当前蛋白身份：P41567
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2IF1 HUMAN TRANSLATION INITIATION FACTOR EIF1, NMR, 29 STRUCTURES 提交 1998-08-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–113（113 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6；300 K；离子强度（mmCIF原始值）400 mM；压力 1
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分辨率未提供 |
| 4KZX Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1. 提交 2013-05-30 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric（35） 与全部聚合物一致 |
链 l
1–113（113 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
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分辨率 7.81 Å R-free 0.347 |
| 4KZY Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1 and eIF1A. 提交 2013-05-30 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物一致 |
链 l
1–113（113 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
|
分辨率 7.01 Å R-free 0.348 |
| 6YBW Structure of a human 48S translational initiation complex - 40S body 提交 2020-03-18 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：26-meric（26） 与全部聚合物一致 |
链 p
1–113（113 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 60 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.10 Å |
| 6ZMW Structure of a human 48S translational initiation complex 提交 2020-07-04 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：57-meric（57） 与全部聚合物一致 |
链 p
1–113（113 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 89 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.70 Å |
| 6ZP4 SARS-CoV-2 Nsp1 bound to a human 43S preinitiation ribosome complex - state 2 提交 2020-07-08 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：54-meric（54） 与全部聚合物一致 |
链 Z
1–113（113 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 4 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.90 Å |
| 6ZVJ Structure of a human ABCE1-bound 43S pre-initiation complex - State II 提交 2020-07-24 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物一致 |
链 N
23–113（91 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 3 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.80 Å |
| 7A09 Structure of a human ABCE1-bound 43S pre-initiation complex - State III 提交 2020-08-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：54-meric（54） 与全部聚合物一致 |
链 Z
1–113（113 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MET METHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.50 Å |
| 7QP6 Structure of the human 48S initiation complex in open state (h48S AUG open) 提交 2022-01-03 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：53-meric（53） 与全部聚合物一致 |
链 p
1–113（113 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；20 mM Hepes, pH 7.5,
95 mM KOAc, 3.75 mM Mg(OAc)2, 1 mM ATP, 0.5 mM GTP, 0.25 mM spermidine, 2 mM DTT,
0.4 U/uL RiboLock RNase inhibitor
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Cryo-EM grids were prepared by
floating home-made continuous carbon on 40 ul sample in the wells of teflon block (custom-made). The sample-covered carbon was then adsorbed to an EM grid.
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分辨率 4.70 Å |
| 8PJ1 Structure of human 48S translation initiation complex in open codon scanning state (48S-1) 提交 2023-06-22 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：54-meric（54） 与全部聚合物一致 |
链 p
1–113（113 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 90 ZN ZINC ION × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MET METHIONINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Manual blotting & plunge-freezing
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分辨率 3.40 Å |
| 8PPK Bat-Hp-CoV Nsp1 and eIF1 bound to the human 40S small ribosomal subunit 提交 2023-07-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric（37） 与全部聚合物一致 |
链 p
1–113（113 aa）
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未记录 | UNX UNKNOWN LIGAND × 117 MG MAGNESIUM ION × 111 ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
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分辨率 2.98 Å |
| 8PPL MERS-CoV Nsp1 bound to the human 43S pre-initiation complex 提交 2023-07-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：52-meric（52） 与全部聚合物一致 |
链 Ip
1–113（113 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 4 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 116 MET METHIONINE × 1 UNX UNKNOWN LIGAND × 129 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
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分辨率 2.65 Å |
| 8XXN Cryo-EM structure of the human 43S ribosome with PDCD4 提交 2024-01-18 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：50-meric（50） 与全部聚合物一致 |
链 C1
1–113（113 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 23 ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 9BLN The structure of human Pdcd4 bound to the 40S-eIF4A-eIF3-eIF1 complex 提交 2024-04-30 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：50-meric（50） 与全部聚合物一致 |
链 W
1–113（113 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 88 K POTASSIUM ION × 19 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 3 ACY ACETIC ACID × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.90 Å |
| 9NPX SARS-CoV-2 nsp1 bound to the Rhinolophus lepidus 40S ribosomal subunit (local refinement of the 40S body) 提交 2025-03-11 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：24-meric（24） 与全部聚合物一致 |
链 k
1–113（113 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 57 K POTASSIUM ION × 13 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.10 Å |