当前蛋白身份：P38501
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1AQ8 STRUCTURE OF ALCALIGENES FAECALIS NITRITE REDUCTASE REDUCED WITH ASCORBATE 提交 1997-08-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
34–376（343 aa）
链 B
34–376（343 aa）
链 C
34–376（343 aa）
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.5；10% PEG4000, 0.1 SODIUM ACETATE PH 4.5
|
分辨率 2.00 Å |
| 1AS6 STRUCTURE OF NITRITE BOUND TO OXIDIZED ALCALIGENES FAECALIS NITRITE REDUCTASE AT CRYO TEMPERATURE 提交 1997-08-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
34–376（343 aa）
链 B
34–376（343 aa）
链 C
34–376（343 aa）
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 6 NO2 NITRITE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.5；10% PEG4000, 0.1 SODIUM ACETATE PH 4.5
|
分辨率 1.80 Å |
| 1AS7 STRUCTURE OF ALCALIGENES FAECALIS NITRITE REDUCTASE AT CRYO TEMPERATURE 提交 1997-08-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
34–376（343 aa）
链 B
34–376（343 aa）
链 C
34–376（343 aa）
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.5；10% PEG4000, 0.1 SODIUM ACETATE PH 4.5
|
分辨率 2.00 Å |
| 1AS8 STRUCTURE OF NITRITE BOUND TO REDUCED ALCALIGENES FAECALIS NITRITE REDUCTASE AT CRYO TEMPERATURE 提交 1997-08-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
34–376（343 aa）
链 B
34–376（343 aa）
链 C
34–376（343 aa）
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 6 NO2 NITRITE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.5；10% PEG4000, 0.1 SODIUM ACETATE PH 4.5
|
分辨率 1.85 Å |
| 1ET5 CRYSTAL STRUCTURE OF NITRITE REDUCTASE ASP98ASN MUTANT FROM ALCALIGENES FAECALIS S-6 提交 2000-04-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
40–376（337 aa）
片段：40 - 376
|
突变：D98N | CU COPPER (II) ION × 6 ZN ZINC ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.7；298 K；sodium cacodylate, zinc acetate, PEG 4000, pH 4.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.214 |
| 1ET7 CRYSTAL STRUCTURE OF NITRITE REDUCTASE HIS255ASP MUTANT FROM ALCALIGENES FAECALIS S-6 提交 2000-04-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
40–376（337 aa）
片段：40 - 376
|
突变：H255D | CU COPPER (II) ION × 6 CD CADMIUM ION × 9 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.7；298 K；PEG 6000 sodium cacodylate, cadmium acetate, pH 4.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.210 |
| 1ET8 CRYSTAL STRUCTURE OF NITRITE REDUCTASE HIS255ASN MUTANT FROM ALCALIGENES FAECALIS 提交 2000-04-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
40–376（337 aa）
片段：40 - 376
|
突变：H255N | CU COPPER (II) ION × 6 ZN ZINC ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.7；298 K；PEG 8000, sodium cacodylate, zinc acetate, pH 4.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.212 |
| 1J9Q Crystal structure of nitrite soaked oxidized D98N AFNIR 提交 2001-05-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
40–376（337 aa）
片段：Residues 40-376
链 B
40–376（337 aa）
片段：Residues 40-376
链 C
40–376（337 aa）
片段：Residues 40-376
|
突变：D98N 突变：D98N 突变：D98N | CU COPPER (II) ION × 6 NO2 NITRITE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；PEG 6000, sodium acetate, sodium nitrite, copper chloride, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.210 |
| 1J9R Crystal structure of nitrite soaked reduced D98N AFNIR 提交 2001-05-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
40–376（337 aa）
片段：RESIDUES 40-376
链 B
40–376（337 aa）
片段：RESIDUES 40-376
链 C
40–376（337 aa）
片段：RESIDUES 40-376
|
突变：D98N 突变：D98N 突变：D98N | CU COPPER (II) ION × 9 NO2 NITRITE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；PEG 6000, sodium acetate, sodium nitrite, copper chloride, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.225 |
