当前蛋白身份：P39075
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1BOW MULTIDRUG-BINDING DOMAIN OF TRANSCRIPTION ACTIVATOR BMRR (APO FORM) 提交 1998-08-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
121–279（159 aa）
片段：MULTIDRUG-BINDING DOMAIN
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；pH 8.5
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.270 |
| 1EXI CRYSTAL STRUCTURE OF TRANSCRIPTION ACTIVATOR BMRR, FROM B. SUBTILIS, BOUND TO 21 BASE PAIR BMR OPERATOR AND TPSB 提交 2000-05-02 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–278（278 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 118 TETRAPHENYLANTIMONIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；1 M imidazole, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 3.12 Å R-free 0.317 |
| 1EXJ CRYSTAL STRUCTURE OF TRANSCRIPTION ACTIVATOR BMRR, FROM B. SUBTILIS, BOUND TO 21 BASE PAIR BMR OPERATOR AND TPP 提交 2000-05-02 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–278（278 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 P4P TETRAPHENYLPHOSPHONIUM × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1 M imidazole, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.315 |
| 1R8E Crystal Structure of BmrR Bound to DNA at 2.4A Resolution 提交 2003-10-23 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–278（278 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 10 P4P TETRAPHENYLPHOSPHONIUM × 2 IMD IMIDAZOLE × 22 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；273 K；Imidazole, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 273K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.267 |
| 2BOW MULTIDRUG-BINDING DOMAIN OF TRANSCRIPTION ACTIVATOR BMRR IN COMPLEX WITH A LIGAND, TETRAPHENYLPHOSPHONIUM 提交 1998-08-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
121–279（159 aa）
片段：MULTIDRUG-BINDING DOMAIN
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 P4P TETRAPHENYLPHOSPHONIUM × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；pH 6.5
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.320 |
| 2BOW MULTIDRUG-BINDING DOMAIN OF TRANSCRIPTION ACTIVATOR BMRR IN COMPLEX WITH A LIGAND, TETRAPHENYLPHOSPHONIUM 提交 1998-08-06 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
121–279（159 aa）
片段：MULTIDRUG-BINDING DOMAIN
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 P4P TETRAPHENYLPHOSPHONIUM × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；pH 6.5
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.320 |
| 3D6Y Crystal structure of R275E mutant of BMRR bound to DNA and berberine 提交 2008-05-20 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–278（278 aa）
片段：residues 1-278
|
突变：R275E, A277L, E278D | BER BERBERINE × 2 GOL GLYCEROL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；1.0 M Sodium Malonate, 0.05% Jeffamine-M600, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.259 |
| 3D6Z Crystal structure of R275E mutant of BMRR bound to DNA and rhodamine 提交 2008-05-20 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–278（278 aa）
片段：residues 1-278
|
突变：R275E, A277L, E278D | GOL GLYCEROL × 8 RHQ RHODAMINE 6G × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；SODIUM MALONATE, JEFFAMINE-M600, pH 7.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.263 |
| 3D70 Crystal structure of E253A mutant of BMRR bound to 22-bp oligonucleotide 提交 2008-05-20 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–278（278 aa）
|
未记录 | IMD IMIDAZOLE × 12 GOL GLYCEROL × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；SODIUM CITRATE, IMIDAZOLE, TRIFLUOROETHANOL, pH 8.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.273 |
| 3D71 Crystal structure of E253Q BMRR bound to 22 base pair promoter site 提交 2008-05-20 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–278（278 aa）
片段：residues 1-278
|
突变：E253Q, A277L, E278D | ZN ZINC ION × 2 FLC CITRATE ANION × 2 PGO S-1,2-PROPANEDIOL × 6 ETF TRIFLUOROETHANOL × 2 IMD IMIDAZOLE × 10 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；SODIUM CITRATE, IMIDAZOLE, TRIFLUOROETHANOL, pH 8.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.248 |
| 3IAO Conformational plasticity of the coiled coil domain of BmrR is required for bmr promoter binding-the unliganded structure of BmrR 提交 2009-07-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–278（278 aa）
|
突变：R275E, E253Q | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；30% PEG 4000, 0.2 M Lithium Sulfate, 0.1M Tris HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.275 |
| 3Q1M Crystal Structure of BmrR Dimer bound to DNA and the ligand 4-amino-quinaldine 提交 2010-12-17 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–276（276 aa）
|
未记录 | M4A 2-methylquinolin-4-amine × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；1.0 M Sodium Malonate, 0.05% Jeffamine-M600, pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.272 |
| 3Q2Y Crystal Structure of BmrR bound to ethidium 提交 2010-12-20 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–278（278 aa）
|
未记录 | ET ETHIDIUM × 2 GOL GLYCEROL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；1.0 M Sodium Malonate, 0.05% jeffamine pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.246 |
| 3Q3D Crystal structure of BmrR bound to puromycin 提交 2010-12-21 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–278（278 aa）
|
未记录 | PUY PUROMYCIN × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7；291 K；1.0 M Sodium Malonate ) 0.05% jeffamine-M600 pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.79 Å R-free 0.262 |
| 3Q5P Crystal structure of BmrR bound to Tetracycline 提交 2010-12-29 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–278（278 aa）
|
未记录 | TAC TETRACYCLINE × 2 GOL GLYCEROL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；1.0 M Sodium Malonate 0.05% jeffamine pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.94 Å R-free 0.262 |
| 3Q5R Crystal structure of BmrR bound to Kanamycin 提交 2010-12-29 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–278（278 aa）
|
未记录 | KAN KANAMYCIN A × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；1.0 M Sodium Malonate pH 7.0, 0.05% jeffamine M600, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.05 Å R-free 0.247 |
| 3Q5S Crystal structure of BmrR bound to Acetylcholine 提交 2010-12-29 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–278（278 aa）
|
未记录 | ACH ACETYLCHOLINE × 2 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7；291 K；1.0 M Sodium Malonate ph 7.0 0.05% Jeffamine M600, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
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分辨率 3.10 Å R-free 0.276 |
| 7CKQ The cryo-EM structure of B. subtilis BmrR transcription activation complex 提交 2020-07-18 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric（11） 与全部聚合物一致 |
链 G
1–278（278 aa）
链 I
1–278（278 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 P4P TETRAPHENYLPHOSPHONIUM × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 4.40 Å |