当前蛋白身份：P49792
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1RRP STRUCTURE OF THE RAN-GPPNHP-RANBD1 COMPLEX 提交 1999-01-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1171–1304（134 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.25；pH 6.25
|
分辨率 2.96 Å R-free 0.304 |
| 1RRP STRUCTURE OF THE RAN-GPPNHP-RANBD1 COMPLEX 提交 1999-01-15 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
1171–1304（134 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.25；pH 6.25
|
分辨率 2.96 Å R-free 0.304 |
| 1RRP STRUCTURE OF THE RAN-GPPNHP-RANBD1 COMPLEX 提交 1999-01-15 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 B
1171–1304（134 aa）
链 D
1171–1304（134 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 4 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.25；pH 6.25
|
分辨率 2.96 Å R-free 0.304 |
| 1RRP STRUCTURE OF THE RAN-GPPNHP-RANBD1 COMPLEX 提交 1999-01-15 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
1171–1304（134 aa）
链 D
1171–1304（134 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.25；pH 6.25
|
分辨率 2.96 Å R-free 0.304 |
| 1XKE Solution structure of the second Ran-binding domain from human RanBP2 提交 2004-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2028–2154（127 aa）
片段：Ran-binding domain 2 (RanBD2)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）150 mM Na2SO4；压力 ambient
NMR样品组成
1.4mM RanBD2 U-13C; U-15N; 150mM Na2SO4; 10mM DTE; 0.5 mM EDTA; 1mM NaN3; 0.1mM DSS; 10mM potassium phosphate buffer at pH 6.5; | 92% H2O, 8%D2O
NMR样品组成
0.7mM RanBD2 U-13C; U-15N; 150mM Na2SO4; 10mM DTE; 0.5mM EDTA; 1mM NaN3; 0.1mM DSS; 10mM potassium phosphate buffer at pH 6.5; | 100% D2O
NMR样品组成
1.0mM RanBD2 U-15N; 150mM Na2SO4; 10mM DTE; 0.5mM EDTA; 1mM NaN3; 0.1 mM DSS; 10mM potassium phosphate buffer at pH 6.5; | 92% H2O, 8%D2O
NMR样品组成
1.0mM RanBD2 U-15N; 150mM Na2SO4; 10mM DTE; 0.5mM EDTA; 1mM NaN3; 0.1mM DSS; 10mM potassium phosphate buffer at pH 6.5; | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1Z5S Crystal structure of a complex between UBC9, SUMO-1, RANGAP1 and NUP358/RANBP2 提交 2005-03-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 D
2631–2711（81 aa）
片段：IR1-M domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；291 K；18% PEG4000 (w/v), 0.1 M sodium citrate, 0.2 M ammonium acetate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.01 Å R-free 0.290 |
| 3UIN Complex between human RanGAP1-SUMO2, UBC9 and the IR1 domain from RanBP2 提交 2011-11-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 D
2629–2695（67 aa）
片段：UNP residues 2629-2695
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；279 K；100 mM HEPES pH 7.5, 400 mM ammonium citrate, 2% isopropanol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.264 |
| 3UIO Complex between human RanGAP1-SUMO2, UBC9 and the IR1 domain from RanBP2 containing IR2 Motif II 提交 2011-11-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 D
2631–2695（65 aa）
片段：UNP residues 2631-2695
|
突变：A2642V, Q2644E, L2647K, T2649D, K2650T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；279 K；14% PEG4000, 100 mM sodium citrate pH 6.0, 200 mM ammonium acetate, vapor diffusion, hanging drop, temperature 279K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.251 |
| 3UIP Complex between human RanGAP1-SUMO1, UBC9 and the IR1 domain from RanBP2 containing IR2 Motif II 提交 2011-11-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 D
2631–2695（65 aa）
片段：UNP residues 2631-2695
|
突变：A2642V, Q2644E, L2647K, T2649D, K2650T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；279 K；22% PEG4000, 100 mM HEPES pH 7.5, 400 mM ammonium citrate, 2% isopropanol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 2.29 Å R-free 0.232 |
| 4GA0 Structure of the N-terminal domain of Nup358 提交 2012-07-24 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–145（145 aa）
片段：unp residues 1-145
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；18 % (w/v) PEG 3350
200 mM lithium acetate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.239 |
