当前蛋白身份：P49662
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6KMZ caspase-4 P22/P10 C258A in complex with human GSDMD-C domain 提交 2019-08-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
105–289（185 aa）
链 B
105–289（185 aa）
链 a
290–377（88 aa）
链 b
290–377（88 aa）
|
突变：C258A 突变：C258A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Tris-HCl pH 7.5, 200 mM sodium tartrate, 20% (w/v) polyethylene glycol 3350, 5% glycerol and 4% 1,1,1,3,3,3-hexafluoro-2-propanol
|
分辨率 3.61 Å R-free 0.319 |
| 6KMZ caspase-4 P22/P10 C258A in complex with human GSDMD-C domain 提交 2019-08-01 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 C
105–289（185 aa）
链 D
105–289（185 aa）
链 c
290–377（88 aa）
链 d
290–377（88 aa）
|
突变：C258A 突变：C258A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Tris-HCl pH 7.5, 200 mM sodium tartrate, 20% (w/v) polyethylene glycol 3350, 5% glycerol and 4% 1,1,1,3,3,3-hexafluoro-2-propanol
|
分辨率 3.61 Å R-free 0.319 |
| 6NRY Crystal structure of human caspase-4 提交 2019-01-24 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
92–377（286 aa）
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未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；25mM Bis-Tris, 20% PEG3350
|
分辨率 2.18 Å R-free 0.237 |
| 7WR0 P32 of caspase-4 C258A mutant 提交 2022-01-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
102–377（276 aa）
|
突变：C258A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% PEG3350, 0.2 M potassium chloride
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.266 |
| 7WR1 P32 of caspase-4 C258A mutant in complex with OspC3 C-terminal ankyrin-repeat domain 提交 2022-01-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
102–377（276 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；5% PEG8000, 0.1M Tris-HCl pH 7.5, % 2-propanol
|
分辨率 2.13 Å R-free 0.200 |
| 7WR1 P32 of caspase-4 C258A mutant in complex with OspC3 C-terminal ankyrin-repeat domain 提交 2022-01-26 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
102–377（276 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；5% PEG8000, 0.1M Tris-HCl pH 7.5, % 2-propanol
|
分辨率 2.13 Å R-free 0.200 |
| 7WR4 Crystal structure of OspC3-calmodulin-caspase-4 complex 提交 2022-01-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
102–377（276 aa）
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突变：C258A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；25% PEG3350, 0.1 M HEPES pH 7.4, 0.2 M Ammonium sulfate, 0.3 M NDSB-195
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分辨率 2.75 Å R-free 0.270 |
| 7WR5 Crystal structure of OspC3-calmodulin-caspase-4 complex binding with 2'-aF-NAD+ 提交 2022-01-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
102–377（276 aa）
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突变：C258A | 5ZV [[(2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(3-aminocarbonylpyridin-1-yl)-4-fluoranyl-3-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% PEG3350, 0.2 M Potassium acetate
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.272 |
| 7WR6 Crystal structure of ADP-riboxanated caspase-4 in complex with Af1521 提交 2022-01-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
102–377（276 aa）
|
突变：C258A | 5ZY [[(3~{a}~{S},5~{R},6~{R},6~{a}~{R})-2-azanylidene-3-[(4~{R})-4-azanyl-5-oxidanylidene-pentyl]-6-oxidanyl-3~{a},5,6,6~{a}-tetrahydrofuro[2,3-d][1,3]oxazol-5-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；293 K；27% PEG 3350, 0.05M CAPSO pH 9.0
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分辨率 1.96 Å R-free 0.228 |
| 8J6K Crystal structure of pro-interleukin-18 and caspase-4 complex 提交 2023-04-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
102–270（169 aa）
链 a
290–377（88 aa）
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突变：C258A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M Calcium acetate, 0.1M Tris-HCl pH 9.0, 13% PEG 8000, 0.01 M L-Glutathione reduced, 0.01 M L-Glutathione oxidized
|
分辨率 3.12 Å R-free 0.269 |
| 8SPB Caspase-4/Pro-IL-18 complex 提交 2023-05-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
94–270（177 aa）
链 B
290–377（88 aa）
链 a
94–270（177 aa）
链 b
290–377（88 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |