当前蛋白身份：P54727
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1P1A NMR structure of ubiquitin-like domain of hHR23B 提交 2003-04-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–82（82 aa）
片段：Ubiquitin-like domain
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6；303 K；离子强度（mmCIF原始值）50mM sodium phosphate + 100mM sodium chloride；压力 ambient
NMR测量条件
pH 6；303 K；离子强度（mmCIF原始值）50mM sodium phosphate + 100mM sodium chloride；压力 ambient
NMR测量条件
pH 6；303 K；离子强度（mmCIF原始值）50mM sodium phosphate + 100mM sodium chloride；压力 ambient
NMR样品组成
2mM UbL domain 15N,13C; 50mM Sodium Phosphate Buffer with 100mM NaCl | 92.5% H2O, 7.5% D2O
NMR样品组成
2mM UbL domain 15N; 50mM Sodium Phosphate Buffer with 100mM NaCl | 92.5% H2O, 7.5% D2O
NMR样品组成
2mM UbL domain non-labeled; 50mM Sodium Phosphate Buffer with 100mM NaCl | 100% D2O
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分辨率未提供 |
| 1PVE Solution structure of XPC binding domain of hHR23B 提交 2003-06-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
275–342（68 aa）
片段：XPC binding domain
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；300 K；离子强度（mmCIF原始值）40mM Sodium Phosphate, 160mM Sodium Chloride, 10mM CHAPS；压力 1
NMR样品组成
1mM hHR23B(275-342) U-15N, 13C; 40mM phosphate buffer NA; 10mM CHAPS NA | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 1UEL Solution structure of ubiquitin-like domain of hHR23B complexed with ubiquitin-interacting motif of proteasome subunit S5a 提交 2003-05-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–87（87 aa）
片段：ubiquitin-like domain (RESIDUES 1-95)
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR样品组成
U-15N, U-13C | 20mM potassium phosphate buffer (pH 6.8), 5mM KCl, 90% H2O, 10% D2O
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分辨率未提供 |
| 28JS Cryo-EM structure of the human holo-TFIIH-XPC complex bound to bulky lesion-mimic DNA (composite map) 提交 2026-02-03 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric（13） 与全部聚合物一致 |
链 J
1–409（409 aa）
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未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Leica EM GP2
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分辨率 3.32 Å |
| 28JV Cryo-EM structure of the human holo-TFIIH-XPC complex bound to bulky lesion-mimic DNA (consensus map) 提交 2026-02-04 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric（13） 与全部聚合物一致 |
链 J
1–409（409 aa）
|
未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Leica EM GP2
|
分辨率 3.91 Å |
| 8EBS Initial DNA-lesion (Cy5) binding by XPC and TFIIH 提交 2022-08-31 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric（12） 与全部聚合物一致 |
链 I
1–409（409 aa）
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未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 8EBV Initial DNA-lesion (AP) binding by XPC and TFIIH complex 1 提交 2022-08-31 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric（12） 与全部聚合物一致 |
链 I
1–409（409 aa）
|
未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.10 Å |
| 8EBW Initial DNA-lesion (AP) binding by XPC and TFIIH complex2 提交 2022-08-31 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric（12） 与全部聚合物一致 |
链 I
1–409（409 aa）
|
未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.60 Å |
| 9PCP NER dual incision complex - NoG 提交 2025-06-28 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric（15） 与全部聚合物一致 |
链 I
1–409（409 aa）
|
未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6 CA CALCIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.30 Å |
| 9VFE Solution structure of XPC binding domain of hHR23B (apo form) 提交 2025-06-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
271–342（72 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.4；300 K；离子强度（mmCIF原始值）160；压力 1
NMR样品组成
1.1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] UV excision repair protein RAD23 homolog B, 20 mM sodium phosphate, 160 mM sodium chloride, 95% H2O/5% [U-100% 2H] D2O | 95% H2O/5% [U-100% 2H] D2O
|
分辨率未提供 |
| 9VFF Solution structure of XPC binding domain of a hHR23B variant - H274N/H323Q 提交 2025-06-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
271–342（72 aa）
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突变：H274N, H323Q | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.4；300 K；离子强度（mmCIF原始值）160；压力 1
NMR样品组成
1.1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] UV excision repair protein RAD23 homolog B, 20 mM sodium phosphate, 160 mM sodium chloride, 5 % v/v [U-100% 2H] D2O, 95 % v/v H2O | 5 % v/v [U-100% 2H] D2O, 95 % v/v H2O
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分辨率未提供 |
| 9VFG Solution structure of silver bound XPC binding domain of hHR23B (holo form) 提交 2025-06-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
271–342（72 aa）
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未记录 | AG SILVER ION × 1 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.4；300 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 1
NMR样品组成
1.1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] UV excision repair protein RAD23 homolog B, 50 mM HEPES, 5 % [U-100% 2H] D2O, 95 % H2O | 5 % [U-100% 2H] D2O, 95 % H2O
|
分辨率未提供 |