当前蛋白身份：P33176
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1BG2 HUMAN UBIQUITOUS KINESIN MOTOR DOMAIN 提交 1998-06-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–325（325 aa）
片段：MOTOR DOMAIN
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.6；5 MG/ML PROTEIN, 50 MM NA ACETATE PH 4.6, 75 MM KCL, 3.5% PEG 4K, 2.5 MM ATP, 10 MM MGCL2
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.288 |
| 1MKJ Human Kinesin Motor Domain With Docked Neck Linker 提交 2002-08-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–349（349 aa）
片段：Residues 1-349
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；277 K；1.5-2 M Li2SO4, 25 mM HEPES pH 7.5, 0-50 mM KCl, pH 7.50, temperature 277K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.255 |
| 3J8X High-resolution structure of no-nucleotide kinesin on microtubules 提交 2014-11-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 K
1–349（349 aa）
片段：Truncated catalytic head domain (monomeric, UNP residues 1-349)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
25 mM PIPES, 25 mM NaCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA；pH 6.8；25 mM PIPES, 25 mM NaCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA
cryo-EM玻璃化条件
No glow discharge was applied. After sample application to grid, liquid was mostly 'wicked' away by edgewise application of filter paper. Subsequently, blotting and plunge freezing were performed with ~0.5 second delay after blotting but prior to plunging.；冷冻剂 ETHANE；No glow discharge was applied. After sample application to grid, liquid was mostly 'wicked' away by edgewise application of filter paper. Subsequently, blotting and plunge freezing were performed with ~0.5 second delay after blotting but prior to plunging into liquid ethane.
|
分辨率 5.00 Å |
| 3J8Y High-resolution structure of ATP analog-bound kinesin on microtubules 提交 2014-11-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 K
1–349（349 aa）
片段：Truncated catalytic head domain (monomeric, UNP residues 1-349)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
25 mM PIPES, 25 mM NaCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA；pH 6.8；25 mM PIPES, 25 mM NaCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA
cryo-EM玻璃化条件
No glow discharge was applied. After sample application to grid, liquid was mostly 'wicked' away by edgewise application of filter paper. Subsequently, blotting and plunge freezing were performed with ~0.5 second delay after blotting but prior to plunging.；冷冻剂 ETHANE；No glow discharge was applied. After sample application to grid, liquid was mostly 'wicked' away by edgewise application of filter paper. Subsequently, blotting and plunge freezing were performed with ~0.5 second delay after blotting but prior to plunging into liquid ethane.
|
分辨率 5.00 Å |
| 4HNA Kinesin motor domain in the ADP-MG-ALFX state in complex with tubulin and a DARPIN 提交 2012-10-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 K
1–349（349 aa）
片段：RESIDUES 1-349
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；293 K；PEG, PIPES BUFFER, PH 6.8, 0.8 MM ALCL3, 4 MM NAF, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.19 Å R-free 0.211 |
| 4LNU Nucleotide-free kinesin motor domain in complex with tubulin and a DARPin 提交 2013-07-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 K
1–325（325 aa）
片段：UNP RESIDUES 1-325
|
突变：C7S, C65A, C168A, C174S, C294A | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 11 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；PEG, MES BUFFER, 0.2M AMMONIUM SULFATE, pH 6.50, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.195 |
| 5LT3 nucleotide-free kinesin-1 motor domain T87A mutant, P1 crystal form 提交 2016-09-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–325（325 aa）
|
突变：C7S, C65A, T87A, C168A, C174S, C294A | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；50 mM Mes pH 6.5
