当前蛋白身份:P35189 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2L7E The structure of a domain from yeast 提交 2010-12-08 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–123(123 aa) 片段:YEATS domain residues 1-123
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)0.12;压力 ambient
NMR样品组成 20 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 20 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
3QRL Crystal Structure of the Taf14 YEATS domain 提交 2011-02-18 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–137(137 aa) 片段:YEATS Domain (UNP Residues 1-137)
未记录 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;298 K;42.5% (v/v) PEG-600, 100 mM Sodium Citrate pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 1.70 Å R-free 0.235
5D7E Crystal structure of Taf14 YEATS domain in complex with H3K9ac 提交 2015-08-13 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–137(137 aa)
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;291 K;0.2 M sodium citrate and 48% PEG600 (v/v)
分辨率 1.90 Å R-free 0.218
5IOK Crystal structure of Taf14 YEATS domain in complex with histone H3K9cr 提交 2016-03-08 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–137(137 aa)
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;44% PEG600 (v/v) and 0.2 M citric acid (pH 6.0)
分辨率 2.22 Å R-free 0.239
5SVA Mediator-RNA Polymerase II Pre-Initiation Complex 提交 2016-08-05 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 38 PDB 声明:40-meric(40) 与全部聚合物一致
链 n 1–244(244 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 15.30 Å
6LQZ Solution structure of Taf14ET-Sth1EBMC 提交 2020-01-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 174–244(71 aa) 片段:Taf14ET
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)100;压力 1
NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Taf14ET, 1.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Sth1EBMC, 20 mM Phosphate buffer, 100 mM sodium chloride, 1 % v/v inhabitor cocktail, 0.04 % sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
6MIN Crystal structure of Taf14 YEATS domain G82A mutant in complex with histone H3K9cr 提交 2018-09-19 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–137(137 aa) 片段:YEATS domain residues 1-137
突变:G82A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;44% PEG600 (v/v) and 0.2 M citric acid (pH 6.0)
分辨率 1.90 Å R-free 0.256
6MIO Crystal structure of Taf14 YEATS domain in complex with histone H3K9pr 提交 2018-09-19 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–137(137 aa) 片段:YEATS domain residues 1-137
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;46% PEG600 (v/v) and 0.2 M citric acid (pH 6.0)
分辨率 1.85 Å R-free 0.232
6MIP Crystal structure of Taf14 YEATS domain G82A mutant 提交 2018-09-19 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–137(137 aa) 片段:YEATS domain residues 1-137
突变:G82A PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;48% PEG600 with 0.2 M sodium citrate (pH 6.0)
分辨率 2.00 Å R-free 0.219
6MIQ Crystal structure of Taf14 YEATS domain in complex with histone H3K9bu 提交 2018-09-19 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–137(137 aa) 片段:YEATS domain residues 1-137
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;44% PEG600 (v/v) and 0.2 M citric acid (pH 6.0)
分辨率 1.75 Å R-free 0.218
7F4A Crystal structure of Taf14 YEATS domain in complex with H3K9bz peptide 提交 2021-06-18 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 2–137(136 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;289 K;48% PEG 600, 0.04M citric acid
分辨率 2.00 Å R-free 0.204
7UHE Taf14 ET domain in complex with C-terminal tail of Taf2 提交 2022-03-26 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 168–243(76 aa) 片段:ET domain
链 C 168–243(76 aa) 片段:ET domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;296 K;2.4 M sodium malonate
分辨率 1.66 Å R-free 0.234
8U77 Crystal structure of Taf14 in complex with Yng1 提交 2023-09-14 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 176–243(68 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;40% PEG 400, 0.1 M Tris pH 8.5, 0.2 M LiSO4
分辨率 1.93 Å R-free 0.221
8U77 Crystal structure of Taf14 in complex with Yng1 提交 2023-09-14 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 176–243(68 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;40% PEG 400, 0.1 M Tris pH 8.5, 0.2 M LiSO4
分辨率 1.93 Å R-free 0.221
8U77 Crystal structure of Taf14 in complex with Yng1 提交 2023-09-14 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 E 176–243(68 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;40% PEG 400, 0.1 M Tris pH 8.5, 0.2 M LiSO4
分辨率 1.93 Å R-free 0.221
8U77 Crystal structure of Taf14 in complex with Yng1 提交 2023-09-14 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 G 176–243(68 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;40% PEG 400, 0.1 M Tris pH 8.5, 0.2 M LiSO4
分辨率 1.93 Å R-free 0.221
9UUO The NuA3 histone acetyltransferase complex 提交 2025-05-07 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 E 1–244(244 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.68 Å
9UUS The NuA3 histone acetyltransferase complex bound to acetyl-CoA and H3 tail 提交 2025-05-08 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 E 1–244(244 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 5 ACO ACETYL COENZYME *A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9VKW Cryo-EM structure of the NuA3 complex bound to Ace-coenzyme A 提交 2025-06-24 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 E 1–244(244 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ACO ACETYL COENZYME *A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.13 Å