当前蛋白身份：P61073
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 22XC Structure of CXCR4 in complex with a de-novo designed mini-protein antagonist 提交 2026-01-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 C
2–352（351 aa）
链 G
2–352（351 aa）
链 R
2–352（351 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 3 D21 (2R)-1-(hexadecanoyloxy)-3-(phosphonooxy)propan-2-yl (9Z)-octadec-9-enoate × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.28 Å |
| 2K03 Structure of SDF1 in complex with the CXCR4 N-terminus containing a sulfotyrosine at postition 21 提交 2008-01-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
1–38（38 aa）
片段：N-terminus, residues 1-38
链 D
1–38（38 aa）
片段：N-terminus, residues 1-38
|
突变：C28A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C28A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.8；308 K；离子强度（mmCIF原始值）21；压力 AMBIENT
NMR样品组成
.338 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] CXCL12/SDF1-alpha, .970 mM CXCR4, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1.07 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] CXCR4, 0.67 mM CXCL12/SDF1-alpha, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2K04 Structure of SDF1 in complex with the CXCR4 N-terminus containing no sulfotyrosines 提交 2008-01-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
1–38（38 aa）
片段：N-terminus, residues 1-38
链 D
1–38（38 aa）
片段：N-terminus, residues 1-38
|
突变：C28A 突变：C28A | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.8；308 K；离子强度（mmCIF原始值）21；压力 AMBIENT
NMR样品组成
.31 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] CXCL12/SDF1-alpha, .775 mM CXCR4, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] CXCR4, 0.625 mM CXCL12/SDF1-alpha, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2K05 Structure of SDF1 in complex with the CXCR4 N-terminus containing sulfotyrosines at postitions 7, 12 and 21 提交 2008-01-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
1–38（38 aa）
片段：N-terminus, residues 1-38
链 D
1–38（38 aa）
片段：N-terminus, residues 1-38
|
突变：C28A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C28A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.8；308 K；离子强度（mmCIF原始值）21；压力 AMBIENT
NMR样品组成
.338 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] CXCL12/SDF1-alpha, .97 mM CXCR4, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1.07 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] CXCR4, 0.67 mM CXCL12/SDF1-alpha, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2N55 Structure of constitutively monomeric CXCL12 in complex with the CXCR4 N-terminus 提交 2015-07-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–38（38 aa）
|
突变：C28A | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.02；压力 ambient
NMR样品组成
2 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] protein_1, 25 mM [U-2H] MES, 10 % [U-99% 2H] D2O, 0.02 % sodium azide, 2 mM protein_2, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] protein_2, 25 mM [U-2H] MES, 0.02 % sodium azide, 10 % [U-99% 2H] D2O, 2 mM protein_1, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 3ODU The 2.5 A structure of the CXCR4 chemokine receptor in complex with small molecule antagonist IT1t 提交 2010-08-11 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–229（228 aa）
片段：CXCR4 residues 2-229, LYSOZYME residues 1002-1161, CXCR4 residues 230-319
链 A
230–319（90 aa）
片段：CXCR4 residues 2-229, LYSOZYME residues 1002-1161, CXCR4 residues 230-319
链 B
2–229（228 aa）
片段：CXCR4 residues 2-229, LYSOZYME residues 1002-1161, CXCR4 residues 230-319
链 B
230–319（90 aa）
片段：CXCR4 residues 2-229, LYSOZYME residues 1002-1161, CXCR4 residues 230-319
|