0.2M ammonium sulfate
30% mPEG 5000
|
分辨率 2.59 Å R-free 0.263 |
| 5LT3 nucleotide-free kinesin-1 motor domain T87A mutant, P1 crystal form 提交 2016-09-06 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–325（325 aa）
|
突变：C7S, C65A, T87A, C168A, C174S, C294A | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；50 mM Mes pH 6.5
0.2M ammonium sulfate
30% mPEG 5000
|
分辨率 2.59 Å R-free 0.263 |
| 5LT3 nucleotide-free kinesin-1 motor domain T87A mutant, P1 crystal form 提交 2016-09-06 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–325（325 aa）
|
突变：C7S, C65A, T87A, C168A, C174S, C294A | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；50 mM Mes pH 6.5
0.2M ammonium sulfate
30% mPEG 5000
|
分辨率 2.59 Å R-free 0.263 |
| 5LT3 nucleotide-free kinesin-1 motor domain T87A mutant, P1 crystal form 提交 2016-09-06 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1–325（325 aa）
|
突变：C7S, C65A, T87A, C168A, C174S, C294A | SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；50 mM Mes pH 6.5
0.2M ammonium sulfate
30% mPEG 5000
|
分辨率 2.59 Å R-free 0.263 |
| 5LT3 nucleotide-free kinesin-1 motor domain T87A mutant, P1 crystal form 提交 2016-09-06 | Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 E
1–325（325 aa）
|
突变：C7S, C65A, T87A, C168A, C174S, C294A | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；50 mM Mes pH 6.5
0.2M ammonium sulfate
30% mPEG 5000
|
分辨率 2.59 Å R-free 0.263 |
| 5LT3 nucleotide-free kinesin-1 motor domain T87A mutant, P1 crystal form 提交 2016-09-06 | Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 K
1–325（325 aa）
|
突变：C7S, C65A, T87A, C168A, C174S, C294A | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；50 mM Mes pH 6.5
0.2M ammonium sulfate
30% mPEG 5000
|
分辨率 2.59 Å R-free 0.263 |
| 5LT4 nucleotide-free kinesin-1 motor domain T92V mutant, P1 crystal form 提交 2016-09-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–325（325 aa）
|
突变：C7S, C65A, T92V, C168A, C174S, C294A | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；50 mM Mes pH 6.5
0.16 M ammonium sulfate
30% mPEG 5000
|
分辨率 2.88 Å R-free 0.280 |
| 5LT4 nucleotide-free kinesin-1 motor domain T92V mutant, P1 crystal form 提交 2016-09-06 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–325（325 aa）
|
突变：C7S, C65A, T92V, C168A, C174S, C294A | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；50 mM Mes pH 6.5
0.16 M ammonium sulfate
30% mPEG 5000
|
分辨率 2.88 Å R-free 0.280 |
| 5LT4 nucleotide-free kinesin-1 motor domain T92V mutant, P1 crystal form 提交 2016-09-06 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–325（325 aa）
|
突变：C7S, C65A, T92V, C168A, C174S, C294A | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；50 mM Mes pH 6.5
0.16 M ammonium sulfate
30% mPEG 5000
|
分辨率 2.88 Å R-free 0.280 |
| 5LT4 nucleotide-free kinesin-1 motor domain T92V mutant, P1 crystal form 提交 2016-09-06 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1–325（325 aa）
|
突变：C7S, C65A, T92V, C168A, C174S, C294A | SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；50 mM Mes pH 6.5
0.16 M ammonium sulfate
30% mPEG 5000
|
分辨率 2.88 Å R-free 0.280 |
| 5LT4 nucleotide-free kinesin-1 motor domain T92V mutant, P1 crystal form 提交 2016-09-06 | Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 E
1–325（325 aa）
|
突变：C7S, C65A, T92V, C168A, C174S, C294A | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；50 mM Mes pH 6.5
0.16 M ammonium sulfate
30% mPEG 5000
|
分辨率 2.88 Å R-free 0.280 |
| 5LT4 nucleotide-free kinesin-1 motor domain T92V mutant, P1 crystal form 提交 2016-09-06 | Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 K
1–325（325 aa）
|
突变：C7S, C65A, T92V, C168A, C174S, C294A | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；50 mM Mes pH 6.5
0.16 M ammonium sulfate
30% mPEG 5000
|
分辨率 2.88 Å R-free 0.280 |