| 1J9S Crystal structure of nitrite soaked oxidized H255N AFNIR 提交 2001-05-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
40–376（337 aa）
片段：RESIDUES 40-376
链 B
40–376（337 aa）
片段：RESIDUES 40-376
链 C
40–376（337 aa）
片段：RESIDUES 40-376
|
突变：H255N 突变：H255N 突变：H255N | CU COPPER (II) ION × 6 NO2 NITRITE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；PEG 6000, sodium acetate, copper chloride, sodium nitrite, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.204 |
| 1J9T Crystal structure of nitrite soaked reduced H255N AFNIR 提交 2001-05-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
40–376（337 aa）
片段：RESIDUES 40-376
链 B
40–376（337 aa）
片段：RESIDUES 40-376
链 C
40–376（337 aa）
片段：RESIDUES 40-376
|
突变：H255N 突变：H255N 突变：H255N | CU COPPER (II) ION × 9 NO2 NITRITE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；PEG 6000, sodium acetate, sodium nitrite, copper chloride, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.218 |
| 1L9O CRYSTAL STRUCTURE OF NITRITE SOAKED I257A VARIANT OF THE COPPER-CONTAINING NITRITE REDUCTASE FROM ALCALIGENES FAECALIS 提交 2002-03-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
40–376（337 aa）
片段：RESIDUES 40-376
链 B
40–376（337 aa）
片段：RESIDUES 40-376
链 C
40–376（337 aa）
片段：RESIDUES 40-376
|
突变：I257A 突变：I257A 突变：I257A | CU COPPER (II) ION × 6 NO2 NITRITE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；298 K；sodium acetate peg 4000, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.192 |
| 1L9P CRYSTAL STRUCTURE OF NITRITE SOAKED I257G VARIANT OF THE COPPER-CONTAINING NITRITE REDUCTASE FROM ALCALIGENES FAECALIES S-6 提交 2002-03-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
40–376（337 aa）
片段：RESIDUES 40-376
链 B
40–376（337 aa）
片段：RESIDUES 40-376
链 C
40–376（337 aa）
片段：RESIDUES 40-376
|
突变：I257G 突变：I257G 突变：I257G | CU COPPER (II) ION × 6 NO2 NITRITE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；298 K；acetate peg 4000, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.194 |
| 1L9Q CRYSTAL STRUCTURE OF THE I257L VARIANT OF THE COPPER-CONTAINING NITRITE REDUCTASE FROM ALCALIGENES FAECALIS S-6 提交 2002-03-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
40–376（337 aa）
片段：RESIDUES 40-376
链 B
40–376（337 aa）
片段：RESIDUES 40-376
链 C
40–376（337 aa）
片段：RESIDUES 40-376
|
突变：I257L 突变：I257L 突变：I257L | CU COPPER (II) ION × 6 NO2 NITRITE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；298 K；acetate peg 4000, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.188 |
| 1L9R CRYSTAL STRUCTURE OF THE I257M VARIANT OF THE COPPER-CONTAINING NITRITE REDUCTASE FROM ALCALIGENES FAECALIS S-6 提交 2002-03-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
40–376（337 aa）
片段：RESIDUES 40-376
链 B
40–376（337 aa）
片段：RESIDUES 40-376
链 C
40–376（337 aa）
片段：RESIDUES 40-376
|
突变：I257M 突变：I257M 突变：I257M | CU COPPER (II) ION × 6 NO2 NITRITE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；298 K；acetate peg 4000, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.78 Å R-free 0.197 |
| 1L9S CRYSTAL STRUCTURE OF THE I257T VARIANT OF THE COPPER-CONTAINING NITRITE REDUCTASE FROM ALCALIGENES FAECALIS S-6 提交 2002-03-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
40–376（337 aa）
片段：RESIDUES 40-376
链 B
40–376（337 aa）
片段：RESIDUES 40-376
链 C
40–376（337 aa）
片段：RESIDUES 40-376
|
突变：I257T 突变：I257T 突变：I257T | CU COPPER (II) ION × 6 NO2 NITRITE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；298 K；acetate peg 4000, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.78 Å R-free 0.197 |
| 1L9T CRYSTAL STRUCTURE OF THE I257V VARIANT OF THE COPPER-CONTAINING NITRITE REDUCTASE FROM ALCALIGENES FAECALIS S-6 提交 2002-03-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
40–376（337 aa）
片段：RESIDUES 40-376
链 B
40–376（337 aa）
片段：RESIDUES 40-376
链 C
40–376（337 aa）
片段：RESIDUES 40-376
|
突变：I257V 突变：I257V 突变：I257V | CU COPPER (II) ION × 6 NO2 NITRITE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；298 K；acetate peg 4000, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.208 |
| 1NPJ Crystal structure of H145A mutant of nitrite reductase from Alcaligenes faecalis 提交 2003-01-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
34–376（343 aa）
链 B
34–376（343 aa）
链 C
34–376（343 aa）
|
突变：H145A 突变：H145A 突变：H145A | CU COPPER (II) ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；300 K；PEG 8000, sodium acetate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.225 |
| 1NPN Crystal structure of a copper reconstituted H145A mutant of nitrite reductase from Alcaligenes faecalis 提交 2003-01-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
34–376（343 aa）
链 B
34–376（343 aa）
链 C
34–376（343 aa）
|
突变：H145A 突变：H145A 突变：H145A | CU COPPER (II) ION × 6 CL CHLORIDE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；300 K；PEG 8000, sodium acetate , pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.195 |
| 1NTD STRUCTURE OF ALCALIGENES FAECALIS NITRITE REDUCTASE MUTANT M150E THAT CONTAINS ZINC 提交 1995-07-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
34–376（343 aa）
|
突变：M150E | CU COPPER (II) ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.30 Å R-free 0.232 |
| 1SJM Nitrite bound copper containing nitrite reductase 提交 2004-03-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
40–376（337 aa）
链 B
40–376（337 aa）
链 C
40–376（337 aa）
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 6 NO2 NITRITE ION × 3 ACT ACETATE ION × 5 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；298 K；PEG 4000, sodium acetate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 321K
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.138 |
| 1SNR Nitric oxide bound to Cu nitrite reductase 提交 2004-03-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
40–376（337 aa）
链 B
40–376（337 aa）
链 C
40–376（337 aa）
|
未记录 | CU1 COPPER (I) ION × 3 CU COPPER (II) ION × 3 ACT ACETATE ION × 8 NO NITRIC OXIDE × 3 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；291 K；PEG4000, sodium acetate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K, pH 4.0
|
分辨率 1.31 Å R-free 0.141 |
| 1ZDQ Crystal Structure of Met150Gly AfNiR with Methylsulfanyl Methane Bound 提交 2005-04-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
40–375（336 aa）
链 B
40–375（336 aa）
链 C
40–375（336 aa）
|
突变：M150G 突变：M150G 突变：M150G | CU COPPER (II) ION × 6 MSM (METHYLSULFANYL)METHANE × 3 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.80 Å R-free 0.199 |
| 1ZDS Crystal Structure of Met150Gly AfNiR with Acetamide Bound 提交 2005-04-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
40–375（336 aa）
链 B
40–375（336 aa）
链 C
40–375（336 aa）
|
突变：M150G 突变：M150G 突变：M150G | CU COPPER (II) ION × 6 ACM ACETAMIDE × 6 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.55 Å R-free 0.214 |
| 2AFN STRUCTURE OF ALCALIGENES FAECALIS NITRITE REDUCTASE AND A COPPER SITE MUTANT, M150E, THAT CONTAINS ZINC 提交 1995-07-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
34–376（343 aa）
链 B
34–376（343 aa）
链 C
34–376（343 aa）
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.00 Å R-free 0.223 |
| 2B08 Reduced acetamide-bound M150G Nitrite Reductase from Alcaligenes faecalis 提交 2005-09-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
37–376（340 aa）
链 B
37–376（340 aa）
链 C
37–376（340 aa）
|
突变：M150G 突变：M150G 突变：M150G | CU1 COPPER (I) ION × 9 ACM ACETAMIDE × 4 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.90 Å R-free 0.220 |
| 2E86 Azide bound to copper containing nitrite reductase from A. faecalis S-6 提交 2007-01-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
