当前蛋白身份：P32876
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2XND Crystal structure of bovine F1-c8 sub-complex of ATP Synthase 提交 2010-08-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric（17） 与蛋白数一致 |
链 J
63–134（72 aa）
片段：RESIDUES 63-134
链 K
63–134（72 aa）
片段：RESIDUES 63-134
链 L
63–134（72 aa）
片段：RESIDUES 63-134
链 M
63–134（72 aa）
片段：RESIDUES 63-134
链 N
63–134（72 aa）
片段：RESIDUES 63-134
链 O
63–134（72 aa）
片段：RESIDUES 63-134
链 P
63–134（72 aa）
片段：RESIDUES 63-134
链 Q
63–134（72 aa）
片段：RESIDUES 63-134
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7；CRYSTALS WERE GROWN UNDER OIL BY MIXING EQUAL VOLUMES OF PROTEIN (10MG/ML IN 20MM TRIS PH 8.0, 10% GLYCEROL, 1MM ADP, 1MM AMP-PNP, 2MM MGSO4, 0.02% NAN3, 5.7MM TDM) AND PRECIPITANT SOLUTION (50MM HEPES PH 7.0, 14% PEG4600, 50MM K2HPO4)
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.304 |
| 5ARA Bovine mitochondrial ATP synthase state 1a 提交 2015-09-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric（22） 与蛋白数一致 |
链 J
63–134（72 aa）
片段：UNP RESIDUES 63-134
链 K
63–134（72 aa）
片段：UNP RESIDUES 63-134
链 L
63–134（72 aa）
片段：UNP RESIDUES 63-134
链 M
63–134（72 aa）
片段：UNP RESIDUES 63-134
链 N
63–134（72 aa）
片段：UNP RESIDUES 63-134
链 O
63–134（72 aa）
片段：UNP RESIDUES 63-134
链 P
63–134（72 aa）
片段：UNP RESIDUES 63-134
链 Q
63–134（72 aa）
片段：UNP RESIDUES 63-134
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3；pH 7.2；20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, HUMIDITY- 100, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- BLOT FOR 27 SECONDS BEFORE PLUNGING,
|
分辨率 7.40 Å |
| 5ARE Bovine mitochondrial ATP synthase state 1b 提交 2015-09-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric（22） 与蛋白数一致 |
链 J
63–134（72 aa）
片段：UNP RESIDUES 63-134
链 K
63–134（72 aa）
片段：UNP RESIDUES 63-134
链 L
63–134（72 aa）
片段：UNP RESIDUES 63-134
链 M
63–134（72 aa）
片段：UNP RESIDUES 63-134
链 N
63–134（72 aa）
片段：UNP RESIDUES 63-134
链 O
63–134（72 aa）
片段：UNP RESIDUES 63-134
链 P
63–134（72 aa）
片段：UNP RESIDUES 63-134
链 Q
63–134（72 aa）
片段：UNP RESIDUES 63-134
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3；pH 7.2；20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, HUMIDITY- 100, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- BLOT FOR 27 SECONDS BEFORE PLUNGING,
|
分辨率 6.70 Å |
| 5ARH Bovine mitochondrial ATP synthase state 2a 提交 2015-09-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric（22） 与蛋白数一致 |
链 J
63–134（72 aa）
片段：UNP RESIDUES 63-134
链 K
63–134（72 aa）
片段：UNP RESIDUES 63-134
链 L
63–134（72 aa）
片段：UNP RESIDUES 63-134
链 M
63–134（72 aa）
片段：UNP RESIDUES 63-134
链 N
63–134（72 aa）
片段：UNP RESIDUES 63-134
链 O
63–134（72 aa）
片段：UNP RESIDUES 63-134
链 P
63–134（72 aa）
片段：UNP RESIDUES 63-134
链 Q
63–134（72 aa）
片段：UNP RESIDUES 63-134
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3；pH 7.2；20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, HUMIDITY- 100, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- BLOT FOR 27 SECONDS BEFORE PLUNGING,
|
分辨率 7.20 Å |
| 5ARI Bovine mitochondrial ATP synthase state 2b 提交 2015-09-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric（22） 与蛋白数一致 |
链 J
63–134（72 aa）
片段：UNP RESIDUES 63-134
链 K
63–134（72 aa）
片段：UNP RESIDUES 63-134
链 L
63–134（72 aa）
片段：UNP RESIDUES 63-134
链 M
63–134（72 aa）
片段：UNP RESIDUES 63-134
链 N
63–134（72 aa）
片段：UNP RESIDUES 63-134
链 O
63–134（72 aa）
片段：UNP RESIDUES 63-134
链 P
63–134（72 aa）
片段：UNP RESIDUES 63-134
链 Q
63–134（72 aa）
片段：UNP RESIDUES 63-134
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3；pH 7.2；20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, HUMIDITY- 100, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- BLOT FOR 27 SECONDS BEFORE PLUNGING,
|
分辨率 7.40 Å |
| 5FIJ Bovine mitochondrial ATP synthase state 2c 提交 2015-09-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric（22） 与蛋白数一致 |
链 J
63–134（72 aa）
片段：UNP RESIDUES 63-134
链 K
63–134（72 aa）
片段：UNP RESIDUES 63-134
链 L
63–134（72 aa）
片段：UNP RESIDUES 63-134
链 M
63–134（72 aa）
片段：UNP RESIDUES 63-134
链 N
63–134（72 aa）
片段：UNP RESIDUES 63-134
链 O
63–134（72 aa）
片段：UNP RESIDUES 63-134
链 P
63–134（72 aa）
片段：UNP RESIDUES 63-134
链 Q
63–134（72 aa）
片段：UNP RESIDUES 63-134
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3；pH 7.2；20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, HUMIDITY- 100, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- BLOT FOR 27 SECONDS BEFORE PLUNGING,
|
分辨率 7.40 Å |
