当前蛋白身份:Q12834 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
4GGA Structural Analysis of Human Cdc20 Supports Multi-site Degron Recognition by APC/C 提交 2012-08-06 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 81–499(419 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;293 K;100 mM Na citrate, 15 % (w/v) PEG 6000, and 4% MPD, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.04 Å R-free 0.203
4GGC Structural Analysis of Human Cdc20 Supports Multi-site Degron Recognition by APC/C 提交 2012-08-06 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 161–477(317 aa)
未记录 MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;100 mM MES, 15% (w/v) PEG 6000, and 5% MPD, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.35 Å R-free 0.146
4GGD Structural analysis of human Cdc20 supports multisite degron recognition by APC/C. 提交 2012-08-06 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 71–499(429 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 sitting-drop vapor diffusion;pH 9.3;293 K;50 mM CAPSO, 5% (w/v) PEG 6000, and 15.5 % MPD, pH 9.3, sitting-drop vapor diffusion, temperature 293K
分辨率 2.44 Å R-free 0.201
4GGD Structural analysis of human Cdc20 supports multisite degron recognition by APC/C. 提交 2012-08-06 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 71–499(429 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 sitting-drop vapor diffusion;pH 9.3;293 K;50 mM CAPSO, 5% (w/v) PEG 6000, and 15.5 % MPD, pH 9.3, sitting-drop vapor diffusion, temperature 293K
分辨率 2.44 Å R-free 0.201
4N14 Crystal structure of Cdc20 and apcin complex 提交 2013-10-03 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 165–477(313 aa) 片段:WD domain residues 165-477
未记录 WR7 2-(2-methyl-5-nitro-1H-imidazol-1-yl)ethyl [(1R)-2,2,2-trichloro-1-(pyrimidin-2-ylamino)ethyl]carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;100 mM MES, 15% (w/v) PEG 6000, and 5% MPD, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.10 Å R-free 0.213
5G04 Structure of the human APC-Cdc20-Hsl1 complex 提交 2016-03-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 21 PDB 声明:21-meric(21) 与蛋白数一致
链 R 1–499(499 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20MM HEPES, 150MM NACL, 0. 5MM TCEP;pH 8;20MM HEPES, 150MM NACL, 0. 5MM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;LIQUID ETHANE
分辨率 3.90 Å
5KHR Model of human Anaphase-promoting complex/Cyclosome complex (APC15 deletion mutant) in complex with the E2 UBE2C/UBCH10 poised for ubiquitin ligation to substrate (APC/C-CDC20-substrate-UBE2C) 提交 2016-06-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 21 PDB 声明:21-meric(21) 与蛋白数一致
链 R 1–499(499 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.10 Å
5KHU Model of human Anaphase-promoting complex/Cyclosome (APC15 deletion mutant), in complex with the Mitotic checkpoint complex (APC/C-CDC20-MCC) based on cryo EM data at 4.8 Angstrom resolution 提交 2016-06-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 23 PDB 声明:23-meric(23) 与蛋白数一致
链 R 1–499(499 aa)
链 S 1–499(499 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
5LCW Cryo-EM structure of the Anaphase-promoting complex/Cyclosome, in complex with the Mitotic checkpoint complex (APC/C-MCC) at 4.2 angstrom resolution 提交 2016-06-22 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 23 PDB 声明:23-meric(23) 与蛋白数一致
链 Q 126–499(374 aa)
链 R 1–499(499 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6F0X Cryo-EM structure of TRIP13 in complex with ATP gamma S, p31comet, C-Mad2 and Cdc20 提交 2017-11-20 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric(9) 与蛋白数一致
链 Q 1–499(499 aa)
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
6Q6G Cryo-EM structure of the APC/C-Cdc20-Cdk2-cyclinA2-Cks2 complex, the D1 box class 提交 2018-12-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 21 PDB 声明:21-meric(21) 与蛋白数一致
链 R 1–499(499 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8;20mM Hepes, 150mM NaCl, 0.5mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6Q6H Cryo-EM structure of the APC/C-Cdc20-Cdk2-cyclinA2-Cks2 complex, the D2 box class 提交 2018-12-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 21 PDB 声明:21-meric(21) 与蛋白数一致
链 R 1–499(499 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8;20mM Hepes, 150mM NaCl, 0.5mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6TLJ Cryo-EM structure of the Anaphase-promoting complex/Cyclosome, in complex with the Mitotic checkpoint complex (APC/C-MCC) at 3.8 angstrom resolution 提交 2019-12-02 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 23 PDB 声明:23-meric(23) 与蛋白数一致
链 Q 126–499(374 aa)
链 R 1–499(499 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
9I68 Crystal structure of human Cdc20 bound to synthetic D-box peptide D21 提交 2025-01-29 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–499(499 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 6.5;293 K;10 % MPD, 12-14 % PEG 6000, 0.1 M MES pH 6.5
分辨率 1.50 Å R-free 0.194
9I69 Crystal structure of human Cdc20 bound to synthetic D-box peptide D20 提交 2025-01-29 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–499(499 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 6.5;293 K;10 % MPD, 12-14 % PEG 6000, 0.1 M MES pH 6.5
分辨率 1.46 Å R-free 0.184
9I6A Crystal structure of human Cdc20 bound to synthetic D-box peptide D7 提交 2025-01-29 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–499(499 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 6.5;293 K;10 % MPD, 12-14 % PEG 6000, 0.1 M MES pH 6.5
分辨率 1.92 Å R-free 0.231
9N9R Model of APC/C-CDC20-UBE2C from H2A/H2B-bound complex 提交 2025-02-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 21 PDB 声明:21-meric(21) 与蛋白数一致
链 R 1–499(499 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.90 Å
9N9S Model of APC/C-CDC20-UBE2C from H3/H4-bound complex 提交 2025-02-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 21 PDB 声明:21-meric(21) 与蛋白数一致
链 R 1–499(499 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.90 Å