40–376（337 aa）
片段：residues 4-340
链 B
40–376（337 aa）
片段：residues 4-340
链 C
40–376（337 aa）
片段：residues 4-340
|
未记录 | CU1 COPPER (I) ION × 3 CU COPPER (II) ION × 3 ACT ACETATE ION × 10 AZI AZIDE ION × 3 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；298 K；6-8 % PEG 4000, 0.1M sodium acetate buffer pH 4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.179 |
| 2FJS Crystal Structure of Anaerobically Reduced Wild Type Nitrite Reductase from A. faecalis 提交 2006-01-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
40–376（337 aa）
链 B
40–376（337 aa）
链 C
40–376（337 aa）
|
未记录 | CU1 COPPER (I) ION × 3 CU COPPER (II) ION × 3 ACT ACETATE ION × 10 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；298 K；8-10% PEG 4000, 0.1 M NaOAC, pH 4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.180 |
| 2P80 Solution structure of the complex between nitrite reductase and pseudoazurin from A. faecalis 提交 2007-03-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
40–376（337 aa）
链 B
40–376（337 aa）
链 C
40–376（337 aa）
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 7 GD GADOLINIUM ATOM × 9 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM phosphate；压力 1
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM phosphate；压力 1
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM phosphate；压力 1
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM phosphate；压力 1
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM phosphate；压力 1
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM phosphate；压力 1
NMR样品组成
250 mM 15N, 2H pseudoazurin in complex with nitrite reductase -bound GdCLaNP at position 221/223 (0.38 eq), in 50 mM phosphate buffer, H2O, 6% (v/v) D2O | H2O, 6% (v/v) D2O
NMR样品组成
250 mM 15N, 2H pseudoazurin in complex with nitrite reductase -bound YCLaNP at position 221/223 (0.38 eq), in 50 mM phosphate buffer, H2O, 6% (v/v) D2O | H2O, 6% (v/v) D2O
NMR样品组成
250 mM 15N, 2H pseudoazurin in complex with nitrite reductase -bound GdCLaNP at position 234/236 (0.32 eq), in 50 mM phosphate buffer, H2O, 6% (v/v) D2O | H2O, 6% (v/v) D2O
NMR样品组成
250 mM 15N, 2H pseudoazurin in complex with nitrite reductase -bound YCLaNP at position 234/236 (0.32 eq), in 50 mM phosphate buffer, H2O, 6% (v/v) D2O | H2O, 6% (v/v) D2O
NMR样品组成
250 mM 15N, 2H pseudoazurin in complex with nitrite reductase -bound GdCLaNP at position 333/336 (0.53 eq), in 50 mM phosphate buffer, H2O, 6% (v/v) D2O | H2O, 6% (v/v) D2O
NMR样品组成
250 mM 15N, 2H pseudoazurin in complex with nitrite reductase -bound YCLaNP at position 333/336 (0.53 eq), in 50 mM phosphate buffer, H2O, 6% (v/v) D2O | H2O, 6% (v/v) D2O
|
分辨率未提供 |
| 2PP7 Crystal structure of anaerobically manipulated wild type oxidized AfNiR (acetate bound) 提交 2007-04-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
40–376（337 aa）
链 B
40–376（337 aa）
链 C
40–376（337 aa）
|
未记录 | CU1 COPPER (I) ION × 3 CU COPPER (II) ION × 3 ACT ACETATE ION × 13 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；298 K；6-11% PEG 4000, 100mM sodium acetate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.180 |
| 2PP8 Formate bound to oxidized wild type AfNiR 提交 2007-04-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
40–376（337 aa）
链 B
40–376（337 aa）
链 C
40–376（337 aa）
|
未记录 | CU1 COPPER (I) ION × 3 CU COPPER (II) ION × 3 ACT ACETATE ION × 8 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 FMT FORMIC ACID × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；298 K；6-11% PEG 4000, 100mM sodium acetate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.201 |
| 2PP9 Nitrate bound wild type oxidized AfNiR 提交 2007-04-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