| 5FIK Bovine mitochondrial ATP synthase state 3a 提交 2015-09-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric（22） 与蛋白数一致 |
链 J
63–134（72 aa）
片段：UNP RESIDUES 63-134
链 K
63–134（72 aa）
片段：UNP RESIDUES 63-134
链 L
63–134（72 aa）
片段：UNP RESIDUES 63-134
链 M
63–134（72 aa）
片段：UNP RESIDUES 63-134
链 N
63–134（72 aa）
片段：UNP RESIDUES 63-134
链 O
63–134（72 aa）
片段：UNP RESIDUES 63-134
链 P
63–134（72 aa）
片段：UNP RESIDUES 63-134
链 Q
63–134（72 aa）
片段：UNP RESIDUES 63-134
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3；pH 7.2；20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, HUMIDITY- 100, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- BLOT FOR 27 SECONDS BEFORE PLUNGING,
|
分辨率 6.40 Å |
| 5FIL Bovine mitochondrial ATP synthase state 3b 提交 2015-09-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric（22） 与蛋白数一致 |
链 J
63–134（72 aa）
片段：UNP RESIDUES 63-134
链 K
63–134（72 aa）
片段：UNP RESIDUES 63-134
链 L
63–134（72 aa）
片段：UNP RESIDUES 63-134
链 M
63–134（72 aa）
片段：UNP RESIDUES 63-134
链 N
63–134（72 aa）
片段：UNP RESIDUES 63-134
链 O
63–134（72 aa）
片段：UNP RESIDUES 63-134
链 P
63–134（72 aa）
片段：UNP RESIDUES 63-134
链 Q
63–134（72 aa）
片段：UNP RESIDUES 63-134
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) GLYCEROL, 0.05% (WT/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3；pH 7.2；20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) GLYCEROL, 0.05% (WT/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, HUMIDITY- 100, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- BLOT FOR 27 SECONDS BEFORE PLUNGING,
|
分辨率 7.10 Å |
| 6ZBB bovine ATP synthase Fo domain 提交 2020-06-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric（17） 与蛋白数一致 |
链 K
62–136（75 aa）
链 L
62–136（75 aa）
链 M
62–136（75 aa）
链 N
62–136（75 aa）
链 O
62–136（75 aa）
链 P
62–136（75 aa）
链 Q
62–136（75 aa）
链 R
62–136（75 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CDL CARDIOLIPIN × 3 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；The sample was allowed to penetrate through the holey support and to distribute to both sides of the grid surface for ca. 15 sec. Then the grids were blotted with filter paper for 8-10 sec before blotting.
|
分辨率 3.61 Å |
| 6ZIQ bovine ATP synthase stator domain, state 1 提交 2020-06-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric（15） 与蛋白数一致 |
链 M
62–136（75 aa）
链 N
62–136（75 aa）
链 O
62–136（75 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；The sample was allowed to penetrate through the holey support and to distribute to both sides of the grid surface for ca. 15 sec. Then the grids were blotted with filter paper for 8-10 sec before blotting.
|
分辨率 4.33 Å |
| 6ZPO bovine ATP synthase monomer state 1 (combined) 提交 2020-07-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：29-meric（29） 与蛋白数一致 |
链 K
62–136（75 aa）
链 L
62–136（75 aa）
链 M
62–136（75 aa）
链 N
62–136（75 aa）
链 O
62–136（75 aa）
链 P
62–136（75 aa）
链 Q
62–136（75 aa）
链 R
62–136（75 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 CDL CARDIOLIPIN × 3 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；The sample was allowed to penetrate through the holey support and to distribute to both sides of the grid surface for ca. 15 sec. Then the grids were blotted with filter paper for 8-10 sec before blotting.
|
分辨率 4.00 Å |
| 9W2R Cryo-EM structure of FoF1-ATPase monomer state 1 on the bovine heart submitochondrial particles (FoF1-1) 提交 2025-07-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：29-meric（29） 与蛋白数一致 |
链 K
62–136（75 aa）
链 L
62–136（75 aa）
链 M
62–136（75 aa）
链 N
62–136（75 aa）
链 O
62–136（75 aa）
链 P
62–136（75 aa）
链 Q
62–136（75 aa）
链 R
62–136（75 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 9W2S Cryo-EM structure of FoF1-ATPase monomer state 3 on the bovine heart submitochondrial particles (FoF1-2) 提交 2025-07-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：29-meric（29） 与蛋白数一致 |
链 K
62–136（75 aa）
链 L
62–136（75 aa）
链 M
62–136（75 aa）
链 N
62–136（75 aa）
链 O
62–136（75 aa）
链 P
62–136（75 aa）
链 Q
62–136（75 aa）
链 R
62–136（75 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 9W2T Cryo-EM structure of Fo domain of FoF1-ATPase monomer state on the bovine heart submitochondrial particles 提交 2025-07-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric（17） 与蛋白数一致 |
链 K
62–136（75 aa）
链 L
62–136（75 aa）
链 M
62–136（75 aa）
链 N
62–136（75 aa）
链 O
62–136（75 aa）
链 P
62–136（75 aa）
链 Q
62–136（75 aa）
链 R
62–136（75 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |