当前蛋白身份：P50591
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1D0G CRYSTAL STRUCTURE OF DEATH RECEPTOR 5 (DR5) BOUND TO APO2L/TRAIL 提交 1999-09-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
114–281（168 aa）
片段：RESIDUES 114-281
链 B
114–281（168 aa）
片段：RESIDUES 114-281
链 D
114–281（168 aa）
片段：RESIDUES 114-281
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；292 K；15% Peg8K, 10% ethylene glycol, 0.2M ammonium sulface, 0.1M Tris-HCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP,
temperature 19K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.267 |
| 1D2Q CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN TRAIL 提交 1999-09-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
114–281（168 aa）
片段：EXTRA CELLULAR DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 9；295 K；PEG 550 MME, bicine pH 9.0, cadmium chloride, EVAPORATION, temperature 22K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.282 |
| 1D2Q CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN TRAIL 提交 1999-09-27 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
114–281（168 aa）
片段：EXTRA CELLULAR DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 9；295 K；PEG 550 MME, bicine pH 9.0, cadmium chloride, EVAPORATION, temperature 22K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.282 |
| 1D2Q CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN TRAIL 提交 1999-09-27 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
114–281（168 aa）
片段：EXTRA CELLULAR DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 9；295 K；PEG 550 MME, bicine pH 9.0, cadmium chloride, EVAPORATION, temperature 22K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.282 |
| 1D4V Crystal structure of trail-DR5 complex 提交 1999-10-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 B
119–281（163 aa）
片段：SINGLE SUBUNIT
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；25% ETHYLENE GLYCOL, 0.1% N-OCTYL-BETA-GLUCOSIDE, pH 8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 20K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.270 |
| 1DG6 CRYSTAL STRUCTURE OF APO2L/TRAIL 提交 1999-11-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
91–281（191 aa）
片段：TRIMERIC JELLY-ROLL DOMAIN OF APO2L
|
突变：D218A | ZN ZINC ION × 3 CL CHLORIDE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；WELL SOLUTION 32% MPD; DROP 1.2MG/ML APO2L, 20MM TRIS HCL PH 7.5, 1% MPD, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.197 |
| 1DU3 Crystal structure of TRAIL-SDR5 提交 2000-01-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 D
114–281（168 aa）
链 E
114–281（168 aa）
链 F
114–281（168 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 4.6；295 K；PEG 1000, Sodium Acetate, Sodium Chloride, pH 4.6, EVAPORATION, temperature 22K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.291 |
| 1DU3 Crystal structure of TRAIL-SDR5 提交 2000-01-14 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 J
114–281（168 aa）
链 K
114–281（168 aa）
链 L
114–281（168 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 4.6；295 K；PEG 1000, Sodium Acetate, Sodium Chloride, pH 4.6, EVAPORATION, temperature 22K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.291 |
| 4N90 Crystal structure of ternary complex of TRAIL, DR5, and Fab fragment from a DR5 agonist antibody 提交 2013-10-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
114–281（168 aa）
片段：UNP residues 114-281
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；100 mM Tris pH 8.0, 1.0 M LiCl, 0.2 M MnCl2, 10% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.286 |
| 4N90 Crystal structure of ternary complex of TRAIL, DR5, and Fab fragment from a DR5 agonist antibody 提交 2013-10-18 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
114–281（168 aa）
片段：UNP residues 114-281
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；100 mM Tris pH 8.0, 1.0 M LiCl, 0.2 M MnCl2, 10% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.286 |
| 4N90 Crystal structure of ternary complex of TRAIL, DR5, and Fab fragment from a DR5 agonist antibody 提交 2013-10-18 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
114–281（168 aa）
片段：UNP residues 114-281
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；100 mM Tris pH 8.0, 1.0 M LiCl, 0.2 M MnCl2, 10% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.286 |
| 5CIR Crystal structure of death receptor 4 (DR4; TNFFRSF10A) bound to TRAIL (TNFSF10) 提交 2015-07-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
114–281（168 aa）
片段：Residues 114-281
链 B
114–281（168 aa）
片段：Residues 114-281
链 D
114–281（168 aa）
片段：Residues 114-281
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；100 mM MMT (1:2:2 ratio of DL-malic acid, MES, Tris base), pH 5.0, 22.2%(W/V) PEG 2000MME
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分辨率 3.00 Å R-free 0.216 |