当前蛋白身份：P63172
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5JPW Molecular basis for protein recognition specificity of the DYNLT1/Tctex1 canonical binding groove. Characterization of the interaction with activin receptor IIB 提交 2016-05-04 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–113（113 aa）
片段：UNP residues 1-113,UNP residues 134-154
链 B
1–113（113 aa）
片段：UNP residues 1-113,UNP residues 134-154
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；298 K；压力 1
NMR样品组成
100 uM DYNLT1/Tctex1-DIC chimera, 100 mM potassium phosphate, 1 mM DTT, 50 uM DSS, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
100 uM [U-99% 15N] DYNLT1/Tctex1-DIC chimera, 100 mM potassium phosphate, 1 mM DTT, 50 uM DSS, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
100 uM [U-99% 13C; U-99% 15N] DYNLT1/Tctex1-DIC chimera, 100 mM potassium phosphate, 1 mM DTT, 50 uM DSS, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 8J07 96nm repeat of human respiratory doublet microtubule and associated axonemal complexes 提交 2023-04-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 974 PDB 声明：974-meric（974） 与蛋白数一致 |
链 l8
1–113（113 aa）
链 n8
1–113（113 aa）
链 p8
1–113（113 aa）
链 r8
1–113（113 aa）
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未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 285 MG MAGNESIUM ION × 285 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 289 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 4.10 Å |
| 8PR0 Cytoplasmic dynein-A heavy chain bound to dynactin-p150glued and IC-LC tower 提交 2023-07-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric（11） 与蛋白数一致 |
链 G
1–113（113 aa）
链 H
1–113（113 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 9.40 Å |
| 8PR1 Cytoplasmic dynein-B heavy chain bound to IC-LC tower 提交 2023-07-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric（12） 与蛋白数一致 |
链 K
1–113（113 aa）
链 L
1–113（113 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.20 Å |
| 8PTK Composite structure of Dynein-Dynactin-JIP3-LIS1 提交 2023-07-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：53-meric（53） 与蛋白数一致 |
链 k
1–113（113 aa）
链 l
1–113（113 aa）
链 v
1–113（113 aa）
链 y
1–113（113 aa）
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未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 16 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 ZN ZINC ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 6 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 10.00 Å |
| 8RGI Structure of DYNLT1:DYNLT2B (TCTEX1:TCTEX1D2) heterodimer. 提交 2023-12-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–113（112 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；DYNLT1-DYNLT2B was crystallized using the hanging-drop vapour diffusion method by mixing 1 ul of protein solution (15 mg/ml) with 1-2 ul of precipitant (1.2-1.4 M potassium sodium tartrate, Tris pH 8-8.5) and incubating at 20 degrees Celsius. Crystals were cryo-protected in mother liquor supplemented with 25-30% glycerol and then flash frozen in liquid nitrogen.
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分辨率 2.02 Å R-free 0.259 |
| 9BLY Composite structure of full-length human dynein-1 in phi-particle conformation 提交 2024-05-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric（12） 与蛋白数一致 |
链 K
1–113（113 aa）
链 L
1–113（113 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2；25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT, 5 mM ATP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 9E12 Full-length human dynein-1 in phi comformation under Lis1 condition 提交 2024-10-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 K
1–113（113 aa）
链 L
1–113（113 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 9E13 Full-length human dynein-1 in phi-like comformation bound to a Lis1 dimer under Lis1 condition 提交 2024-10-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric（14） 与蛋白数一致 |
链 K
1–113（113 aa）
链 L
1–113（113 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2；25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT, 3 mM ATP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 9E14 Full-length human dynein-1 in phi-like comformation bound to a Lis1 dimer under Nde1-Lis1 condition 提交 2024-10-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric（14） 与蛋白数一致 |
链 K
1–113（113 aa）
链 L
1–113（113 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2；25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT, 3 mM ATP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.00 Å |
| 9E23 Cryo-EM structure of Pre-Chi dynein tail 提交 2024-10-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：16-meric（16） 与蛋白数一致 |
链 k
1–113（113 aa）
链 v
1–113（113 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 6.20 Å |
| 9E28 Cryo-EM structure of Phi dynein tail 提交 2024-10-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：16-meric（16） 与蛋白数一致 |
链 k
1–113（113 aa）
链 v
1–113（113 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 4.40 Å |
| 9YNE Motor domain of human dynein-1 in pre-power stroke bound to dynactin-p150glued-CC1B-ICD and LIS1 提交 2025-10-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 k
1–113（113 aa）
链 v
1–113（113 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.46 Å |
| 9YNH Full-length human cytoplasmic dynein-1 in phi-like state bound to dynactin-p150glued and LIS1 提交 2025-10-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric（18） 与蛋白数一致 |
链 K
1–113（113 aa）
链 L
1–113（113 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.50 Å |