当前蛋白身份：P36022
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3QMZ Crystal structure of the cytoplasmic dynein heavy chain motor domain 提交 2011-02-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1364–4092（2729 aa）
片段：unp residues 1364-4092
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；277 K；16% PEG3350, 0.1 M sodium citrate, 0.2 M ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K, pH 5.7
|
分辨率 6.00 Å R-free 0.430 |
| 3QMZ Crystal structure of the cytoplasmic dynein heavy chain motor domain 提交 2011-02-07 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1364–4092（2729 aa）
片段：unp residues 1364-4092
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；277 K；16% PEG3350, 0.1 M sodium citrate, 0.2 M ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K, pH 5.7
|
分辨率 6.00 Å R-free 0.430 |
| 4AI6 Dynein Motor Domain - ADP complex 提交 2012-02-08 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1364–3038（1675 aa）
片段：RESIDUES 1-218,1364-3038,3292-4092
链 A
3292–4092（801 aa）
片段：RESIDUES 1-218,1364-3038,3292-4092
链 B
1364–3038（1675 aa）
片段：RESIDUES 1-218,1364-3038,3292-4092
链 B
3292–4092（801 aa）
片段：RESIDUES 1-218,1364-3038,3292-4092
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 SO4 SULFATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.40 Å R-free 0.303 |
| 4AKG Dynein Motor Domain - ATP complex 提交 2012-02-22 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1364–3038（1675 aa）
片段：RESIDUES 1-218,1364-3038,3292-4092
链 A
3292–4092（801 aa）
片段：RESIDUES 1-218,1364-3038,3292-4092
链 B
1364–3038（1675 aa）
片段：RESIDUES 1-218,1364-3038,3292-4092
链 B
3292–4092（801 aa）
片段：RESIDUES 1-218,1364-3038,3292-4092
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.30 Å R-free 0.305 |
| 4AKH Dynein Motor Domain - AMPPNP complex 提交 2012-02-22 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1364–3038（1675 aa）
片段：RESIDUES 1-218,1364-3038,3292-4092
链 A
3292–4092（801 aa）
片段：RESIDUES 1-218,1364-3038,3292-4092
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 SO4 SULFATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.60 Å R-free 0.302 |
| 4AKH Dynein Motor Domain - AMPPNP complex 提交 2012-02-22 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1364–3038（1675 aa）
片段：RESIDUES 1-218,1364-3038,3292-4092
链 B
3292–4092（801 aa）
片段：RESIDUES 1-218,1364-3038,3292-4092
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 SO4 SULFATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.60 Å R-free 0.302 |
| 4AKI Dynein Motor Domain - LuAc derivative 提交 2012-02-22 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1364–3038（1675 aa）
片段：RESIDUES 1-218,1364-3038,3292-4092
链 A
3292–4092（801 aa）
片段：RESIDUES 1-218,1364-3038,3292-4092
链 B
1364–3038（1675 aa）
片段：RESIDUES 1-218,1364-3038,3292-4092
链 B
3292–4092（801 aa）
片段：RESIDUES 1-218,1364-3038,3292-4092
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SO4 SULFATE ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.70 Å R-free 0.289 |
| 4W8F Crystal structure of the dynein motor domain in the AMPPNP-bound state 提交 2014-08-24 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1364–3038（1675 aa）
链 A
3292–4092（801 aa）
|
突变：E1849Q 突变：E1849Q | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；4-10% PEG 3350 and 200-300 mM NaAc
|
分辨率 3.54 Å R-free 0.262 |
| 4W8F Crystal structure of the dynein motor domain in the AMPPNP-bound state 提交 2014-08-24 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1364–3038（1675 aa）
链 B
3292–4092（801 aa）
|
突变：E1849Q 突变：E1849Q | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；4-10% PEG 3350 and 200-300 mM NaAc
|
分辨率 3.54 Å R-free 0.262 |
| 4W8F Crystal structure of the dynein motor domain in the AMPPNP-bound state 提交 2014-08-24 | Assembly 3 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1364–3038（1675 aa）
链 A
3292–4092（801 aa）
链 B
1364–3038（1675 aa）
链 B
3292–4092（801 aa）
|
突变：E1849Q 突变：E1849Q 突变：E1849Q 突变：E1849Q | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；4-10% PEG 3350 and 200-300 mM NaAc
|
分辨率 3.54 Å R-free 0.262 |
| 5AFR N-terminal fragment of dynein heavy chain 提交 2015-01-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–557（557 aa）
片段：N-TERMINAL FRAGMENT OF TAIL DOMAIN, RESIDUES 1-557
链 B
1–557（557 aa）
片段：N-TERMINAL FRAGMENT OF TAIL DOMAIN, RESIDUES 1-557
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 5.00 Å R-free 0.437 |
| 5VH9 Cryo-EM structure of yeast cytoplasmic dynein-1 with Lis1 and ATP 提交 2017-04-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1448–3028（1581 aa）
片段：UNP residues 1448-3028,3298-4092
链 A
3298–4092（795 aa）
片段：UNP residues 1448-3028,3298-4092
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.70 Å |
| 5VLJ Cryo-EM structure of yeast cytoplasmic dynein with Walker B mutation at AAA3 in presence of ATP-VO4 提交 2017-04-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1448–3028（1581 aa）
片段：UNP residues 1448-3028,3298-4092
链 A
3298–4092（795 aa）
片段：UNP residues 1448-3028,3298-4092
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 10.50 Å |
| 6KIO Complex of yeast cytoplasmic dynein MTBD-High and MT without DTT 提交 2019-07-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 M
3095–3224（130 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.94 Å |
| 6KIQ Complex of yeast cytoplasmic dynein MTBD-High and MT with DTT 提交 2019-07-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 M
3095–3224（130 aa）
|
突变：I3101C, V3222C | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；DTT was added to the final concentration of 1 mM.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.62 Å |
| 6KJN The microtubule-binding domains of yeast cytoplasmic dynein in the high affinity state 提交 2019-07-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3095–3232（138 aa）
|
突变：I3101C, V3222C | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）200；压力 1
NMR样品组成
0.75 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Cytoplasmic dynein, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.75 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Cytoplasmic dynein, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 6KJO The microtubule-binding domains of yeast cytoplasmic dynein in the low affinity state 提交 2019-07-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3095–3232（138 aa）
片段：The microtubule-binding domain
|
突变：S3097C, V3222C | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）200；压力 1
NMR样品组成
1.0 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] The microtubule-binding domain of cytoplasmic dynein, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1.0 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] The microtubule-binding domain of cytoplasmic dynein, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 7MI1 X-ray structure of yeast dynein motor domain in the presence of a pyrazolo-pyrimidinone-based compound (compound 20) 提交 2021-04-16 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1364–3038（1675 aa）
链 A
3292–4092（801 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；100 mM Bis-Tris pH 6.9, 200 mM sodium acetate, 12% PEG 3350, and 10 mM TCEP
|
分辨率 4.50 Å R-free 0.320 |
| 7MI3 Signal subtracted reconstruction of AAA2, AAA3, and AAA4 domains of dynein in the presence of a pyrazolo-pyrimidinone-based compound, Model 4 提交 2021-04-16 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1364–3038（1675 aa）
链 A
3292–4092（801 aa）
|
未记录 | ZG7 (8S)-6-(3-bromophenoxy)-2-[1-(4-chlorophenyl)cyclopropyl]-7-hydroxypyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carbonitrile × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 7MI6 Yeast dynein motor domain in the presence of a pyrazolo-pyrimidinone-based compound, Model 1 提交 2021-04-16 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1364–3038（1675 aa）
链 A
3292–4092（801 aa）
|
突变：E1849Q 突变：E1849Q | ZG7 (8S)-6-(3-bromophenoxy)-2-[1-(4-chlorophenyl)cyclopropyl]-7-hydroxypyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carbonitrile × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 7MI8 Signal subtracted reconstruction of AAA5 and AAA6 domains of dynein in the presence of a pyrazolo-pyrimidinone-based compound, Model 5 提交 2021-04-16 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1364–3038（1675 aa）
链 A
3292–4092（801 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 9DI3 CryoEM structures of yeast cytoplasmic dynein in the presence of ATP and Lis1. 提交 2024-09-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1219–4092（2874 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；50 mM TrisHCl [pH 8.0], 150 mM KOAc, 2 mM MgOAc, 1mM EGTA, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 9DIU CryoEM structures of yeast cytoplasmic dynein in the presence of ATP and Lis1. 提交 2024-09-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1219–4092（2874 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；50 mM Tris [pH 8.0], 150 mM KOAc, 2 mM MgOAc, 1mM EGTA, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 9DJ7 CryoEM structures of yeast cytoplasmic dynein in the presence of ATP and Lis1. 提交 2024-09-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1218–4092（2875 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；50 mM TrisHCl [pH 8.0], 150 mM KOAc, 2 mM MgOAc, 1mM EGTA, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 9DJU CryoEM structures of yeast cytoplasmic dynein in the presence of ATP and Lis1. 提交 2024-09-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1219–4092（2874 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；50 mM TrisHCl [pH 8.0], 150 mM KOAc, 2 mM MgOAc, 1mM EGTA, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 9DJY CryoEM structures of yeast cytoplasmic dynein in the presence of ATP and Lis1. 提交 2024-09-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1219–4092（2874 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；50 mM TrisHCl [pH 8.0], 150 mM KOAc, 2 mM MgOAc, 1mM EGTA, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 9DJZ CryoEM structures of yeast cytoplasmic dynein in the presence of ATP and Lis1. 提交 2024-09-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1218–4092（2875 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；50 mM TrisHCl [pH 8.0], 150 mM KOAc, 2 mM MgOAc, 1mM EGTA, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 9DK0 CryoEM structures of yeast cytoplasmic dynein in the presence of ATP and Lis1. 提交 2024-09-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1218–4092（2875 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；50 mM TrisHCl [pH 8.0], 150 mM KOAc, 2 mM MgOAc, 1mM EGTA, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 9DKD CryoEM structures of yeast cytoplasmic dynein in the presence of ATP and Lis1. 提交 2024-09-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1219–4092（2874 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；50 mM TrisHCl [pH 8.0], 150 mM KOAc, 2 mM MgOAc, 1mM EGTA, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 9DKE CryoEM structures of yeast cytoplasmic dynein in the presence of ATP and Lis1. 提交 2024-09-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1219–4092（2874 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；50 mM TrisHCl [pH 8.0], 150 mM KOAc, 2 mM MgOAc, 1mM EGTA, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 9DKH CryoEM structures of yeast cytoplasmic dynein in the presence of ATP and Lis1. 提交 2024-09-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1218–4092（2875 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；50 mM TrisHCl [pH 8.0], 150 mM KOAc, 2 mM MgOAc, 1mM EGTA, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 9DKJ CryoEM structures of yeast cytoplasmic dynein in the presence of ATP and Lis1. 提交 2024-09-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1218–4092（2875 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；50 mM TrisHCl [pH 8.0], 150 mM KOAc, 2 mM MgOAc, 1mM EGTA, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 9DKM CryoEM structures of yeast cytoplasmic dynein in the presence of ATP and Lis1. 提交 2024-09-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1219–4092（2874 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；50 mM Tris [pH 8.0], 150 mM KOAc, 2 mM MgOAc, 1mM EGTA, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 9DKX CryoEM structures of yeast cytoplasmic dynein in the presence of ATP and Lis1. 提交 2024-09-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1219–4092（2874 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 9DLD CryoEM structures of yeast cytoplasmic dynein in the presence of ATP and Lis1. 提交 2024-09-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1219–4092（2874 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 9DLE CryoEM structures of yeast cytoplasmic dynein in the presence of ATP and Lis1. 提交 2024-09-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1219–4092（2874 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；50 mM TrisHCl [pH 8.0], 150 mM KOAc, 2 mM MgOAc, 1mM EGTA, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 9DMW CryoEM structures of yeast cytoplasmic dynein in the presence of ATP and Lis1. 提交 2024-09-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1219–4092（2874 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；50 mM TrisHCl [pH 8.0], 150 mM KOAc, 2 mM MgOAc, 1mM EGTA, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 9DN5 CryoEM structures of yeast cytoplasmic dynein in the presence of ATP and Lis1. 提交 2024-09-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1219–4092（2874 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；50 mM TrisHCl [pH 8.0], 150 mM KOAc, 2 mM MgOAc, 1mM EGTA, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 9DN7 CryoEM structures of yeast cytoplasmic dynein in the presence of ATP and Lis1. 提交 2024-09-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1219–4092（2874 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；50 mM TrisHCl [pH 8.0], 150 mM KOAc, 2 mM MgOAc, 1mM EGTA, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.25 Å |
| 9DNB CryoEM structures of yeast cytoplasmic dynein in the presence of ATP and Lis1. 提交 2024-09-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1219–4092（2874 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；50 mM TrisHCl [pH 8.0], 150 mM KOAc, 2 mM MgOAc, 1mM EGTA, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 9MFV Motor domain with Apo AAA1 and ADP AAA3 from yeast full-length dynein-1 in 0.1 mM ATP condition 提交 2024-12-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–4092（4092 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 9MFW Motor domain with ADP AAA1 and ADP AAA3 from yeast full-length dynein-1 in 0.1 mM ATP condition 提交 2024-12-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–4092（4092 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 9MFX Motor domain alone with Apo AAA1 and ADP AAA3 from yeast full-length dynein-1 and Pac1 in 0.1 mM ATP condition 提交 2024-12-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–4092（4092 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 9MFY Motor domain-Pac1 complex with ADP AAA1 and Apo AAA3 from yeast full-length dynein-1 and Pac1 in 0.1 mM ATP condition 提交 2024-12-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–4092（4092 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |