当前蛋白身份:Q03468 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
4CVO Crystal structure of the N-terminal colied-coil domain of human DNA excision repair protein ERCC-6 提交 2014-03-28 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 84–160(77 aa) 片段:N-TERMINAL COIED-COIL DOMAIN, RESIDUES 84-160
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 1.6 M MAGNESIUM SULFATE, 0.1 M MES PH 6.6
分辨率 1.85 Å R-free 0.255
7OO3 Pol II-CSB-CSA-DDB1-UVSSA (Structure1) 提交 2021-05-26 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 17 PDB 声明:eicosameric(20) 与全部聚合物一致
链 b 1–1493(1493 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7OOB Pol II-CSB-CSA-DDB1-UVSSA-ADPBeF3 (Structure2) 提交 2021-05-27 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 15 PDB 声明:octadecameric(18) 与全部聚合物一致
链 b 1–1493(1493 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7OOP Pol II-CSB-CSA-DDB1-UVSSA-PAF-SPT6 (Structure 3) 提交 2021-05-28 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 23 PDB 声明:26-meric(26) 与全部聚合物一致
链 b 1–1493(1493 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7OPC Pol II-CSB-CRL4CSA-UVSSA-SPT6-PAF (Structure 4) 提交 2021-05-31 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 25 PDB 声明:28-meric(28) 与全部聚合物一致
链 b 1–1493(1493 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7OPD Pol II-CSB-CRL4CSA-UVSSA-SPT6-PAF (Structure 5) 提交 2021-05-31 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 25 PDB 声明:28-meric(28) 与全部聚合物一致
链 b 1–1493(1493 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8B3D Structure of the Pol II-TCR-ELOF1 complex. 提交 2022-09-16 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 17 PDB 声明:eicosameric(20) 与全部聚合物一致
链 b 1–1493(1493 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
8B3F Pol II-CSB-CSA-DDB1-ELOF1 提交 2022-09-16 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:nonadecameric(19) 与全部聚合物一致
链 b 1–1493(1493 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BZ0 Structure of an STK19-containing TC-NER complex 提交 2024-05-24 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 19 PDB 声明:22-meric(22) 与全部聚合物一致
链 b 1–1493(1493 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 1.90 Å
9ER2 PolII-TCR-STK19 structure. 提交 2024-03-22 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 19 PDB 声明:22-meric(22) 与全部聚合物一致
链 b 1–1493(1493 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9FD2 Structure of Pol II-TC-NER-STK19 complex 提交 2024-05-16 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 19 PDB 声明:22-meric(22) 与全部聚合物一致
链 e 1–1493(1493 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9HWG Structure of the transcribing Pol II-TCR-RECQL5 complex 提交 2025-01-03 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:21-meric(21) 与全部聚合物一致
链 b 1–1493(1493 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;20 mM HEPES pH 7.5, 50 mM KCl, 4 mM MgCl2, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å