当前蛋白身份：Q12959
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1PDR CRYSTAL STRUCTURE OF THE THIRD PDZ DOMAIN FROM THE HUMAN HOMOLOG OF DISCS LARGE PROTEIN 提交 1996-07-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
457–555（99 aa）
片段：PDZ3 DOMAIN, DHR3 DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.80 Å R-free 0.271 |
| 2M3M Solution structure of a complex consisting of hDlg/SAP-97 residues 318-406 and HPV51 oncoprotein E6 residues 141-151 提交 2013-01-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
318–406（89 aa）
片段：hDlgPDZ2, UNP residues 318-406
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；293 K；离子强度（mmCIF原始值）20；压力 ambient
NMR样品组成
0.8 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] hDlgPDZ2, 2.0 mM E6CT11, 20 mM sodium phosphate, 4 mM TCEP, 0.05 w/v sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.8 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] hDlgPDZ2, 2.0 mM E6CT11, 20 mM sodium phosphate, 4 mM TCEP, 0.05 w/v sodium azide, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
3.12 mM hDlgPDZ2, 1.25 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] E6CT11, 20 mM sodium phosphate, 4 mM TCEP, 0.05 w/v sodium azide, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
3.12 mM hDlgPDZ2, 1.25 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] E6CT11, 20 mM sodium phosphate, 4 mM TCEP, 0.05 w/v sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2OQS Structure of the hDLG/SAP97 PDZ2 in complex with HPV-18 papillomavirus E6 peptide 提交 2007-02-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
318–405（88 aa）
片段：second PDZ domain, residues 318-406
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；293 K；离子强度（mmCIF原始值）28.2 mM；压力 ambient
NMR测量条件
pH 6.5；293 K；离子强度（mmCIF原始值）28.2 mM；压力 ambient
NMR测量条件
pH 6.5；293 K；离子强度（mmCIF原始值）28.2 mM；压力 ambient
NMR测量条件
pH 6.5；293 K；离子强度（mmCIF原始值）28.2 mM；压力 ambient
NMR测量条件
pH 6.5；293 K；离子强度（mmCIF原始值）28.2 mM；压力 ambient
NMR测量条件
pH 6.5；293 K；离子强度（mmCIF原始值）28.2 mM；压力 ambient
NMR样品组成
2mM hDLG/SAP97 PDZ2 domain, 3mM HPV-18 E6 peptide, 4 mM TCEP, 20 uM DSS, 20mM phosphate buffer, pH 6.5, 99.5% D2O | 99.5% D2O
NMR样品组成
2mM hDLG/SAP97 PDZ2 domain U-15N, 3mM HPV-18 E6 peptide, 4 mM TCEP, 20 uM DSS, 20mM phosphate buffer, pH 6.5, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
2 mM hDLG/SAP97 PDZ2 domain U-15N, 13C, 3 mM HPV-18 E6 peptide, 4 mM TCEP, 20 uM DSS, 20 mM phosphate buffer, pH 6.5, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
2 mM hDLG/SAP97 PDZ2 domain, U-15N, U-10%13C, 3 mM HPV-18 E6 peptide, 4 mM TCEP, 20 uM DSS, 20mM phosphate buffer, pH 6.5 | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
2 mM hDLG/SAP97 PDZ2 domain, U-15N, 3 mM HPV-18 E6 peptide, 5% C8E5, C8E5/n-octanol 0.87, 4 mM TCEP, 20 uM DSS, 20mM phosphate buffer, pH 6.5, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
2 mM hDLG/SAP97 PDZ2 domain, U-15N, 3 mM HPV-18 E6 peptide, 10 mg/ml pf1 phage, 4 mM TCEP, 20 uM DSS, 20mM phosphate buffer, pH 6.5,90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 2X7Z Crystal Structure of the SAP97 PDZ2 I342W C378A mutant protein domain 提交 2010-03-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
260–356（97 aa）
片段：PDZ2 DOMAIN, RESIDUES 260-356
|
突变：YES | NH4 AMMONIUM ION × 2 IMD IMIDAZOLE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.4；VAPOR DIFFUSION, 100MM TRIS-HCL PH 8.4, 2.4M AMMONIUM SULPHATE
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.232 |
| 3LRA Structural Basis for Assembling a Human Tripartite Complex Dlg1-MPP7-Mals3 提交 2010-02-10 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–65（64 aa）
片段：L27 domain, L27 1/2 domain
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10% PEG 8000, 0.2M MgCl2, 0.1M Guanidine HCl, 0.1M Tris-HCl, pH7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.284 |
| 3RL7 Crystal structure of hDLG1-PDZ1 complexed with APC 提交 2011-04-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
220–317（98 aa）
片段：UNP RESIDUES 220-317
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；287 K；0.8M Na2HPO4, 0.9M KH2PO4, pH 7.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 287K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.231 |
| 3RL7 Crystal structure of hDLG1-PDZ1 complexed with APC 提交 2011-04-19 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
220–317（98 aa）
片段：UNP RESIDUES 220-317
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；287 K；0.8M Na2HPO4, 0.9M KH2PO4, pH 7.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 287K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.231 |
| 3RL7 Crystal structure of hDLG1-PDZ1 complexed with APC 提交 2011-04-19 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
