当前蛋白身份：Q08278
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1YKE Structure of the mediator MED7/MED21 subcomplex 提交 2005-01-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
102–205（104 aa）
片段：residues 102-205
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；sodium chloride, PEG 6000, ethanol, b-mercaptoethanol, EDTA, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.314 |
| 1YKE Structure of the mediator MED7/MED21 subcomplex 提交 2005-01-18 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
102–205（104 aa）
片段：residues 102-205
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；sodium chloride, PEG 6000, ethanol, b-mercaptoethanol, EDTA, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.314 |
| 1YKE Structure of the mediator MED7/MED21 subcomplex 提交 2005-01-18 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
102–205（104 aa）
片段：residues 102-205
链 C
102–205（104 aa）
片段：residues 102-205
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；sodium chloride, PEG 6000, ethanol, b-mercaptoethanol, EDTA, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.314 |
| 1YKH Structure of the mediator MED7/MED21 (Med7/Srb7) subcomplex 提交 2005-01-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
102–205（104 aa）
片段：residues 102-205
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；PEG400, sodium acetate, b-mercaptoethanol, EDTA, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
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分辨率 3.00 Å R-free 0.289 |
| 3FBI Structure of the Mediator submodule Med7N/31 提交 2008-11-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–83（82 aa）
片段：N-terminal domain, UNP residues 2-83
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；50mM MES pH 5.6, 1.8M Li2SO4, 10mM MgCl2, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.243 |
| 3FBI Structure of the Mediator submodule Med7N/31 提交 2008-11-19 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
2–83（82 aa）
片段：N-terminal domain, UNP residues 2-83
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；50mM MES pH 5.6, 1.8M Li2SO4, 10mM MgCl2, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.243 |
| 3FBN Structure of the Mediator submodule Med7N/31 提交 2008-11-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–83（82 aa）
片段：N-terminal domain, UNP residues 2-83
|
突变：L13Y, Y14S, P16T, P17S, P19S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；50mM MES pH 5.6, 1.8M Li2SO4, 10mM MgCl2, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 3.01 Å R-free 0.231 |
| 3FBN Structure of the Mediator submodule Med7N/31 提交 2008-11-19 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
2–83（82 aa）
片段：N-terminal domain, UNP residues 2-83
|
突变：L13Y, Y14S, P16T, P17S, P19S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；50mM MES pH 5.6, 1.8M Li2SO4, 10mM MgCl2, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 3.01 Å R-free 0.231 |
| 3FBN Structure of the Mediator submodule Med7N/31 提交 2008-11-19 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
2–83（82 aa）
片段：N-terminal domain, UNP residues 2-83
链 C
2–83（82 aa）
片段：N-terminal domain, UNP residues 2-83
|
突变：L13Y, Y14S, P16T, P17S, P19S 突变：L13Y, Y14S, P16T, P17S, P19S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；50mM MES pH 5.6, 1.8M Li2SO4, 10mM MgCl2, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 3.01 Å R-free 0.231 |
| 5OQM STRUCTURE OF YEAST TRANSCRIPTION PRE-INITIATION COMPLEX WITH TFIIH AND CORE MEDIATOR 提交 2017-08-13 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：46-meric（46） 与全部聚合物一致 |
链 i
1–222（222 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 8 s and plunge-frozen in liquid ethane.
|
分辨率 5.80 Å |
| 5SVA Mediator-RNA Polymerase II Pre-Initiation Complex 提交 2016-08-05 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：40-meric（40） 与全部聚合物一致 |
链 U
1–222（222 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 15.30 Å |
| 7UI9 Core Mediator-PICearly (Copy A) 提交 2022-03-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric（33） 与蛋白数一致 |
链 g
1–222（222 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 7UIF Mediator-PIC Early (Core B) 提交 2022-03-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric（33） 与蛋白数一致 |
链 g
1–222（222 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.60 Å |
| 7UIG Mediator-PIC Early (Mediator A) 提交 2022-03-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric（17） 与蛋白数一致 |
链 g
1–222（222 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.30 Å |
| 7UIO Mediator-PIC Early (Composite Model) 提交 2022-03-29 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：80-meric（80） 与全部聚合物一致 |
链 Ag
1–222（222 aa）
链 Bg
1–222（222 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 THR THREONINE × 1 ALA ALANINE × 1 ASP ASPARTIC ACID × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |