当前蛋白身份：Q04712
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5N5Y Cryo-EM structure of RNA polymerase I in complex with Rrn3 and Core Factor (Orientation III) 提交 2017-02-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric（18） 与蛋白数一致 |
链 R
1–507（507 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 SO4 SULFATE ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.70 Å |
| 5N5Z Cryo-EM structure of RNA polymerase I in complex with Rrn3 and Core Factor (Orientation II) 提交 2017-02-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric（18） 与蛋白数一致 |
链 R
1–507（507 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.70 Å |
| 5N60 Cryo-EM structure of RNA polymerase I in complex with Rrn3 and Core Factor (Orientation I) 提交 2017-02-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric（18） 与蛋白数一致 |
链 R
1–507（507 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.70 Å |
| 5N61 RNA polymerase I initially transcribing complex 提交 2017-02-14 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric（21） 与全部聚合物一致 |
链 R
1–507（507 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 5O7X CRYSTAL STRUCTURE OF S. CEREVISIAE CORE FACTOR AT 3.2A RESOLUTION 提交 2017-06-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
1–507（507 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；12% PEG 4000 , 500mM Ammonium sulfate, 100mM MES pH=6.0, 1mM DTT
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.283 |
| 5O7X CRYSTAL STRUCTURE OF S. CEREVISIAE CORE FACTOR AT 3.2A RESOLUTION 提交 2017-06-09 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 F
1–507（507 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；12% PEG 4000 , 500mM Ammonium sulfate, 100mM MES pH=6.0, 1mM DTT
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.283 |
| 5O7X CRYSTAL STRUCTURE OF S. CEREVISIAE CORE FACTOR AT 3.2A RESOLUTION 提交 2017-06-09 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 I
1–507（507 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；12% PEG 4000 , 500mM Ammonium sulfate, 100mM MES pH=6.0, 1mM DTT
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.283 |
| 5O7X CRYSTAL STRUCTURE OF S. CEREVISIAE CORE FACTOR AT 3.2A RESOLUTION 提交 2017-06-09 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 L
1–507（507 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；12% PEG 4000 , 500mM Ammonium sulfate, 100mM MES pH=6.0, 1mM DTT
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.283 |
| 5O7X CRYSTAL STRUCTURE OF S. CEREVISIAE CORE FACTOR AT 3.2A RESOLUTION 提交 2017-06-09 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 O
1–507（507 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；12% PEG 4000 , 500mM Ammonium sulfate, 100mM MES pH=6.0, 1mM DTT
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.283 |
| 5O7X CRYSTAL STRUCTURE OF S. CEREVISIAE CORE FACTOR AT 3.2A RESOLUTION 提交 2017-06-09 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 R
1–507（507 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；12% PEG 4000 , 500mM Ammonium sulfate, 100mM MES pH=6.0, 1mM DTT
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.283 |
| 5OA1 RNA polymerase I pre-initiation complex 提交 2017-06-20 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：34-meric（34） 与全部聚合物一致 |
链 W
1–507（507 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.40 Å |
| 5W5Y RNA polymerase I Initial Transcribing Complex 提交 2017-06-16 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物一致 |
链 Q
1–507（507 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 5W64 RNA Polymerase I Initial Transcribing Complex State 1 提交 2017-06-16 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物一致 |
链 Q
1–507（507 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 5W65 RNA polymerase I Initial Transcribing Complex State 2 提交 2017-06-16 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物一致 |
链 Q
1–507（507 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.30 Å |
| 5W66 RNA polymerase I Initial Transcribing Complex State 3 提交 2017-06-16 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物一致 |
链 Q
1–507（507 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 6RQH RNA Polymerase I Closed Conformation 1 (CC1) 提交 2019-05-15 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物一致 |
链 R
1–507（507 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 6RQL RNA Polymerase I Closed Conformation 2 (CC2) 提交 2019-05-16 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物一致 |
链 R
1–507（507 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 6RRD RNA Polymerase I Pre-initiation complex DNA opening intermediate 1 提交 2019-05-17 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物一致 |
链 R
1–507（507 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 6RUI RNA Polymerase I Pre-initiation complex DNA opening intermediate 2 提交 2019-05-28 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物一致 |
链 R
1–507（507 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 6RUO RNA Polymerase I Open Complex conformation 1 提交 2019-05-28 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物一致 |
链 R
1–507（507 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 6RWE RNA Polymerase I Open Complex conformation 2 提交 2019-06-04 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物一致 |
链 R
1–507（507 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 6TPS early intermediate RNA Polymerase I Pre-initiation complex - eiPIC 提交 2019-12-14 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物一致 |
链 R
1–507（507 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.54 Å |