突变：L125W, C1054T, C1097T 突变：L125W, C1054T, C1097T 突变：L125W, C1054T, C1097T 突变：L125W, C1054T, C1097T | ITD (6,6-dimethyl-5,6-dihydroimidazo[2,1-b][1,3]thiazol-3-yl)methyl N,N'-dicyclohexylimidothiocarbamate × 2 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 5 OLA OLEIC ACID × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；Lipidic cubic phase made of monoolein and cholesterol, 20% PEG400, 0.3M Sodium malonate, 5mM Taurine, 0.1M Sodium citrate, pH 5.5, LIPIDIC CUBIC PHASE, temperature 293K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.282 |
| 3OE0 Crystal structure of the CXCR4 chemokine receptor in complex with a cyclic peptide antagonist CVX15 提交 2010-08-12 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
2–228（227 aa）
片段：CXCR4 residues 2-228, LYSOZYME residues 1002-1161, CXCR4 residues 231-319
链 A
231–319（89 aa）
片段：CXCR4 residues 2-228, LYSOZYME residues 1002-1161, CXCR4 residues 231-319
|
突变：L125W, T240P, C1054T, C1097T 突变：L125W, T240P, C1054T, C1097T | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 7；293 K；Lipidic cubic phase made of monoolein and cholesterol, 25% PEG400, 0.3M Potassium sodium tartrate, 0.1 M Tris pH 7.0, LIPIDIC CUBIC PHASE, temperature 293K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.267 |
| 3OE6 Crystal structure of the CXCR4 chemokine receptor in complex with a small molecule antagonist IT1t in I222 spacegroup 提交 2010-08-12 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–229（228 aa）
片段：CXCR4 residues 2-228, LYSOZYME residues 1002-1161, CXCR4 residues 231-325
链 A
230–325（96 aa）
片段：CXCR4 residues 2-228, LYSOZYME residues 1002-1161, CXCR4 residues 231-325
|
突变：L125W, C1054T, C1097T 突变：L125W, C1054T, C1097T | ITD (6,6-dimethyl-5,6-dihydroimidazo[2,1-b][1,3]thiazol-3-yl)methyl N,N'-dicyclohexylimidothiocarbamate × 2 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 6 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；Lipidic cubic phase made of monoolein and cholesterol, 20-26% PEG400, 0.3M Sodium malonate, 5mM Nickel chloride, 0.1M Sodium citrate pH 5.0-5.5, LIPIDIC CUBIC PHASE, temperature 293K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.306 |
| 3OE8 Crystal structure of the CXCR4 chemokine receptor in complex with a small molecule antagonist IT1t in P1 spacegroup 提交 2010-08-12 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
2–229（228 aa）
片段：CXCR4 residues 2-229, LYSOZYME residues 1002-1161, CXCR4 residues 230-319
链 B
230–319（90 aa）
片段：CXCR4 residues 2-229, LYSOZYME residues 1002-1161, CXCR4 residues 230-319
链 C
2–229（228 aa）
片段：CXCR4 residues 2-229, LYSOZYME residues 1002-1161, CXCR4 residues 230-319
链 C
230–319（90 aa）
片段：CXCR4 residues 2-229, LYSOZYME residues 1002-1161, CXCR4 residues 230-319
|
突变：L125W, C1054T, C1097T 突变：L125W, C1054T, C1097T 突变：L125W, C1054T, C1097T 突变：L125W, C1054T, C1097T | ITD (6,6-dimethyl-5,6-dihydroimidazo[2,1-b][1,3]thiazol-3-yl)methyl N,N'-dicyclohexylimidothiocarbamate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6；293 K；Lipidic cubic phase made of monoolein and cholesterol, 26% PEG400, 0.3M Sodium malonate, 5mM Strontium chloride, 0.1M MES pH 6.0, LIPIDIC CUBIC PHASE, temperature 293K
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.295 |
| 3OE8 Crystal structure of the CXCR4 chemokine receptor in complex with a small molecule antagonist IT1t in P1 spacegroup 提交 2010-08-12 | Assembly 2 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
2–229（228 aa）
片段：CXCR4 residues 2-229, LYSOZYME residues 1002-1161, CXCR4 residues 230-319
链 A
230–319（90 aa）
片段：CXCR4 residues 2-229, LYSOZYME residues 1002-1161, CXCR4 residues 230-319
链 B
2–229（228 aa）
片段：CXCR4 residues 2-229, LYSOZYME residues 1002-1161, CXCR4 residues 230-319
链 B
230–319（90 aa）
片段：CXCR4 residues 2-229, LYSOZYME residues 1002-1161, CXCR4 residues 230-319
链 C
2–229（228 aa）
片段：CXCR4 residues 2-229, LYSOZYME residues 1002-1161, CXCR4 residues 230-319
链 C
230–319（90 aa）
片段：CXCR4 residues 2-229, LYSOZYME residues 1002-1161, CXCR4 residues 230-319
|
