当前蛋白身份:P36012 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2L5A Structural basis for recognition of centromere specific histone H3 variant by nonhistone Scm3 提交 2010-10-28 Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 151–228(78 aa) 片段:Cse4(151-228), Scm3(93-172), H4(42-103)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5.4;308 K;离子强度(mmCIF原始值)0.00;压力 ambient
NMR样品组成 0.8-1.0 mM [U-100% 15N] scCSH-1, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.8-0.85 mM [U-100% 15N] scCSH-2, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.8-0.85 mM [U-13C methyl; U-15N; U-2H] scCSH-3, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.8-0.85 mM [U-13C ; U-15N; 35%-2H] scCSH-4, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.8-0.85 mM [U-13C ; U-15N] scCSH-5, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 0.8-0.85 mM scCSH-6, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
6QLD Structure of inner kinetochore CCAN-Cenp-A complex 提交 2019-01-31 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:22-meric(22) 与全部聚合物一致
链 a 137–226(90 aa)
链 e 112–226(115 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.15 Å
6UPH Structure of a Yeast Centromeric Nucleosome at 2.7 Angstrom resolution 提交 2019-10-17 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:decameric(10) 与全部聚合物一致
链 A 1–229(229 aa)
链 E 1–229(229 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8OW0 Cryo-EM structure of CBF1-CCAN bound topologically to a centromeric CENP-A nucleosome 提交 2023-04-26 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 23 PDB 声明:25-meric(25) 与全部聚合物一致
链 a 1–229(229 aa)
链 e 1–229(229 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8OW1 Cryo-EM structure of the yeast Inner kinetochore bound to a CENP-A nucleosome. 提交 2023-04-26 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 40 PDB 声明:42-meric(42) 与全部聚合物一致
链 a 1–229(229 aa)
链 e 1–229(229 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8T0P Structure of Cse4 bound to Ame1 and Okp1 提交 2023-06-01 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 32–49(18 aa) 片段:residues 32-49
未记录 SO4 SULFATE ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;19% PEG 8000, 0.55 M Lithium sulfate
分辨率 1.73 Å R-free 0.236