1–166(166 aa)
链 Q
1–166(166 aa)
链 S
1–166(166 aa)
链 V
1–166(166 aa)
链 X
1–166(166 aa)
链 a
1–166(166 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8U10 In situ cryo-EM structure of bacteriophage P22 gp1:gp4:gp5:gp10:gp9 N-term complex in conformation 1 at 3.2A resolution 提交 2023-08-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 58 PDB 声明:58-meric(58) 与蛋白数一致 |
链 m
1–166(166 aa)
链 n
1–166(166 aa)
链 o
1–166(166 aa)
链 p
1–166(166 aa)
链 q
1–166(166 aa)
链 r
1–166(166 aa)
链 s
1–166(166 aa)
链 t
1–166(166 aa)
链 u
1–166(166 aa)
链 v
1–166(166 aa)
链 x
1–166(166 aa)
链 y
1–166(166 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8U11 In situ cryo-EM structure of bacteriophage P22 gp1:gp5:gp4: gp10: gp9 N-term complex in conformation 2 at 3.1A resolution 提交 2023-08-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 58 PDB 声明:58-meric(58) 与蛋白数一致 |
链 m
1–166(166 aa)
链 n
1–166(166 aa)
链 o
1–166(166 aa)
链 p
1–166(166 aa)
链 q
1–166(166 aa)
链 r
1–166(166 aa)
链 s
1–166(166 aa)
链 t
1–166(166 aa)
链 u
1–166(166 aa)
链 v
1–166(166 aa)
链 x
1–166(166 aa)
链 y
1–166(166 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9PGG Cryo-EM structure of bacteriophage P22 gp1-gp5-gp4 complex at 2.76 angstrom 提交 2025-07-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 39 PDB 声明:39-meric(39) 与蛋白数一致 |
链 Ap
1–166(166 aa)
链 Aq
1–166(166 aa)
链 Ar
1–166(166 aa)
链 As
1–166(166 aa)
链 At
1–166(166 aa)
链 Au
1–166(166 aa)
链 Av
1–166(166 aa)
链 Aw
1–166(166 aa)
链 Ax
1–166(166 aa)
链 Ay
1–166(166 aa)
链 Az
1–166(166 aa)
链 Ba
1–166(166 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.76 Å |