当前蛋白身份：P32193
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1FJG STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S RIBOSOMAL SUBUNIT IN COMPLEX WITH THE ANTIBIOTICS STREPTOMYCIN, SPECTINOMYCIN, AND PAROMOMYCIN 提交 2000-08-08 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物一致 |
链 V
2–26（25 aa）
|
未记录 | PAR PAROMOMYCIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 96 SCM SPECTINOMYCIN × 1 SRY STREPTOMYCIN × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；MPD, NH4Cl, KCl, CaCl2, magnesium acetate, sodium cacodylate,
streptomycin, paromomycin, spectinomycin, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.255 |
| 1HNW STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S RIBOSOMAL SUBUNIT IN COMPLEX WITH TETRACYCLINE 提交 2000-12-08 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物一致 |
链 V
2–26（25 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 96 TAC TETRACYCLINE × 2 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 277 K. MPD, NH4CL, KCL, CACL2, MAGNESIUM ACETATE, SODIUM CACODYLATE, pH 6.5. 80 mM tetracycline soaked into preformed crystals., pH 6.50
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.264 |
| 1HNX STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S RIBOSOMAL SUBUNIT IN COMPLEX WITH PACTAMYCIN 提交 2000-12-08 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物一致 |
链 V
2–26（25 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 96 PCY Pactamycin × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP AT 277 K. MPD, NH4CL, KCL, CACL2, MAGNESIUM ACETATE,
SODIUM CACODYLATE, pH 6.50. 80 uM Pactamycin soaked into preformed crystals.
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.280 |
| 1HNZ STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S RIBOSOMAL SUBUNIT IN COMPLEX WITH HYGROMYCIN B 提交 2000-12-08 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物一致 |
链 V
2–26（25 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 96 HYG HYGROMYCIN B × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 277 K. MPD, NH4CL, KCL, CACL2, MAGNESIUM ACETATE,
SODIUM CACODYLATE, pH 6.50. 80 uM HYGROMYCIN B soaked into preformed crystals.
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分辨率 3.30 Å R-free 0.261 |
| 1HR0 CRYSTAL STRUCTURE OF INITIATION FACTOR IF1 BOUND TO THE 30S RIBOSOMAL SUBUNIT 提交 2000-12-20 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric（23） 与全部聚合物一致 |
链 V
2–26（25 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 65 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；15% MPD, 25 mM magnesium Acetate, 200 mM KCl, 75 mM NH4Cl, 100 mM K-Cacodylate, pH 6.50. VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 277 K
Initiation factor 1 soaked into pre-formed crystals.
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分辨率 3.20 Å R-free 0.261 |
| 1IBK STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S RIBOSOMAL SUBUNIT IN COMPLEX WITH THE ANTIBIOTIC PAROMOMYCIN 提交 2001-03-28 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物一致 |
链 V
1–26（26 aa）
|
未记录 | PAR PAROMOMYCIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 113 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；MPD, AMMONIUM CHLORIDE, POTASSIUM CHLORIDE, MAGNESIUM ACETATE, SODIUM CACODYLATE,
pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 277K, pH 6.50
|
分辨率 3.31 Å R-free 0.282 |
| 1IBL STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S RIBOSOMAL SUBUNIT IN COMPLEX WITH A MESSENGER RNA FRAGMENT AND COGNATE TRANSFER RNA ANTICODON STEM-LOOP BOUND AT THE A SITE AND WITH THE ANTIBIOTIC PAROMOMYCIN 提交 2001-03-28 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：24-meric（24） 与全部聚合物一致 |
链 V
1–26（26 aa）
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未记录 | PAR PAROMOMYCIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 125 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；MPD, AMMONIUM CHLORIDE, POTASSIUM CHLORIDE, MAGNESIUM ACETATE, SODIUM CACODYLATE,
pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 277K, pH 6.50
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分辨率 3.11 Å R-free 0.275 |
| 1IBM STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S RIBOSOMAL SUBUNIT IN COMPLEX WITH A MESSENGER RNA FRAGMENT AND COGNATE TRANSFER RNA ANTICODON STEM-LOOP BOUND AT THE A SITE 提交 2001-03-28 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：24-meric（24） 与全部聚合物一致 |
链 V
1–26（26 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 120 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；MPD, AMMONIUM CHLORIDE, POTASSIUM CHLORIDE, MAGNESIUM ACETATE, SODIUM CACODYLATE
pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 277K, pH 6.50
|
分辨率 3.31 Å R-free 0.286 |
| 1J5E Structure of the Thermus thermophilus 30S Ribosomal Subunit 提交 2002-04-08 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：21-meric（21） 与全部聚合物一致 |
链 V
1–26（26 aa）
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未记录 | UNX UNKNOWN LIGAND × 188 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；MPD, NH4Cl, KCl, CaCl2, magnesium acetate, sodium cacodylate, pH 6.5,
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 277K
|
分辨率 3.05 Å R-free 0.252 |
| 1JGO The Path of Messenger RNA Through the Ribosome. THIS FILE, 1JGO, CONTAINS THE 30S RIBOSOME SUBUNIT, THREE TRNA, AND MRNA MOLECULES. 50S RIBOSOME SUBUNIT IS IN THE FILE 1GIY 提交 2001-06-26 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric（25） 与全部聚合物一致 |
链 X
1–26（26 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.4；20 mM MgCl2, 100 mM KCl, 20 mM tris HCl, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION
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分辨率 5.60 Å |
| 1JGP The Path of Messenger RNA Through the Ribosome. THIS FILE, 1JGP, CONTAINS THE 30S RIBOSOME SUBUNIT, THREE TRNA, AND MRNA MOLECULES. 50S RIBOSOME SUBUNIT IS IN THE FILE 1GIY 提交 2001-06-26 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric（25） 与全部聚合物一致 |
链 X
1–26（26 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.4；20 mM MgCl2, 100 mM KCl, 20 mM tris HCl, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION
|
分辨率 7.00 Å |
| 1JGQ The Path of Messenger RNA Through the Ribosome. THIS FILE, 1JGQ, CONTAINS THE 30S RIBOSOME SUBUNIT, THREE TRNA, AND MRNA MOLECULES. 50S RIBOSOME SUBUNIT IS IN THE FILE 1GIY 提交 2001-06-26 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric（25） 与全部聚合物一致 |
链 X
1–26（26 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.4；20 mM MgCl2, 100 mM KCl, 20 mM tris HCl, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION
|
分辨率 5.00 Å |
| 1N32 Structure of the Thermus thermophilus 30S ribosomal subunit bound to codon and near-cognate transfer RNA anticodon stem-loop mismatched at the first codon position at the a site with paromomycin 提交 2002-10-25 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric（23） 与全部聚合物一致 |
链 V
1–26（26 aa）
|
未记录 | PAR PAROMOMYCIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 158 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；MPD, NH4Cl, KCl, CaCl2, magnesium acetate, potassium-MES, sodium cacodylate,
PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP AT 277K
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分辨率 3.00 Å R-free 0.270 |
| 1N33 Structure of the Thermus thermophilus 30S ribosomal subunit bound to codon and near-cognate transfer rna anticodon stem-loop mismatched at the second codon position at the a site with paromomycin 提交 2002-10-25 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric（23） 与全部聚合物一致 |
链 V
1–26（26 aa）
|
未记录 | PAR PAROMOMYCIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 106 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；MPD, NH4Cl, KCl, CaCl2, magnesium acetate, potassium-MES, sodium cacodylate,
PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP AT 277K
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分辨率 3.35 Å R-free 0.284 |
| 3OTO Crystal Structure of the 30S ribosomal subunit from a KsgA mutant of Thermus thermophilus (HB8) 提交 2010-09-13 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：21-meric（21） 与全部聚合物一致 |
链 U
1–27（27 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 94 K POTASSIUM ION × 42 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
hanging drop；pH 6.5；277 K；pH 6.5, hanging drop, temperature 277K
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分辨率 3.69 Å R-free 0.231 |
| 4AQY Structure of ribosome-apramycin complexes 提交 2012-04-20 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric（23） 与全部聚合物一致 |
链 V
1–26（26 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 203 K POTASSIUM ION × 15 AM2 APRAMYCIN × 5 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；MPD, NH4CL, KCL, CACL2, MAGNESIUM ACETATE, SODIUM CACODYLATE, PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP AT 277K
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分辨率 3.50 Å R-free 0.235 |
| 4V42 Crystal structure of the ribosome at 5.5 A resolution. 提交 2001-03-30 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：49-meric（49） 与全部聚合物一致 |
链 AX
1–26（26 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 5.50 Å |