| 6OJQ Monomeric kinesin-1 motor domain in no-nucleotide state bound to GMPCPP-stabilized microtubule 提交 2019-04-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 K
8–324（317 aa）
|
未记录 | G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.67 Å |
| 7RIK Magic-Angle-Spinning NMR Structure of Kinesin-1 Motor Domain Assembled with Microtubules 提交 2021-07-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–349（349 aa）
片段：Kinesin motor domain residues 1-349
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLID-STATE NMR |
NMR测量条件
pH 7.4；283 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 1
NMR样品组成
9.1 % w/w [U-100% 13C; U-100% 15N] Apo-Kif5b, 16.4 % w/w Porcine-alpha-tubulin, 16.4 % w/w Porcine-beta-tubulin, 5 uM TAXOL, 1 mM GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE, 1 mM GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE, 58.1 % w/w Buffer, 100% H2O | 100% H2O
NMR样品组成
9.1 % w/w [U-100% 13C; U-100% 15N] Apo-Kif5b, 16.4 % w/w Porcine-alpha-tubulin, 16.4 % w/w Porcine-beta-tubulin, 5 uM TAXOL, 1 mM GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE, 1 mM GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE, 58.1 % w/w Buffer, 100% H2O | 100% H2O
NMR样品组成
8.2 % w/w [1,6-13C-glucose; U-100% 15N] Apo-Kif5b, 16.4 % w/w Porcine-alpha-tubulin, 16.4 % w/w Porcine-beta-tubulin, 5 uM TAXOL, 1 mM GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE, 1 mM GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE, 59 % w/w Buffer, 100% H2O | 100% H2O
NMR样品组成
7.6 % w/w [2-13C-glucose; U-100% 15N] Apo-Kif5b, 16.4 % w/w Porcine-alpha-tubulin, 16.4 % w/w Porcine-beta-tubulin, 5 uM TAXOL, 1 mM GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE, 1 mM GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE, 59.6 % w/w Buffer, 100% H2O | 100% H2O
|
分辨率未提供 |
| 7TR1 CaKip3[2-436]-L2-mutant(HsKHC) - AMP-PNP in complex with a microtubule 提交 2022-01-27 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 K
41–44（4 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 7TR2 Apo CaKip3[2-436]-L2-mutant(HsKHC) in complex with a microtubule 提交 2022-01-27 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 K
41–44（4 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8IXA GMPCPP-Alpha1A/Beta2A-microtubule decorated with kinesin non-seam region 提交 2023-03-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric（27） 与蛋白数一致 |
链 S
1–349（349 aa）
链 T
1–349（349 aa）
链 U
1–349（349 aa）
链 V
1–349（349 aa）
链 W
1–349（349 aa）
链 X
1–349（349 aa）
链 Y
1–349（349 aa）
链 Z
1–349（349 aa）
链 a
1–349（349 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 8IXB GMPCPP-Alpha1A/Beta2A-microtubule decorated with kinesin seam region 提交 2023-03-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 g
1–349（349 aa）
链 k
1–349（349 aa）
链 l
1–349（349 aa）
链 m
1–349（349 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 8IXD GMPCPP-Alpha1C/Beta2A-microtubule decorated with kinesin non-seam region 提交 2023-03-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric（27） 与蛋白数一致 |
链 S
1–349（349 aa）
链 T
1–349（349 aa）
链 U
1–349（349 aa）
链 V
1–349（349 aa）
链 W
1–349（349 aa）
链 X
1–349（349 aa）
链 Y
1–349（349 aa）
链 Z
1–349（349 aa）
链 a
1–349（349 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.40 Å |
| 8IXE GMPCPP-Alpha1C/Beta2A-microtubule decorated with kinesin seam region 提交 2023-03-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 h
1–349（349 aa）
链 l
1–349（349 aa）
链 p
1–349（349 aa）
链 q
1–349（349 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.40 Å |
| 8IXF GMPCPP-Alpha4A/Beta2A-microtubule decorated with kinesin non-seam region 提交 2023-03-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric（27） 与蛋白数一致 |
链 S
1–349（349 aa）
链 T
1–349（349 aa）
链 U
1–349（349 aa）
链 V
1–349（349 aa）
链 W
1–349（349 aa）
链 X
1–349（349 aa）
链 Y
1–349（349 aa）
链 Z
1–349（349 aa）
链 a
1–349（349 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.40 Å |
| 8IXG GMPCPP-Alpha4A/Beta2A-microtubule decorated with kinesin seam region 提交 2023-03-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 h
1–349（349 aa）
链 l
1–349（349 aa）
链 p
1–349（349 aa）
链 q
1–349（349 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.40 Å |
| 8RHB Microtubule-associated kinesin-1 tail complex bound to AMPPNP, single-headed state 提交 2023-12-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 K
1–963（963 aa）
链 T
1–963（963 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；BRB80 + 5mM AMPPNP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8RHH Microtubule-associated kinesin-1 tail complex bound to AMPPNP, two-headed state 提交 2023-12-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：pentameric（5） 待复核 |
链 K
1–963（963 aa）
链 L
1–963（963 aa）
链 T
1–963（963 aa）
链 t
1–963（963 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；BRB80 + 5mM AMPPNP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8RIK Microtubule-associated kinesin-1 tail complex bound to ADP, single-headed state 提交 2023-12-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：tetrameric（4） 待复核 |
链 K
1–963（963 aa）
链 T
1–963（963 aa）
链 t
1–963（963 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；BRB80 + 5 mM ADP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 8RIZ Microtubule-associated kinesin-1 tail complex bound to ADP, two-headed state 提交 2023-12-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 K
1–963（963 aa）
链 L
1–963（963 aa）
链 T
1–963（963 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；BRB80 + 5mM ADP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 9GNQ Microtubule-associated Kif5B IAK tail mutant bound to ADP 提交 2024-09-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 K
1–357（357 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；BRB80 + 5mM AMPPNP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 9L6K Crystal structure of nucleotide-free human kinesin-1 motor domain (G234V mutant) 提交 2024-12-24 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–336（335 aa）
|
突变：G234V | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；277 K；20% PEG 3350, 100mM HEPES-NaOH, 200mM ammonium acetate, 3% xylitol
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.258 |
| 9L6K Crystal structure of nucleotide-free human kinesin-1 motor domain (G234V mutant) 提交 2024-12-24 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
2–336（335 aa）
|
突变：G234V | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；277 K；20% PEG 3350, 100mM HEPES-NaOH, 200mM ammonium acetate, 3% xylitol
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.258 |
| 9L78 Crystal structure of nucleotide-free human kinesin-1 motor domain (G234A mutant) 提交 2024-12-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–336（335 aa）
|
突变：G234A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；20 % PEG 3350, 100mM HEPES-NaOH, 200mM ammonium acetate, 3% xylitol, pH 7.9
|
分辨率 2.82 Å R-free 0.265 |
| 9L78 Crystal structure of nucleotide-free human kinesin-1 motor domain (G234A mutant) 提交 2024-12-26 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
2–336（335 aa）
|
突变：G234A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；20 % PEG 3350, 100mM HEPES-NaOH, 200mM ammonium acetate, 3% xylitol, pH 7.9
|
分辨率 2.82 Å R-free 0.265 |
| 9L7E Crystal structure of human kinesin-1 motor domain (G234A mutant) in complex with ADP 提交 2024-12-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–349（349 aa）
|
突变：G234A | MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；23% PEG 3350, 100mM Bis-Tris, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
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分辨率 2.40 Å R-free 0.252 |
| 9L7M Nucleotide-free kinesin-1 motor domain bound to the microtubule 提交 2024-12-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 K
1–349（349 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.48 Å |