40–376（337 aa）
链 B
40–376（337 aa）
链 C
40–376（337 aa）
|
未记录 | CU1 COPPER (I) ION × 3 CU COPPER (II) ION × 3 NO3 NITRATE ION × 3 ACT ACETATE ION × 8 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；298 K；6-11% PEG 4000, 100mM sodium acetate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.195 |
| 2PPA Anaerobically manipulated wild type oxidized AfNiR bound to nitrous oxide 提交 2007-04-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
40–376（337 aa）
链 B
40–376（337 aa）
链 C
40–376（337 aa）
|
未记录 | CU1 COPPER (I) ION × 3 CU COPPER (II) ION × 3 ACT ACETATE ION × 10 N2O NITROUS OXIDE × 2 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；298 K；6-11% PEG 4000, 100mM sodium acetate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.224 |
| 2PPC Oxidized wild type AfNiR exposed to NO (nitrite bound) 提交 2007-04-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
40–376（337 aa）
链 B
40–376（337 aa）
链 C
40–376（337 aa）
|
未记录 | CU1 COPPER (I) ION × 3 CU COPPER (II) ION × 3 NO2 NITRITE ION × 3 ACT ACETATE ION × 10 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；298 K；6-11% PEG 4000, 100mM sodium acetate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.58 Å R-free 0.182 |
| 2PPD Oxidized H145A mutant of AfNiR bound to nitric oxide 提交 2007-04-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
34–376（343 aa）
链 B
34–376（343 aa）
链 C
34–376（343 aa）
|
突变：H145A 突变：H145A 突变：H145A | CU1 COPPER (I) ION × 3 CU COPPER (II) ION × 3 NO NITRIC OXIDE × 2 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；298 K；6-11% polyethylene glycol 6000, 0.1 M ammonium sulfate and 0.01 M sodium acetate buffer, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.212 |
| 2PPE Reduced H145A mutant of AfNiR exposed to NO 提交 2007-04-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
34–376（343 aa）
链 B
34–376（343 aa）
链 C
34–376（343 aa）
|
突变：H145A 突变：H145A 突变：H145A | CU1 COPPER (I) ION × 3 CU COPPER (II) ION × 3 ACT ACETATE ION × 2 NO NITRIC OXIDE × 1 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；298 K；6-11% polyethylene glycol 6000, 0.1 M ammonium sulfate and 0.01 M sodium acetate buffer, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.196 |
| 2PPF Reduced mutant D98N of AfNiR exposed to nitric oxide 提交 2007-04-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
40–376（337 aa）
链 B
40–376（337 aa）
链 C
40–376（337 aa）
|
突变：D98N 突变：D98N 突变：D98N | CU1 COPPER (I) ION × 5 CU COPPER (II) ION × 3 ACT ACETATE ION × 8 NO NITRIC OXIDE × 4 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；298 K；7-12% polyethylene glycol 4000, 75 mM acetamide and 10 mM sodium acetate buffer, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.170 |
| 3H4F Met62Leu variant of nitrite reductase from Alcaligenes faeclis 提交 2009-04-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
40–375（336 aa）
链 B
40–375（336 aa）
链 C
40–375（336 aa）
|
突变：Met62Leu 突变：Met62Leu 突变：Met62Leu | CU COPPER (II) ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；298 K；pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.227 |
| 3H4H Met94Thr/Phe312Cys variant of nitrite reductase from Alcaligenes faecalis 提交 2009-04-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
41–375（335 aa）
链 B
41–375（335 aa）
链 C
41–375（335 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CU COPPER (II) ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；298 K；pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.226 |
| 3H56 Met150Leu/Phe312Cys variant of nitrite reductase from Alcaligenes faecalis 提交 2009-04-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
40–375（336 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CU COPPER (II) ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；298 K；pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.204 |
| 4YSC Completely oxidized structure of copper nitrite reductase from Alcaligenes faecalis 提交 2015-03-17 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
40–376（337 aa）
片段：UNP residues 40-376
链 B
40–376（337 aa）
片段：UNP residues 40-376
链 C
40–376（337 aa）
片段：UNP residues 40-376
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 6 CL CHLORIDE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
BATCH MODE；293 K；100 mM sodium acetate pH 4.0, 10% PEG 4000
|
分辨率 2.03 Å R-free 0.203 |
| 4YSE High resolution synchrotron structure of copper nitrite reductase from Alcaligenes faecalis 提交 2015-03-17 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
40–376（337 aa）
片段：UNP residues 40-376
链 B
40–376（337 aa）
片段：UNP residues 40-376
链 C
40–376（337 aa）
片段：UNP residues 40-376
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 6 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 6 ACY ACETIC ACID × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；100mM sodium acetate, pH 4, 8% PEG4000
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.168 |
| 5D4H High-resolution nitrite complex of a copper nitrite reductase determined by synchrotron radiation crystallography 提交 2015-08-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
40–376（337 aa）
片段：UNP residue 40-376
链 B
40–376（337 aa）
片段：UNP residue 40-376
链 C
40–376（337 aa）
片段：UNP residue 40-376
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 6 NO2 NITRITE ION × 3 GOL GLYCEROL × 22 ACY ACETIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.1；293 K；100mM sodium acetate (pH 4.1) and 7% PEG 4000
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.165 |
| 5D4I Intact nitrite complex of a copper nitrite reductase determined by serial femtosecond crystallography 提交 2015-08-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
40–376（337 aa）
片段：UNP residues 40-376
链 B
40–376（337 aa）
片段：UNP residues 40-376
链 C
40–376（337 aa）
片段：UNP residues 40-376
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 6 NO2 NITRITE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
BATCH MODE；pH 4；293 K；100mM sodium acetate (pH 4.0) and 12% PEG 4000
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.196 |
| 5D4J Chloride-bound form of a copper nitrite reductase from Alcaligenes faecals 提交 2015-08-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
40–376（337 aa）
片段：UNP residues 40-376
链 B
40–376（337 aa）
片段：UNP residues 40-376
链 C
40–376（337 aa）
片段：UNP residues 40-376
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 6 CL CHLORIDE ION × 3 GOL GLYCEROL × 10 ACY ACETIC ACID × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.1；293 K；1:1 mixture of the purified protein solution (40 mg/ml) and a reservoir solution composed of 100 mM sodium acetate (pH 4.1) and 7% PEG 4000
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.232 |
| 5F7A Nitrite complex structure of copper nitrite reductase from Alcaligenes faecalis determined at 293 K 提交 2015-12-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
40–376（337 aa）
链 B
40–376（337 aa）
链 C
40–376（337 aa）
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 6 NO2 NITRITE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.1；293 K；100 mM sodium acetate, 7% PEG 4000
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.180 |
| 5F7B Resting state structure of CuNiR form Alcaligenes faecalis determined at 293 K 提交 2015-12-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
40–376（337 aa）
链 B
40–376（337 aa）
链 C
40–376（337 aa）
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.1；293 K；100 mM sodium acetate, 7% PEG 4000
|
分辨率 1.56 Å R-free 0.177 |