当前蛋白身份：P49302
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1CN3 INTERACTION OF POLYOMAVIRUS INTERNAL PROTEIN VP2 WITH MAJOR CAPSID PROTEIN VP1 AND IMPLICATIONS FOR PARTICIPATION OF VP2 IN VIRAL ENTRY 提交 1999-05-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
34–316（283 aa）
片段：RESIDUES 35-317
链 B
34–316（283 aa）
片段：RESIDUES 35-317
链 C
34–316（283 aa）
片段：RESIDUES 35-317
链 D
34–316（283 aa）
片段：RESIDUES 35-317
链 E
34–316（283 aa）
片段：RESIDUES 35-317
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4；pH 4.0
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.260 |
| 1CN3 INTERACTION OF POLYOMAVIRUS INTERNAL PROTEIN VP2 WITH MAJOR CAPSID PROTEIN VP1 AND IMPLICATIONS FOR PARTICIPATION OF VP2 IN VIRAL ENTRY 提交 1999-05-24 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
34–316（283 aa）
片段：RESIDUES 35-317
链 B
34–316（283 aa）
片段：RESIDUES 35-317
链 C
34–316（283 aa）
片段：RESIDUES 35-317
链 D
34–316（283 aa）
片段：RESIDUES 35-317
链 E
34–316（283 aa）
片段：RESIDUES 35-317
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4；pH 4.0
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.260 |
| 1SID MURINE POLYOMAVIRUS COMPLEXED WITH 3'SIALYL LACTOSE 提交 1995-12-12 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 360 PDB 声明：360-MERIC（360） 与蛋白数一致 |
链 A
1–383（383 aa）
链 B
1–383（383 aa）
链 C
1–383（383 aa）
链 D
1–383（383 aa）
链 E
1–383（383 aa）
链 F
1–383（383 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.65 Å R-free 0.253 |
| 1SID MURINE POLYOMAVIRUS COMPLEXED WITH 3'SIALYL LACTOSE 提交 1995-12-12 | Assembly 2 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–383（383 aa）
链 B
1–383（383 aa）
链 C
1–383（383 aa）
链 D
1–383（383 aa）
链 E
1–383（383 aa）
链 F
1–383（383 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.65 Å R-free 0.253 |
| 1SID MURINE POLYOMAVIRUS COMPLEXED WITH 3'SIALYL LACTOSE 提交 1995-12-12 | Assembly 3 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric（30） 与蛋白数一致 |
链 A
1–383（383 aa）
链 B
1–383（383 aa）
链 C
1–383（383 aa）
链 D
1–383（383 aa）
链 E
1–383（383 aa）
链 F
1–383（383 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.65 Å R-free 0.253 |
| 1SID MURINE POLYOMAVIRUS COMPLEXED WITH 3'SIALYL LACTOSE 提交 1995-12-12 | Assembly 4 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric（36） 与蛋白数一致 |
链 A
1–383（383 aa）
链 B
1–383（383 aa）
链 C
1–383（383 aa）
链 D
1–383（383 aa）
链 E
1–383（383 aa）
链 F
1–383（383 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.65 Å R-free 0.253 |
| 1SID MURINE POLYOMAVIRUS COMPLEXED WITH 3'SIALYL LACTOSE 提交 1995-12-12 | Assembly 5 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–383（383 aa）
链 B
1–383（383 aa）
链 C
1–383（383 aa）
链 D
1–383（383 aa）
链 E
1–383（383 aa）
链 F
1–383（383 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.65 Å R-free 0.253 |
| 1SID MURINE POLYOMAVIRUS COMPLEXED WITH 3'SIALYL LACTOSE 提交 1995-12-12 | Assembly 6 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric（30） 与蛋白数一致 |
链 A
1–383（383 aa）
链 B
1–383（383 aa）
链 C
1–383（383 aa）
链 D
1–383（383 aa）
链 E
1–383（383 aa）
链 F
1–383（383 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.65 Å R-free 0.253 |
| 1SIE MURINE POLYOMAVIRUS COMPLEXED WITH A DISIALYLATED OLIGOSACCHARIDE 提交 1995-12-12 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 360 PDB 声明：360-MERIC（360） 与蛋白数一致 |
链 A
1–383（383 aa）
链 B
1–383（383 aa）
链 C
1–383（383 aa）
链 D
1–383（383 aa）
链 E
1–383（383 aa）
链 F
1–383（383 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.65 Å R-free 0.264 |
| 1SIE MURINE POLYOMAVIRUS COMPLEXED WITH A DISIALYLATED OLIGOSACCHARIDE 提交 1995-12-12 | Assembly 2 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–383（383 aa）
链 B
1–383（383 aa）
链 C
1–383（383 aa）
链 D
1–383（383 aa）
链 E
1–383（383 aa）
链 F
1–383（383 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.65 Å R-free 0.264 |
| 1SIE MURINE POLYOMAVIRUS COMPLEXED WITH A DISIALYLATED OLIGOSACCHARIDE 提交 1995-12-12 | Assembly 3 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric（30） 与蛋白数一致 |
链 A
1–383（383 aa）
链 B
1–383（383 aa）
链 C
1–383（383 aa）
链 D
1–383（383 aa）
链 E
1–383（383 aa）
链 F
1–383（383 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.65 Å R-free 0.264 |
| 1SIE MURINE POLYOMAVIRUS COMPLEXED WITH A DISIALYLATED OLIGOSACCHARIDE 提交 1995-12-12 | Assembly 4 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric（36） 与蛋白数一致 |
链 A
1–383（383 aa）
链 B
1–383（383 aa）
链 C
1–383（383 aa）
链 D
1–383（383 aa）
链 E
1–383（383 aa）
链 F
1–383（383 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.65 Å R-free 0.264 |
| 1SIE MURINE POLYOMAVIRUS COMPLEXED WITH A DISIALYLATED OLIGOSACCHARIDE 提交 1995-12-12 | Assembly 5 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–383（383 aa）
链 B
1–383（383 aa）
链 C
1–383（383 aa）
链 D
1–383（383 aa）
链 E
1–383（383 aa）
链 F
1–383（383 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.65 Å R-free 0.264 |
| 1SIE MURINE POLYOMAVIRUS COMPLEXED WITH A DISIALYLATED OLIGOSACCHARIDE 提交 1995-12-12 | Assembly 6 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric（30） 与蛋白数一致 |
链 A
1–383（383 aa）
链 B
1–383（383 aa）
链 C
1–383（383 aa）
链 D
1–383（383 aa）
链 E
1–383（383 aa）
链 F
1–383（383 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.65 Å R-free 0.264 |
| 1VPN UNASSEMBLED POLYOMAVIRUS VP1 PENTAMER 提交 1997-03-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
32–320（289 aa）
链 B
32–320（289 aa）
链 C
32–320（289 aa）
链 D
32–320（289 aa）
链 E
32–320（289 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8；DROP: 1.0 M AMMONIUM PHOSPHATE PH 8.0 2.5 & ETHANOL 8-10 MG/ML PROTEIN RESERVOIR: 2.0 M AMMONIUM PHOSPHATE PH 8.0 5 % ETHANOL
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.199 |
| 1VPN UNASSEMBLED POLYOMAVIRUS VP1 PENTAMER 提交 1997-03-07 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 A
32–320（289 aa）
链 B
32–320（289 aa）
链 C
32–320（289 aa）
链 D
32–320（289 aa）
链 E
32–320（289 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8；DROP: 1.0 M AMMONIUM PHOSPHATE PH 8.0 2.5 & ETHANOL 8-10 MG/ML PROTEIN RESERVOIR: 2.0 M AMMONIUM PHOSPHATE PH 8.0 5 % ETHANOL
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.199 |
| 1VPS POLYOMAVIRUS VP1 PENTAMER COMPLEXED WITH A DISIALYLATED HEXASACCHARIDE 提交 1997-03-07 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
32–320（289 aa）
链 B
32–320（289 aa）
链 C
32–320（289 aa）
链 D
32–320（289 aa）
链 E
32–320（289 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8；DROP: 1.0 M AMMONIUM PHOSPHATE PH 8.0 2.5 & ETHANOL 8-10 MG/ML PROTEIN RESERVOIR: 2.0 M AMMONIUM PHOSPHATE PH 8.0 5 % ETHANOL
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.205 |
| 1VPS POLYOMAVIRUS VP1 PENTAMER COMPLEXED WITH A DISIALYLATED HEXASACCHARIDE 提交 1997-03-07 | Assembly 2 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 A
32–320（289 aa）
链 B
32–320（289 aa）
链 C
32–320（289 aa）
链 D
32–320（289 aa）
链 E
32–320（289 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8；DROP: 1.0 M AMMONIUM PHOSPHATE PH 8.0 2.5 & ETHANOL 8-10 MG/ML PROTEIN RESERVOIR: 2.0 M AMMONIUM PHOSPHATE PH 8.0 5 % ETHANOL
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.205 |
| 5CPZ Crystal structure of murine polyomavirus RA strain VP1 in complex with the GT1a glycan 提交 2015-07-21 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
34–317（284 aa）
片段：UNP residues 34-317
链 B
34–317（284 aa）
片段：UNP residues 34-317
链 C
34–317（284 aa）
片段：UNP residues 34-317
链 D
34–317（284 aa）
片段：UNP residues 34-317
链 E
34–317（284 aa）
片段：UNP residues 34-317
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 14 GOL GLYCEROL × 20 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；1.7 M ammonium sulfate
4.9% (v/v) isopropanol
|
分辨率 1.71 Å R-free 0.172 |
| 5CQ0 Crystal structure of murine polyomavirus RA strain VP1 in complex with the GD1a glycan 提交 2015-07-21 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
34–317（284 aa）
链 B
34–317（284 aa）
链 C
34–317（284 aa）
链 D
34–317（284 aa）
链 E
34–317（284 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 14 GOL GLYCEROL × 21 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；1.5 M ammonium sulfate, 6% (v/v) isopropanol
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.178 |