当前蛋白身份:P62825 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1BYU CANINE GDP-RAN 提交 1998-10-18 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–216(216 aa) 片段:ALL
链 B 1–216(216 aa) 片段:ALL
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.2;SEE PUBLICATION, pH 7.2
分辨率 2.15 Å R-free 0.243
1QG2 CANINE GDP-RAN R76E MUTANT 提交 1999-04-20 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–216(216 aa) 片段:ALL
突变:R76E MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.2;SEE PUBLICATION, pH 7.20
分辨率 2.50 Å R-free 0.237
1QG4 CANINE GDP-RAN F72Y MUTANT 提交 1999-04-20 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–216(216 aa) 片段:ALL
突变:F72Y MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.2;pH 7.20
分辨率 2.50 Å R-free 0.237
1QG4 CANINE GDP-RAN F72Y MUTANT 提交 1999-04-20 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 1–216(216 aa) 片段:ALL
突变:F72Y MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.2;pH 7.20
分辨率 2.50 Å R-free 0.237
1WA5 Structure of the Cse1:Imp-alpha:RanGTP complex 提交 2004-10-23 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 1–176(176 aa)
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.6;291 K;50mM TrisHCl, 200mM NaCl, 5mM Mg(OAc)2, .1mM GTP, 22% PEG3350 and 2% PEG400.
分辨率 2.00 Å R-free 0.216
2BKU Kap95p:RanGTP complex 提交 2005-02-21 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–177(177 aa) 片段:RESIDUES 1-177
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.70 Å R-free 0.279
2BKU Kap95p:RanGTP complex 提交 2005-02-21 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 1–177(177 aa) 片段:RESIDUES 1-177
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.70 Å R-free 0.279
3A6P Crystal structure of Exportin-5:RanGTP:pre-miRNA complex 提交 2009-09-07 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:pentameric(5) 与全部聚合物一致
链 C 1–216(216 aa)
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.92 Å R-free 0.312
3A6P Crystal structure of Exportin-5:RanGTP:pre-miRNA complex 提交 2009-09-07 Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:pentameric(5) 与全部聚合物一致
链 H 1–216(216 aa)
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.92 Å R-free 0.312
3RAN CANINE GDP-RAN Q69L MUTANT 提交 1998-10-19 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–216(216 aa)
突变:Q69L MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.2;SEE PUBLICATION, pH 7.2
分辨率 2.15 Å R-free 0.243
3RAN CANINE GDP-RAN Q69L MUTANT 提交 1998-10-19 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 1–216(216 aa)
突变:Q69L MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.2;SEE PUBLICATION, pH 7.2
分辨率 2.15 Å R-free 0.243
3RAN CANINE GDP-RAN Q69L MUTANT 提交 1998-10-19 Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 C 1–216(216 aa)
突变:Q69L MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.2;SEE PUBLICATION, pH 7.2
分辨率 2.15 Å R-free 0.243
3RAN CANINE GDP-RAN Q69L MUTANT 提交 1998-10-19 Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 D 1–216(216 aa)
突变:Q69L MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.2;SEE PUBLICATION, pH 7.2
分辨率 2.15 Å R-free 0.243
3W3Z Crystal structure of Kap121p bound to RanGTP 提交 2012-12-28 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 1–176(176 aa) 片段:UNP residues 1-176
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;0.1M MES, 0.2M CaCl2, 10% PEG 20000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.70 Å R-free 0.298
5BXQ Structure of the NTF2:RanGDP complex 提交 2015-06-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 C 1–216(216 aa)
链 D 1–216(216 aa)
链 E 1–216(216 aa)
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;0.1 M Li2SO4, 50 mM Na Citrate pH5.6, 15% PEG4000
分辨率 2.50 Å R-free 0.225
5YU6 CRYSTAL STRUCTURE OF EXPORTIN-5:RANGTP COMPLEX 提交 2017-11-20 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 B 1–216(216 aa)
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;PEG3350, DTT, MgCl2, spermine tetrahydrochloride
分辨率 3.00 Å R-free 0.269
5YU6 CRYSTAL STRUCTURE OF EXPORTIN-5:RANGTP COMPLEX 提交 2017-11-20 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 D 1–216(216 aa)
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;PEG3350, DTT, MgCl2, spermine tetrahydrochloride
分辨率 3.00 Å R-free 0.269