220–317（98 aa）
片段：UNP RESIDUES 220-317
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；287 K；0.8M Na2HPO4, 0.9M KH2PO4, pH 7.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 287K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.231 |
| 3RL7 Crystal structure of hDLG1-PDZ1 complexed with APC 提交 2011-04-19 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
220–317（98 aa）
片段：UNP RESIDUES 220-317
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；287 K；0.8M Na2HPO4, 0.9M KH2PO4, pH 7.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 287K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.231 |
| 3RL7 Crystal structure of hDLG1-PDZ1 complexed with APC 提交 2011-04-19 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
220–317（98 aa）
片段：UNP RESIDUES 220-317
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；287 K；0.8M Na2HPO4, 0.9M KH2PO4, pH 7.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 287K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.231 |
| 3RL7 Crystal structure of hDLG1-PDZ1 complexed with APC 提交 2011-04-19 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
220–317（98 aa）
片段：UNP RESIDUES 220-317
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；287 K；0.8M Na2HPO4, 0.9M KH2PO4, pH 7.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 287K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.231 |
| 3RL8 Crystal structure of hDLG1-PDZ2 complexed with APC 提交 2011-04-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
315–410（96 aa）
片段：UNP RESIDUES 315-410
链 B
315–410（96 aa）
片段：UNP RESIDUES 315-410
链 C
315–410（96 aa）
片段：UNP RESIDUES 315-410
链 D
315–410（96 aa）
片段：UNP RESIDUES 315-410
链 E
315–410（96 aa）
片段：UNP RESIDUES 315-410
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；287 K；0.8M Na2HPO4, 0.9M KH2PO4, pH 7.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 287K
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分辨率 2.20 Å R-free 0.245 |
| 4AMH Influence of circular permutation on the folding pathway of a PDZ domain 提交 2012-03-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
327–405（79 aa）
片段：PDZ2 DOMAIN
链 A
315–326（12 aa）
片段：PDZ2 DOMAIN
链 B
327–405（79 aa）
片段：PDZ2 DOMAIN
链 B
315–326（12 aa）
片段：PDZ2 DOMAIN
|
突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES | TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；SITTING DROP VAPOR DIFFUSION, 0.1 M MES PH 6.0, 2.4 M AMMONIUM SULFATE
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分辨率 2.30 Å R-free 0.268 |
| 4G69 Structure of the Human Discs Large 1 PDZ2 - Adenomatous Polyposis Coli Cytoskeletal Polarity Complex 提交 2012-07-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
310–407（98 aa）
片段：PDZ2, UNP residues 310-407
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.25；300 K；Protein solution: 1.4 mM Dlg1 PDZ2, 1.7 mM APC, 100 mM NaCl, 25 mM Tris pH 7.0, 0.1% B-ME
Well: 200 mM sodium acetate, 100 mM sodium cacodylate pH 6.25, 28% PEG 8000
Drop = 1:1 protein:well solution , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
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分辨率 2.00 Å R-free 0.183 |
| 7PC3 The second PDZ domain of DLG1 complexed with the PDZ-binding motif of HTLV1-TAX1 提交 2021-08-03 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
314–413（100 aa）
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未记录 | CA CALCIUM ION × 4 GOL GLYCEROL × 4 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Lithium sulfate, 0.1 M bis-Tris pH 5.5, 25% w/v PEG 3350
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.201 |
| 8CN1 hDLG1-PDZ1 in complex with a TAX1 peptide from HTLV-1 提交 2023-02-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
219–311（93 aa）
链 B
219–311（93 aa）
链 C
219–311（93 aa）
链 D
219–311（93 aa）
链 E
219–311（93 aa）
链 F
219–311（93 aa）
链 G
219–311（93 aa）
链 H
219–311（93 aa）
链 I
219–311（93 aa）
链 J
219–311（93 aa）
链 K
219–311（93 aa）
链 L
219–311（93 aa）
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 9 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 0.18 M (NH4)2SO4, 24% PEG3350
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分辨率 2.09 Å R-free 0.246 |
| 8CN3 hDLG1-PDZ2 in complex with a TAX1 peptide from HTLV-1 提交 2023-02-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
260–371（112 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 0.075M (NH4)2SO4, 24% PEG3350
|
分辨率 2.71 Å R-free 0.259 |
| 8CN3 hDLG1-PDZ2 in complex with a TAX1 peptide from HTLV-1 提交 2023-02-21 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
195–306（112 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 0.075M (NH4)2SO4, 24% PEG3350
|
分辨率 2.71 Å R-free 0.259 |