当前蛋白身份：P34077
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2QX5 Structure of nucleoporin Nic96 提交 2007-08-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
186–839（654 aa）
片段：residues 186-839
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；289 K；18% PEG 3350, 0.1M Bis Tris propane, 0.2M Potassium Thiocyanate, 1mM Cetyltrimethylammonium bromide, pH 8.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.285 |
| 2QX5 Structure of nucleoporin Nic96 提交 2007-08-10 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
186–839（654 aa）
片段：residues 186-839
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；289 K；18% PEG 3350, 0.1M Bis Tris propane, 0.2M Potassium Thiocyanate, 1mM Cetyltrimethylammonium bromide, pH 8.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.285 |
| 2RFO Crystral Structure of the nucleoporin Nic96 提交 2007-10-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
189–839（651 aa）
片段：UNP residues 189-839
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；3-10% PEG3350, 0.1M BisTris pH6.5, 0.05M lithium sulfate, 3% 1,6-hexandiole, 0.01mM DTE, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.285 |
| 2RFO Crystral Structure of the nucleoporin Nic96 提交 2007-10-01 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
189–839（651 aa）
片段：UNP residues 189-839
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；3-10% PEG3350, 0.1M BisTris pH6.5, 0.05M lithium sulfate, 3% 1,6-hexandiole, 0.01mM DTE, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.285 |
| 6X07 Nic96 from S. cerevisiae bound by VHH-SAN12 提交 2020-05-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
186–839（654 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；8% PEG 8,000 and 0.1M tri-sodium citrate pH 5
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.245 |
| 7N85 Inner ring spoke from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 240 PDB 声明：240-meric（240） 与蛋白数一致 |
链 Q
1–839（839 aa）
链 R
1–839（839 aa）
链 S
1–839（839 aa）
链 T
1–839（839 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.60 Å |
| 7N85 Inner ring spoke from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric（30） 与蛋白数一致 |
链 Q
1–839（839 aa）
链 R
1–839（839 aa）
链 S
1–839（839 aa）
链 T
1–839（839 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.60 Å |
| 7N85 Inner ring spoke from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric（30） 与蛋白数一致 |
链 Q
1–839（839 aa）
链 R
1–839（839 aa）
链 S
1–839（839 aa）
链 T
1–839（839 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.60 Å |
| 7N9F Structure of the in situ yeast NPC 提交 2021-06-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 448 PDB 声明：448-meric（448） 与蛋白数一致 |
链 Q
1–839（839 aa）
链 R
1–839（839 aa）
链 S
1–839（839 aa）
链 T
1–839（839 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich)
|
分辨率 37.00 Å |
| 7N9F Structure of the in situ yeast NPC 提交 2021-06-17 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric（56） 与蛋白数一致 |
链 Q
1–839（839 aa）
链 R
1–839（839 aa）
链 S
1–839（839 aa）
链 T
1–839（839 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich)
|
分辨率 37.00 Å |
| 7N9F Structure of the in situ yeast NPC 提交 2021-06-17 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric（56） 与蛋白数一致 |
链 Q
1–839（839 aa）
链 R
1–839（839 aa）
链 S
1–839（839 aa）
链 T
1–839（839 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich)
|
分辨率 37.00 Å |
| 7WOO Cryo-EM structure of the inner ring protomer of the Saccharomyces cerevisiae nuclear pore complex 提交 2022-01-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
1–839（839 aa）
链 Z
1–839（839 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.71 Å |
| 7WOT Cryo-EM structure of the inner ring monomer of the Saccharomyces cerevisiae nuclear pore complex 提交 2022-01-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
1–839（839 aa）
链 M
1–839（839 aa）
链 N
1–839（839 aa）
链 Z
1–839（839 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.73 Å |
| 8TJ5 Inner spoke ring of the yeast NPC 提交 2023-07-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：46-meric（46） 与蛋白数一致 |
链 Q
1–839（839 aa）
链 R
1–839（839 aa）
链 S
1–839（839 aa）
链 T
1–839（839 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；20mM HEPES,50mM Potassium acetate,20mM NaCl,2mM MgCl2,1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.60 Å |