| 4I9Y Structure of the C-terminal domain of Nup358 提交 2012-12-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3062–3224（163 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 3 CL CHLORIDE ION × 1 TLA L(+)-TARTARIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.3；294 K；0.1 M TRIS-HCL, 0.2 M NaCl, 0.9 M K/Na Tartrate, pH 8.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.158 |
| 4I9Y Structure of the C-terminal domain of Nup358 提交 2012-12-05 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
3062–3224（163 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 5 CL CHLORIDE ION × 1 TLA L(+)-TARTARIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.3；294 K；0.1 M TRIS-HCL, 0.2 M NaCl, 0.9 M K/Na Tartrate, pH 8.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.158 |
| 4I9Y Structure of the C-terminal domain of Nup358 提交 2012-12-05 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
3062–3224（163 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 3 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.3；294 K；0.1 M TRIS-HCL, 0.2 M NaCl, 0.9 M K/Na Tartrate, pH 8.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.158 |
| 4I9Y Structure of the C-terminal domain of Nup358 提交 2012-12-05 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
3062–3224（163 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 5 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.3；294 K；0.1 M TRIS-HCL, 0.2 M NaCl, 0.9 M K/Na Tartrate, pH 8.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.158 |
| 4I9Y Structure of the C-terminal domain of Nup358 提交 2012-12-05 | Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 E
3062–3224（163 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 CL CHLORIDE ION × 1 TLA L(+)-TARTARIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.3；294 K；0.1 M TRIS-HCL, 0.2 M NaCl, 0.9 M K/Na Tartrate, pH 8.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.158 |
| 4I9Y Structure of the C-terminal domain of Nup358 提交 2012-12-05 | Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 F
3062–3224（163 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 3 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.3；294 K；0.1 M TRIS-HCL, 0.2 M NaCl, 0.9 M K/Na Tartrate, pH 8.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.158 |
| 4L6E Crystal Structure of the RanBD1 fourth domain of E3 SUMO-protein ligase RanBP2. Northeast Structural Genomics Consortium (NESG) Target HR9193b 提交 2013-06-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2907–3050（144 aa）
片段：RanBD1 4 domain (UNP residues 2907-3050)
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
Microbatch crystallization under oil；pH 7；277 K；12% PEG 3350, 0.1M sodium acetate, pH 7.00, Microbatch crystallization under oil, temperature 277K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.222 |
| 4LQW Crystal structure of HIV-1 capsid N-terminal domain in complex with NUP358 cyclophilin 提交 2013-07-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3057–3224（168 aa）
片段：UNP Residues 3057-3224
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；290 K；23 % v/v PEG 4000, 23 % glycerol, 8.5 % isopropanol, 85 mM HEPES pH 7.5, 20 mM spermine tetrahydrochloride, 100 mM glycine, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 290K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.246 |
| 4LQW Crystal structure of HIV-1 capsid N-terminal domain in complex with NUP358 cyclophilin 提交 2013-07-19 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
3057–3224（168 aa）
片段：UNP Residues 3057-3224
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；290 K；23 % v/v PEG 4000, 23 % glycerol, 8.5 % isopropanol, 85 mM HEPES pH 7.5, 20 mM spermine tetrahydrochloride, 100 mM glycine, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 290K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.246 |
| 5CLL Truncated Ran wild type in complex with GDP-BeF and RanBD1 提交 2015-07-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1155–1321（167 aa）
片段：Ran binding domain 1, residues 1155-1321
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.25；291 K；18 % PEG 4000, 250 mM ammonium sulfate, 100 mM MES pH 6.25, 1 mM BeF
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.272 |
| 5CLL Truncated Ran wild type in complex with GDP-BeF and RanBD1 提交 2015-07-16 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
1155–1321（167 aa）
片段：Ran binding domain 1, residues 1155-1321
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.25；291 K；18 % PEG 4000, 250 mM ammonium sulfate, 100 mM MES pH 6.25, 1 mM BeF
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.272 |
| 5CLQ Ran Y39A in complex with GPPNHP and RanBD1 提交 2015-07-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1155–1321（167 aa）
片段：Ran binding domain 1, UNP residues 1155-1321
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；1.8M ammonium sulfate, 2.5% PEG 1500, 100 mM HEPES pH 7.5
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.254 |
| 5CLQ Ran Y39A in complex with GPPNHP and RanBD1 提交 2015-07-16 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
1155–1321（167 aa）
片段：Ran binding domain 1, UNP residues 1155-1321
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；1.8M ammonium sulfate, 2.5% PEG 1500, 100 mM HEPES pH 7.5
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.254 |
| 7MNJ Crystal structure of the N-terminal domain of NUP358/RanBP2 (residues 145-673) 提交 2021-05-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
145–673（529 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；294 K；1% (w/v) PEG 2,000 MME; 0.8 M succinic acid; 0.1 M HEPES
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.242 |
| 7MNJ Crystal structure of the N-terminal domain of NUP358/RanBP2 (residues 145-673) 提交 2021-05-01 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
145–673（529 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；294 K；1% (w/v) PEG 2,000 MME; 0.8 M succinic acid; 0.1 M HEPES
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.242 |
| 7MNJ Crystal structure of the N-terminal domain of NUP358/RanBP2 (residues 145-673) 提交 2021-05-01 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
145–673（529 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；294 K；1% (w/v) PEG 2,000 MME; 0.8 M succinic acid; 0.1 M HEPES
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.242 |
| 7MNK Crystal structure of the tetramerization element of NUP358/RanBP2 (residues 805-832) 提交 2021-05-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
805–832（28 aa）
链 B
805–832（28 aa）
链 C
805–832（28 aa）
链 D
805–832（28 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 SO4 SULFATE ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 3.5；294 K；2 M ammonium sulfate; 0.1 M citric acid
|
分辨率 1.10 Å R-free 0.167 |
| 7MNL Crystal structure of the N-terminal domain of NUP358/RanBP2 (residues 1-752) in complex with Fab fragment 提交 2021-05-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–752（752 aa）
|
突变：I599M | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；294 K；3% (w/v) PEG 4,000; 0.15 M sodium acetate; 0.1 M sodium citrate
|
分辨率 3.95 Å R-free 0.241 |
| 7MNL Crystal structure of the N-terminal domain of NUP358/RanBP2 (residues 1-752) in complex with Fab fragment 提交 2021-05-01 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
1–752（752 aa）
|
突变：I599M | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；294 K；3% (w/v) PEG 4,000; 0.15 M sodium acetate; 0.1 M sodium citrate
|
分辨率 3.95 Å R-free 0.241 |
| 7MNM Crystal structure of the N-terminal domain of NUP358/RanBP2 (residues 1-752) T585M mutant in complex with Fab fragment 提交 2021-05-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–752（752 aa）
|
突变：I599M, T585M | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；2.5 % (w/v) PEG 4,000; 0.15 M sodium acetate; 0.1 M sodium citrate
|
分辨率 4.70 Å R-free 0.254 |
| 7MNM Crystal structure of the N-terminal domain of NUP358/RanBP2 (residues 1-752) T585M mutant in complex with Fab fragment 提交 2021-05-01 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
1–752（752 aa）
|
突变：I599M, T585M | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；2.5 % (w/v) PEG 4,000; 0.15 M sodium acetate; 0.1 M sodium citrate
|
分辨率 4.70 Å R-free 0.254 |
| 7MNN Crystal structure of the N-terminal domain of NUP358/RanBP2 (residues 1-752) T653I mutant in complex with Fab fragment 提交 2021-05-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–752（752 aa）
|
突变：I599M, T653I | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；294 K；4 (w/v) % PEG 4,000; 0.15 M sodium acetate; 0.1 M sodium citrate
|
分辨率 6.70 Å R-free 0.263 |
| 7MNN Crystal structure of the N-terminal domain of NUP358/RanBP2 (residues 1-752) T653I mutant in complex with Fab fragment 提交 2021-05-01 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
1–752（752 aa）
|
突变：I599M, T653I | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；294 K；4 (w/v) % PEG 4,000; 0.15 M sodium acetate; 0.1 M sodium citrate
|
分辨率 6.70 Å R-free 0.263 |
| 7MNO Crystal structure of the N-terminal domain of NUP358/RanBP2 (residues 1-752) I656V mutant in complex with Fab fragment 提交 2021-05-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–752（752 aa）
|
突变：I599M, I656V | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；294 K；3.5 % (w/v) PEG 4,000; 0.15 M sodium acetate; 0.1 M sodium citrate
|
分辨率 6.73 Å R-free 0.254 |
| 7MNO Crystal structure of the N-terminal domain of NUP358/RanBP2 (residues 1-752) I656V mutant in complex with Fab fragment 提交 2021-05-01 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
1–752（752 aa）
|
突变：I599M, I656V | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；294 K；3.5 % (w/v) PEG 4,000; 0.15 M sodium acetate; 0.1 M sodium citrate
|
分辨率 6.73 Å R-free 0.254 |
| 7MNP Crystal Structure of the ZnF2 of Nucleoporin NUP358/RanBP2 in complex with Ran-GDP 提交 2021-05-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1407–1443（37 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；294 K；17 % (w/v) PEG 3,350; 0.1M Bis-Tris
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.231 |
| 7MNP Crystal Structure of the ZnF2 of Nucleoporin NUP358/RanBP2 in complex with Ran-GDP 提交 2021-05-01 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
1407–1443（37 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；294 K；17 % (w/v) PEG 3,350; 0.1M Bis-Tris
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.231 |
| 7MNQ Crystal Structure of the ZnF2 of Nucleoporin NUP358/RanBP2 in complex with Ran-GDP 提交 2021-05-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1407–1443（37 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；21% (w/v) PEG 3350; 0.1 M Bis-Tris
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.208 |
| 7MNR Crystal Structure of the ZnF3 of Nucleoporin NUP358/RanBP2 in complex with Ran-GDP 提交 2021-05-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1471–1507（37 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；19% (w/v) PEG 3350; 0.1 M Bis-Tris
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.196 |
| 7MNS Crystal Structure of the ZnF4 of Nucleoporin NUP358/RanBP2 in complex with Ran-GDP 提交 2021-05-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1535–1571（37 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；18 % (w/v) PEG 3,350; 0.1M Bis-Tris
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.203 |
| 7MNT Crystal Structure of the ZnF5 or ZnF6 of Nucleoporin NUP358/RanBP2 in complex with Ran-GDP 提交 2021-05-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1598–1634（37 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；19 % (w/v) PEG 3,350; 0.1M Bis-Tris
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.257 |
| 7MNT Crystal Structure of the ZnF5 or ZnF6 of Nucleoporin NUP358/RanBP2 in complex with Ran-GDP 提交 2021-05-01 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
1598–1634（37 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；19 % (w/v) PEG 3,350; 0.1M Bis-Tris
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.257 |
| 7MNU Crystal Structure of the ZnF7 of Nucleoporin NUP358/RanBP2 in complex with Ran-GDP 提交 2021-05-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1716–1752（37 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；19% (w/v) PEG 3350; 0.1 M Bis-Tris
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.224 |
| 7MNV Crystal Structure of the ZnF8 of Nucleoporin NUP358/RanBP2 in complex with Ran-GDP 提交 2021-05-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1773–1809（37 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；294 K；19% (w/v) PEG 3350; 0.1 M Bis-Tris
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.185 |
| 7MNW Crystal Structure of Nup358/RanBP2 Ran-binding domain 1 in complex with Ran-GPPNHP 提交 2021-05-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1171–1306（136 aa）
片段：RAN-binding domain 1 of the E3 SUMO-PROTEIN LIGASE RANBP2 (UNP residues 1171-1306)
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；20% w/v PEG3350, 0.2 M potassium sodium tartrate tetrahydrate
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.242 |
| 7MNW Crystal Structure of Nup358/RanBP2 Ran-binding domain 1 in complex with Ran-GPPNHP 提交 2021-05-01 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
1171–1306（136 aa）
片段：RAN-binding domain 1 of the E3 SUMO-PROTEIN LIGASE RANBP2 (UNP residues 1171-1306)
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；20% w/v PEG3350, 0.2 M potassium sodium tartrate tetrahydrate
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.242 |
| 7MNW Crystal Structure of Nup358/RanBP2 Ran-binding domain 1 in complex with Ran-GPPNHP 提交 2021-05-01 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
1171–1306（136 aa）
片段：RAN-binding domain 1 of the E3 SUMO-PROTEIN LIGASE RANBP2 (UNP residues 1171-1306)
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；20% w/v PEG3350, 0.2 M potassium sodium tartrate tetrahydrate
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.242 |
| 7MNW Crystal Structure of Nup358/RanBP2 Ran-binding domain 1 in complex with Ran-GPPNHP 提交 2021-05-01 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
1171–1306（136 aa）
片段：RAN-binding domain 1 of the E3 SUMO-PROTEIN LIGASE RANBP2 (UNP residues 1171-1306)
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；20% w/v PEG3350, 0.2 M potassium sodium tartrate tetrahydrate
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.242 |
| 7MNX Crystal Structure of Nup358/RanBP2 Ran-binding domain 2 in complex with Ran-GPPNHP 提交 2021-05-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
2012–2148（137 aa）
片段：RAN-binding domain 2 of the E3 SUMO-PROTEIN LIGASE RANBP2 (UNP residues 2012-2148)
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；15% w/v PEG3350, 0.125 M magnesium formate
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.230 |
| 7MNX Crystal Structure of Nup358/RanBP2 Ran-binding domain 2 in complex with Ran-GPPNHP 提交 2021-05-01 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
2012–2148（137 aa）
片段：RAN-binding domain 2 of the E3 SUMO-PROTEIN LIGASE RANBP2 (UNP residues 2012-2148)
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；15% w/v PEG3350, 0.125 M magnesium formate
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.230 |
| 7MNX Crystal Structure of Nup358/RanBP2 Ran-binding domain 2 in complex with Ran-GPPNHP 提交 2021-05-01 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
2012–2148（137 aa）
片段：RAN-binding domain 2 of the E3 SUMO-PROTEIN LIGASE RANBP2 (UNP residues 2012-2148)
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；15% w/v PEG3350, 0.125 M magnesium formate
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.230 |
| 7MNX Crystal Structure of Nup358/RanBP2 Ran-binding domain 2 in complex with Ran-GPPNHP 提交 2021-05-01 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
2012–2148（137 aa）
片段：RAN-binding domain 2 of the E3 SUMO-PROTEIN LIGASE RANBP2 (UNP residues 2012-2148)
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；15% w/v PEG3350, 0.125 M magnesium formate
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.230 |
| 7MNX Crystal Structure of Nup358/RanBP2 Ran-binding domain 2 in complex with Ran-GPPNHP 提交 2021-05-01 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 J
2012–2148（137 aa）
片段：RAN-binding domain 2 of the E3 SUMO-PROTEIN LIGASE RANBP2 (UNP residues 2012-2148)
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；15% w/v PEG3350, 0.125 M magnesium formate
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.230 |
| 7MNX Crystal Structure of Nup358/RanBP2 Ran-binding domain 2 in complex with Ran-GPPNHP 提交 2021-05-01 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 L
2012–2148（137 aa）
片段：RAN-binding domain 2 of the E3 SUMO-PROTEIN LIGASE RANBP2 (UNP residues 2012-2148)
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；15% w/v PEG3350, 0.125 M magnesium formate
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.230 |
| 7MNY Crystal Structure of Nup358/RanBP2 Ran-binding domain 3 in complex with Ran-GPPNHP 提交 2021-05-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
2309–2443（135 aa）
片段：RAN-binding domain 3 of the E3 SUMO-PROTEIN LIGASE RANBP2 (UNP residues 2309-2443)
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；20% w/v PEG3350, 0.2 M sodium formate
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.262 |
| 7MNY Crystal Structure of Nup358/RanBP2 Ran-binding domain 3 in complex with Ran-GPPNHP 提交 2021-05-01 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
2309–2443（135 aa）
片段：RAN-binding domain 3 of the E3 SUMO-PROTEIN LIGASE RANBP2 (UNP residues 2309-2443)
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；20% w/v PEG3350, 0.2 M sodium formate
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.262 |
| 7MNY Crystal Structure of Nup358/RanBP2 Ran-binding domain 3 in complex with Ran-GPPNHP 提交 2021-05-01 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
2309–2443（135 aa）
片段：RAN-binding domain 3 of the E3 SUMO-PROTEIN LIGASE RANBP2 (UNP residues 2309-2443)
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；20% w/v PEG3350, 0.2 M sodium formate
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.262 |
| 7MNY Crystal Structure of Nup358/RanBP2 Ran-binding domain 3 in complex with Ran-GPPNHP 提交 2021-05-01 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
2309–2443（135 aa）
片段：RAN-binding domain 3 of the E3 SUMO-PROTEIN LIGASE RANBP2 (UNP residues 2309-2443)
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；20% w/v PEG3350, 0.2 M sodium formate
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.262 |
| 7MNY Crystal Structure of Nup358/RanBP2 Ran-binding domain 3 in complex with Ran-GPPNHP 提交 2021-05-01 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 J
2309–2443（135 aa）
片段：RAN-binding domain 3 of the E3 SUMO-PROTEIN LIGASE RANBP2 (UNP residues 2309-2443)
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；20% w/v PEG3350, 0.2 M sodium formate
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.262 |
| 7MNY Crystal Structure of Nup358/RanBP2 Ran-binding domain 3 in complex with Ran-GPPNHP 提交 2021-05-01 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 L
2309–2443（135 aa）
片段：RAN-binding domain 3 of the E3 SUMO-PROTEIN LIGASE RANBP2 (UNP residues 2309-2443)
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；20% w/v PEG3350, 0.2 M sodium formate
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.262 |
| 7MNZ Crystal Structure of Nup358/RanBP2 Ran-binding domain 4 in complex with Ran-GPPNHP 提交 2021-05-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
2911–3045（135 aa）
片段：;RAN-binding domain 4 of the E3 SUMO-PROTEIN LIGASE RANBP2 (UNP residues 2911-3045), WHTMKNYY/QNYDNKQV mutant (UNP residues 2962-2969)
;
|
突变：W2962Q, H2963N, T2964Y, M2965D, K2966N, N2967K, Y2928Q, Y2969V | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；294 K；20% w/v PEG3350, 0.1 M ammonium sulfate, 0.1 M HEPES
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.225 |
| 7MNZ Crystal Structure of Nup358/RanBP2 Ran-binding domain 4 in complex with Ran-GPPNHP 提交 2021-05-01 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
2911–3045（135 aa）
片段：;RAN-binding domain 4 of the E3 SUMO-PROTEIN LIGASE RANBP2 (UNP residues 2911-3045), WHTMKNYY/QNYDNKQV mutant (UNP residues 2962-2969)
;
|
突变：W2962Q, H2963N, T2964Y, M2965D, K2966N, N2967K, Y2928Q, Y2969V | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；294 K；20% w/v PEG3350, 0.1 M ammonium sulfate, 0.1 M HEPES
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.225 |
| 7MNZ Crystal Structure of Nup358/RanBP2 Ran-binding domain 4 in complex with Ran-GPPNHP 提交 2021-05-01 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
2911–3045（135 aa）
片段：;RAN-binding domain 4 of the E3 SUMO-PROTEIN LIGASE RANBP2 (UNP residues 2911-3045), WHTMKNYY/QNYDNKQV mutant (UNP residues 2962-2969)
;
|
突变：W2962Q, H2963N, T2964Y, M2965D, K2966N, N2967K, Y2928Q, Y2969V | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；294 K；20% w/v PEG3350, 0.1 M ammonium sulfate, 0.1 M HEPES
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.225 |
| 7MNZ Crystal Structure of Nup358/RanBP2 Ran-binding domain 4 in complex with Ran-GPPNHP 提交 2021-05-01 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
2911–3045（135 aa）
片段：;RAN-binding domain 4 of the E3 SUMO-PROTEIN LIGASE RANBP2 (UNP residues 2911-3045), WHTMKNYY/QNYDNKQV mutant (UNP residues 2962-2969)
;
|
突变：W2962Q, H2963N, T2964Y, M2965D, K2966N, N2967K, Y2928Q, Y2969V | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；294 K；20% w/v PEG3350, 0.1 M ammonium sulfate, 0.1 M HEPES
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.225 |
| 7MNZ Crystal Structure of Nup358/RanBP2 Ran-binding domain 4 in complex with Ran-GPPNHP 提交 2021-05-01 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 J
2911–3045（135 aa）
片段：;RAN-binding domain 4 of the E3 SUMO-PROTEIN LIGASE RANBP2 (UNP residues 2911-3045), WHTMKNYY/QNYDNKQV mutant (UNP residues 2962-2969)
;
|
突变：W2962Q, H2963N, T2964Y, M2965D, K2966N, N2967K, Y2928Q, Y2969V | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；294 K；20% w/v PEG3350, 0.1 M ammonium sulfate, 0.1 M HEPES
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.225 |
| 7MNZ Crystal Structure of Nup358/RanBP2 Ran-binding domain 4 in complex with Ran-GPPNHP 提交 2021-05-01 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 L
2911–3045（135 aa）
片段：;RAN-binding domain 4 of the E3 SUMO-PROTEIN LIGASE RANBP2 (UNP residues 2911-3045), WHTMKNYY/QNYDNKQV mutant (UNP residues 2962-2969)
;
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突变：W2962Q, H2963N, T2964Y, M2965D, K2966N, N2967K, Y2928Q, Y2969V | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；294 K；20% w/v PEG3350, 0.1 M ammonium sulfate, 0.1 M HEPES
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.225 |
| 7R5J Human nuclear pore complex (dilated) 提交 2022-02-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 808 PDB 声明：808-meric（808） 与蛋白数一致 |
链 00
1–3224（3224 aa）
链 01
1–3224（3224 aa）
链 02
1–3224（3224 aa）
链 03
1–3224（3224 aa）
链 04
1–3224（3224 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 50.00 Å |
| 7R5K Human nuclear pore complex (constricted) 提交 2022-02-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 808 PDB 声明：808-meric（808） 与蛋白数一致 |
链 00
1–3224（3224 aa）
链 01
1–3224（3224 aa）
链 02
1–3224（3224 aa）
链 03
1–3224（3224 aa）
链 04
1–3224（3224 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 12.00 Å |
| 9B62 Human RANBP2/RAN(GTP)/RANGAP1-SUMO1/UBC9/CRM1/RAN(GTP) - composite map and model 提交 2024-03-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 E
2446–3060（615 aa）
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未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；20 mM Tris-Cl pH 8.0, 50 mM NaCl, 0.1 mM TCEP supplemented with 0.02% (v/v) IGEPAL CA-630
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；30 s wait time, blot for 2.5 s before plunging
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分辨率 2.90 Å |