当前蛋白身份:Q12933 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1CA4 STRUCTURE OF TNF RECEPTOR ASSOCIATED FACTOR 2 (TRAF2) 提交 1999-02-23 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 334–501(168 aa) 片段:TRAF DOMAIN
链 B 334–501(168 aa) 片段:TRAF DOMAIN
链 C 334–501(168 aa) 片段:TRAF DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6;pH 6.0
分辨率 2.20 Å R-free 0.251
1CA4 STRUCTURE OF TNF RECEPTOR ASSOCIATED FACTOR 2 (TRAF2) 提交 1999-02-23 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 D 334–501(168 aa) 片段:TRAF DOMAIN
链 E 334–501(168 aa) 片段:TRAF DOMAIN
链 F 334–501(168 aa) 片段:TRAF DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6;pH 6.0
分辨率 2.20 Å R-free 0.251
1CA9 STRUCTURE OF TNF RECEPTOR ASSOCIATED FACTOR 2 IN COMPLEX WITH A PEPTIDE FROM TNF-R2 提交 1999-02-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 A 310–501(192 aa) 片段:TRAF DOMAIN
链 B 310–501(192 aa) 片段:TRAF DOMAIN
链 C 310–501(192 aa) 片段:TRAF DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.6;pH 5.6
分辨率 2.30 Å R-free 0.289
1CA9 STRUCTURE OF TNF RECEPTOR ASSOCIATED FACTOR 2 IN COMPLEX WITH A PEPTIDE FROM TNF-R2 提交 1999-02-25 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 D 310–501(192 aa) 片段:TRAF DOMAIN
链 E 310–501(192 aa) 片段:TRAF DOMAIN
链 F 310–501(192 aa) 片段:TRAF DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.6;pH 5.6
分辨率 2.30 Å R-free 0.289
1CA9 STRUCTURE OF TNF RECEPTOR ASSOCIATED FACTOR 2 IN COMPLEX WITH A PEPTIDE FROM TNF-R2 提交 1999-02-25 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 310–501(192 aa) 片段:TRAF DOMAIN
链 B 310–501(192 aa) 片段:TRAF DOMAIN
链 C 310–501(192 aa) 片段:TRAF DOMAIN
链 D 310–501(192 aa) 片段:TRAF DOMAIN
链 E 310–501(192 aa) 片段:TRAF DOMAIN
链 F 310–501(192 aa) 片段:TRAF DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.6;pH 5.6
分辨率 2.30 Å R-free 0.289
1CZY CRYSTAL STRUCTURE OF THE COMPLEX BETWEEN THE TRAF DOMAIN OF HUMAN TRAF2 AND AN LMP1 BINDING PEPTIDE 提交 1999-09-07 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 A 334–501(168 aa) 片段:TRAF DOMAIN
链 B 334–501(168 aa) 片段:TRAF DOMAIN
链 C 334–501(168 aa) 片段:TRAF DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 6;293 K;PEG4K, MES BUFFER, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, temperature 20K
分辨率 2.00 Å R-free 0.245
1CZZ STRUCTURE OF TNF RECEPTOR ASSOCIATED FACTOR 2 IN COMPLEX WITH A 17-RESIDUE CD40 PEPTIDE 提交 1999-09-07 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 A 315–501(187 aa) 片段:TRAF DOMAIN
链 B 315–501(187 aa) 片段:TRAF DOMAIN
链 C 315–501(187 aa) 片段:TRAF DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 5.6;293 K;PEG4K, MES, PH 5.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 2.70 Å R-free 0.267
1D01 STRUCTURE OF TNF RECEPTOR ASSOCIATED FACTOR 2 IN COMPLEX WITH A HUMAN CD30 PEPTIDE 提交 1999-09-07 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 334–501(168 aa) 片段:TRAF DOMAIN
链 B 334–501(168 aa) 片段:TRAF DOMAIN
链 C 334–501(168 aa) 片段:TRAF DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 6;293 K;PEG4K, MES, PH 6.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 20K
分辨率 2.00 Å R-free 0.244
1D01 STRUCTURE OF TNF RECEPTOR ASSOCIATED FACTOR 2 IN COMPLEX WITH A HUMAN CD30 PEPTIDE 提交 1999-09-07 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 D 334–501(168 aa) 片段:TRAF DOMAIN
链 E 334–501(168 aa) 片段:TRAF DOMAIN
链 F 334–501(168 aa) 片段:TRAF DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 6;293 K;PEG4K, MES, PH 6.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 20K
分辨率 2.00 Å R-free 0.244
1D0A STRUCTURE OF TNF RECEPTOR ASSOCIATED FACTOR 2 (TRAF2) IN COMPLEX WITH A HUMAN OX40 PEPTIDE 提交 1999-09-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 334–501(168 aa) 片段:TRAF DOMAIN
链 B 334–501(168 aa) 片段:TRAF DOMAIN
链 C 334–501(168 aa) 片段:TRAF DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 6;293 K;PEG4K, MES, PH 6.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 2.00 Å R-free 0.251
1D0A STRUCTURE OF TNF RECEPTOR ASSOCIATED FACTOR 2 (TRAF2) IN COMPLEX WITH A HUMAN OX40 PEPTIDE 提交 1999-09-09 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 D 334–501(168 aa) 片段:TRAF DOMAIN
链 E 334–501(168 aa) 片段:TRAF DOMAIN
链 F 334–501(168 aa) 片段:TRAF DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 6;293 K;PEG4K, MES, PH 6.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 2.00 Å R-free 0.251
1D0A STRUCTURE OF TNF RECEPTOR ASSOCIATED FACTOR 2 (TRAF2) IN COMPLEX WITH A HUMAN OX40 PEPTIDE 提交 1999-09-09 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 A 334–501(168 aa) 片段:TRAF DOMAIN
链 B 334–501(168 aa) 片段:TRAF DOMAIN
链 C 334–501(168 aa) 片段:TRAF DOMAIN
链 D 334–501(168 aa) 片段:TRAF DOMAIN
链 E 334–501(168 aa) 片段:TRAF DOMAIN
链 F 334–501(168 aa) 片段:TRAF DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 6;293 K;PEG4K, MES, PH 6.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 2.00 Å R-free 0.251
1D0A STRUCTURE OF TNF RECEPTOR ASSOCIATED FACTOR 2 (TRAF2) IN COMPLEX WITH A HUMAN OX40 PEPTIDE 提交 1999-09-09 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 A 334–501(168 aa) 片段:TRAF DOMAIN
链 B 334–501(168 aa) 片段:TRAF DOMAIN
链 C 334–501(168 aa) 片段:TRAF DOMAIN
链 D 334–501(168 aa) 片段:TRAF DOMAIN
链 E 334–501(168 aa) 片段:TRAF DOMAIN
链 F 334–501(168 aa) 片段:TRAF DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 6;293 K;PEG4K, MES, PH 6.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 2.00 Å R-free 0.251
1D0J STRUCTURE OF TNF RECEPTOR ASSOCIATED FACTOR 2 IN COMPLEX WITH A M4-1BB PEPTIDE 提交 1999-09-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 A 334–501(168 aa) 片段:TRAF DOMAIN
链 B 334–501(168 aa) 片段:TRAF DOMAIN
链 C 334–501(168 aa) 片段:TRAF DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 6;293 K;PEG4K, MES PH 6.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 2.50 Å R-free 0.270
1D0J STRUCTURE OF TNF RECEPTOR ASSOCIATED FACTOR 2 IN COMPLEX WITH A M4-1BB PEPTIDE 提交 1999-09-10 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 D 334–501(168 aa) 片段:TRAF DOMAIN
链 E 334–501(168 aa) 片段:TRAF DOMAIN
链 F 334–501(168 aa) 片段:TRAF DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 6;293 K;PEG4K, MES PH 6.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 2.50 Å R-free 0.270
1D0J STRUCTURE OF TNF RECEPTOR ASSOCIATED FACTOR 2 IN COMPLEX WITH A M4-1BB PEPTIDE 提交 1999-09-10 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 11 PDB 声明:undecameric(11) 与蛋白数一致
链 A 334–501(168 aa) 片段:TRAF DOMAIN
链 B 334–501(168 aa) 片段:TRAF DOMAIN
链 C 334–501(168 aa) 片段:TRAF DOMAIN
链 D 334–501(168 aa) 片段:TRAF DOMAIN
链 E 334–501(168 aa) 片段:TRAF DOMAIN
链 F 334–501(168 aa) 片段:TRAF DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 6;293 K;PEG4K, MES PH 6.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 2.50 Å R-free 0.270
1D0J STRUCTURE OF TNF RECEPTOR ASSOCIATED FACTOR 2 IN COMPLEX WITH A M4-1BB PEPTIDE 提交 1999-09-10 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 11 PDB 声明:undecameric(11) 与蛋白数一致
链 A 334–501(168 aa) 片段:TRAF DOMAIN
链 B 334–501(168 aa) 片段:TRAF DOMAIN
链 C 334–501(168 aa) 片段:TRAF DOMAIN
链 D 334–501(168 aa) 片段:TRAF DOMAIN
链 E 334–501(168 aa) 片段:TRAF DOMAIN
链 F 334–501(168 aa) 片段:TRAF DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 6;293 K;PEG4K, MES PH 6.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 2.50 Å R-free 0.270
1F3V Crystal structure of the complex between the N-terminal domain of TRADD and the TRAF domain of TRAF2 提交 2000-06-06 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 331–501(171 aa) 片段:TRAF DOMAIN
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;293 K;VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 2.00 Å R-free 0.261
1QSC CRYSTAL STRUCTURE OF THE TRAF DOMAIN OF TRAF2 IN A COMPLEX WITH A PEPTIDE FROM THE CD40 RECEPTOR 提交 1999-06-20 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 311–501(191 aa) 片段:TRAF DOMAIN
链 B 311–501(191 aa) 片段:TRAF DOMAIN
链 C 311–501(191 aa) 片段:TRAF DOMAIN
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;MME-PEG 2000, MAGNESIUM CHLORIDE, BISTRIS PROPANE, pH 7.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.00K
分辨率 2.40 Å R-free 0.257
3KNV Crystal structure of the RING and first zinc finger domains of TRAF2 提交 2009-11-12 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–133(133 aa) 片段:RING and the first zinc finger domains: UNP residues 1-133
未记录 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;10% PEG 8000, 0.1 M HEPES pH 7.5, 8% Ethylene glycol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.90 Å R-free 0.239
3M06 Crystal Structure of TRAF2 提交 2010-03-02 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 266–329(64 aa) 片段:Residues 266-329
链 B 266–329(64 aa) 片段:Residues 266-329
链 C 266–329(64 aa) 片段:Residues 266-329
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;293 K;8% PEG3350, 6% Tacsimate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.67 Å R-free 0.233
3M06 Crystal Structure of TRAF2 提交 2010-03-02 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 D 266–329(64 aa) 片段:Residues 266-329
链 E 266–329(64 aa) 片段:Residues 266-329
链 F 266–329(64 aa) 片段:Residues 266-329
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;293 K;8% PEG3350, 6% Tacsimate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.67 Å R-free 0.233
3M0A Crystal structure of TRAF2:cIAP2 complex 提交 2010-03-02 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 266–329(64 aa) 片段:Residues 266-329
链 B 266–329(64 aa) 片段:Residues 266-329
链 C 266–329(64 aa) 片段:Residues 266-329
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;293 K;8% PEG 3350, 6% Tacsimate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.61 Å R-free 0.268
3M0D Crystal structure of the TRAF1:TRAF2:cIAP2 complex 提交 2010-03-02 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 266–329(64 aa) 片段:Residues 266-329
链 B 266–329(64 aa) 片段:Residues 266-329
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;277 K;0.15M AmSO4, 0.1M MES, 15% PEG 4000, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.80 Å R-free 0.247
3M0D Crystal structure of the TRAF1:TRAF2:cIAP2 complex 提交 2010-03-02 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 266–329(64 aa) 片段:Residues 266-329
链 B 266–329(64 aa) 片段:Residues 266-329
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;277 K;0.15M AmSO4, 0.1M MES, 15% PEG 4000, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.80 Å R-free 0.247
8T5Q SARS-CoV-2 ORF3a peptide in complex with TRAF2 TRAF domain 提交 2023-06-14 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 A 315–501(187 aa) 片段:TRAF domain (UNP residues 315-501)
链 B 315–501(187 aa) 片段:TRAF domain (UNP residues 315-501)
链 C 315–501(187 aa) 片段:TRAF domain (UNP residues 315-501)
未记录 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;277.15 K;0.1 M sodium citrate, pH 5.0, 20% w/v PEG8000
分辨率 1.90 Å R-free 0.240
8T5Q SARS-CoV-2 ORF3a peptide in complex with TRAF2 TRAF domain 提交 2023-06-14 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 D 315–501(187 aa) 片段:TRAF domain (UNP residues 315-501)
链 E 315–501(187 aa) 片段:TRAF domain (UNP residues 315-501)
链 F 315–501(187 aa) 片段:TRAF domain (UNP residues 315-501)
未记录 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;277.15 K;0.1 M sodium citrate, pH 5.0, 20% w/v PEG8000
分辨率 1.90 Å R-free 0.240