突变：L125W, C1054T, C1097T 突变：L125W, C1054T, C1097T 突变：L125W, C1054T, C1097T 突变：L125W, C1054T, C1097T 突变：L125W, C1054T, C1097T 突变：L125W, C1054T, C1097T | ITD (6,6-dimethyl-5,6-dihydroimidazo[2,1-b][1,3]thiazol-3-yl)methyl N,N'-dicyclohexylimidothiocarbamate × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6；293 K；Lipidic cubic phase made of monoolein and cholesterol, 26% PEG400, 0.3M Sodium malonate, 5mM Strontium chloride, 0.1M MES pH 6.0, LIPIDIC CUBIC PHASE, temperature 293K
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.295 |
| 3OE8 Crystal structure of the CXCR4 chemokine receptor in complex with a small molecule antagonist IT1t in P1 spacegroup 提交 2010-08-12 | Assembly 3 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–229（228 aa）
片段：CXCR4 residues 2-229, LYSOZYME residues 1002-1161, CXCR4 residues 230-319
链 A
230–319（90 aa）
片段：CXCR4 residues 2-229, LYSOZYME residues 1002-1161, CXCR4 residues 230-319
|
突变：L125W, C1054T, C1097T 突变：L125W, C1054T, C1097T | ITD (6,6-dimethyl-5,6-dihydroimidazo[2,1-b][1,3]thiazol-3-yl)methyl N,N'-dicyclohexylimidothiocarbamate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6；293 K；Lipidic cubic phase made of monoolein and cholesterol, 26% PEG400, 0.3M Sodium malonate, 5mM Strontium chloride, 0.1M MES pH 6.0, LIPIDIC CUBIC PHASE, temperature 293K
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.295 |
| 3OE9 Crystal structure of the chemokine CXCR4 receptor in complex with a small molecule antagonist IT1t in P1 spacegroup 提交 2010-08-12 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–228（227 aa）
片段：CXCR4 residues 2-228, LYSOZYME residues 1002-1161, CXCR4 residues 231-319
链 A
231–319（89 aa）
片段：CXCR4 residues 2-228, LYSOZYME residues 1002-1161, CXCR4 residues 231-319
链 B
2–228（227 aa）
片段：CXCR4 residues 2-228, LYSOZYME residues 1002-1161, CXCR4 residues 231-319
链 B
231–319（89 aa）
片段：CXCR4 residues 2-228, LYSOZYME residues 1002-1161, CXCR4 residues 231-319
|
突变：L125W, T240P, C1054T, C1097T 突变：L125W, T240P, C1054T, C1097T 突变：L125W, T240P, C1054T, C1097T 突变：L125W, T240P, C1054T, C1097T | ITD (6,6-dimethyl-5,6-dihydroimidazo[2,1-b][1,3]thiazol-3-yl)methyl N,N'-dicyclohexylimidothiocarbamate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6；293 K；Lipidic cubic phase made of monoolein and cholesterol, 27-35% PEG400, 0.27-0.33M Sodium malonate, 5mM Hexamine cobalt chloride, 0.1M MES pH 6.0, LIPIDIC CUBIC PHASE, temperature 293K
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.284 |
| 4RWS Crystal structure of CXCR4 and viral chemokine antagonist vMIP-II complex (PSI Community Target) 提交 2014-12-05 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–228（227 aa）
片段：CXCR4 residues 2-228, LYSOZYME residues 1002-1161, CXCR4 residues 231-319
链 A
231–319（89 aa）
片段：CXCR4 residues 2-228, LYSOZYME residues 1002-1161, CXCR4 residues 231-319
|
突变：L125W, T240P, D187C, C1054T, C1097T 突变：L125W, T240P, D187C, C1054T, C1097T | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；100 mM sodium citrate pH 5.5, 28% PEG 400, 120 mM ammonium phosphate dibasic, 2-6% polypropylene P400, Lipidic cubic phase, temperature 293K
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.274 |
| 8GP3 Structure of beta-arrestin1 in complex with a phosphopeptide corresponding to the human C-X-C chemokine receptor type 4, CXCR4 提交 2022-08-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 U
336–352（17 aa）
链 V
336–352（17 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3 seconds before plunging.
|
分辨率 4.80 Å |
| 8I0Q Structure of beta-arrestin1 in complex with a phosphopeptide corresponding to the human C-X-C chemokine receptor type 4, CXCR4 (Local refine) 提交 2023-01-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 U
336–352（17 aa）
链 V
336–352（17 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3 seconds before plunging.
|
分辨率 4.45 Å |
| 8K3Z Cryo-EM structure of CXCR4 in complex with CXCL12 提交 2023-07-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
25–320（296 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.81 Å |
| 8U4N Structure of Apo CXCR4/Gi complex 提交 2023-09-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 R
2–352（351 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.72 Å |
| 8U4O Structure of CXCL12-bound CXCR4/Gi complex 提交 2023-09-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 R
2–352（351 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.29 Å |
| 8U4P Structure of AMD3100-bound CXCR4/Gi complex 提交 2023-09-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 R
2–352（351 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 1 VH6 Plerixafor × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.15 Å |
| 8U4Q Structure of REGN7663 Fab-bound CXCR4/Gi complex 提交 2023-09-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 R
2–352（351 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.36 Å |
| 8U4R Structure of REGN7663-Fab bound CXCR4 提交 2023-09-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 R
2–352（351 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8U4S Structure of trimeric CXCR4 in complex with REGN7663 Fab 提交 2023-09-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 C
2–352（351 aa）
链 G
2–352（351 aa）
链 R
2–352（351 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 6 D21 (2R)-1-(hexadecanoyloxy)-3-(phosphonooxy)propan-2-yl (9Z)-octadec-9-enoate × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.35 Å |
| 8U4T Structure of tetrameric CXCR4 in complex with REGN7663 Fab 提交 2023-09-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 AA
2–352（351 aa）
链 I
2–352（351 aa）
链 Q
2–352（351 aa）
链 R
2–352（351 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 16 D21 (2R)-1-(hexadecanoyloxy)-3-(phosphonooxy)propan-2-yl (9Z)-octadec-9-enoate × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.38 Å |
| 8YU7 Cryo-EM structure of CXCR4 tetramer 提交 2024-03-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
2–352（351 aa）
链 B
2–352（351 aa）
链 C
2–352（351 aa）
链 D
2–352（351 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 20 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.01 Å |
| 8ZPL Cryo-EM strucutre of CXCR4 complexed with antagonist HF51116 提交 2024-05-30 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 R
1–224（224 aa）
链 R
241–319（79 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 2 A1D8K (2S)-N-[[4-[[3-(cyclohexylamino)propylamino]methyl]phenyl]methyl]-5-(diaminomethylideneamino)-2-(pyridin-2-ylmethylamino)pentanamide × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.01 Å |
| 8ZPM Cryo-EM strucutre of CXCR4 complexed with antagonist AMD070 提交 2024-05-30 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 R
1–224（224 aa）
链 R
241–319（79 aa）
|
未记录 | A1D8L Mavorixafor × 1 CLR CHOLESTEROL × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8ZPN Cryo-EM strucutre of CXCR4 complexed with antagonist AMD3100 提交 2024-05-30 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 R
1–224（224 aa）
链 R
241–319（79 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 1 VH6 Plerixafor × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.31 Å |
| 9MDU Human CXCR4 tetramer 提交 2024-12-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–352（352 aa）
链 B
1–352（352 aa）
链 C
1–352（352 aa）
链 D
1–352（352 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 9ME1 hCXCR4-CXCL12 complex with 1:1 stoichiometry 提交 2024-12-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 A
1–352（352 aa）
链 B
1–352（352 aa）
链 C
1–352（352 aa）
链 D
1–352（352 aa）
链 E
1–352（352 aa）
链 I
1–352（352 aa）
链 K
1–352（352 aa）
链 L
1–352（352 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.37 Å |
| 9MEJ Global structure of hCXCR4 and HIV-2 gp120 提交 2024-12-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
1–352（352 aa）
链 B
1–352（352 aa）
链 C
1–352（352 aa）
链 D
1–352（352 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.99 Å |
| 9MEN CryoEM structure of hCXCR4 tetramer bound to HIV-2/gp120/V3 loop 提交 2024-12-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
1–352（352 aa）
链 B
1–352（352 aa）
链 C
1–352（352 aa）
链 D
1–352（352 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.57 Å |
| 9MET CXCR4-HIV-2/gp120-CD4 提交 2024-12-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 M
1–352（352 aa）
链 N
1–352（352 aa）
链 O
1–352（352 aa）
链 S
1–352（352 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.65 Å |
| 9MEU CXCR4 tetramer bound to 4 CXCL12 dimers 提交 2024-12-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
1–352（352 aa）
链 B
1–352（352 aa）
链 C
1–352（352 aa）
链 D
1–352（352 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.46 Å |
| 9UPU Cryo-EM strucutre of CXCR4 complexed with agonist SDV1a 提交 2025-04-29 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 R
1–337（337 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 9UPV Cryo-EM structure of CXCR4 complexed with agonist SDVX1 提交 2025-04-29 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 R
1–337（337 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |