当前蛋白身份:Q13158
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1A1W FADD DEATH EFFECTOR DOMAIN, F25Y MUTANT, NMR MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE 提交 1997-12-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–83(83 aa)
片段:DEATH EFFECTOR DOMAIN
|
突变:F25Y | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 4;288 K
|
分辨率未提供 |
| 1A1Z FADD DEATH EFFECTOR DOMAIN, F25G MUTANT, NMR MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE 提交 1997-12-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–83(83 aa)
片段:DEATH EFFECTOR DOMAIN
|
突变:F25G | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 4;288 K;离子强度(mmCIF原始值)100 mM;压力 1
NMR样品组成
H2O
|
分辨率未提供 |
| 1E3Y Death domain from human FADD/MORT1 提交 2000-06-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
93–192(100 aa)
片段:DEATH DOMAIN RESIDUES 93-192
|
突变:YES | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.2;298 K;离子强度(mmCIF原始值)50 MM PHOSPHATE BUFFER, 150MM NACL;压力 1
|
分辨率未提供 |
| 1E41 Death domain from human FADD/MORT1 提交 2000-06-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
93–192(100 aa)
片段:DEATH DOMAIN RESIDUES 93-192
|
突变:YES | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.2;298 K;离子强度(mmCIF原始值)50 MM PHOSPHATE BUFFER, 150MM NACL;压力 1
|
分辨率未提供 |
| 2GF5 Structure of intact FADD (MORT1) 提交 2006-03-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
2–191(190 aa)
|
突变:F25Y | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7;288 K;离子强度(mmCIF原始值)200mM phosphate;压力 1
NMR样品组成
200mM phosphate buffer, 95% H2O 5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 3EZQ Crystal Structure of the Fas/FADD Death Domain Complex 提交 2008-10-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 B
93–208(116 aa)
片段:Fadd DD, UNP residues 93-208
链 D
93–208(116 aa)
片段:Fadd DD, UNP residues 93-208
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 4;291 K;0.95M citric acid, 1.9M ammonium sulfate, pH4, EVAPORATION, temperature 291K
|
分辨率 2.73 Å R-free 0.278 |
| 3EZQ Crystal Structure of the Fas/FADD Death Domain Complex 提交 2008-10-23 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 F
93–208(116 aa)
片段:Fadd DD, UNP residues 93-208
链 H
93–208(116 aa)
片段:Fadd DD, UNP residues 93-208
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 3 NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 4;291 K;0.95M citric acid, 1.9M ammonium sulfate, pH4, EVAPORATION, temperature 291K
|
分辨率 2.73 Å R-free 0.278 |
| 3EZQ Crystal Structure of the Fas/FADD Death Domain Complex 提交 2008-10-23 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 J
93–208(116 aa)
片段:Fadd DD, UNP residues 93-208
链 L
93–208(116 aa)
片段:Fadd DD, UNP residues 93-208
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 4;291 K;0.95M citric acid, 1.9M ammonium sulfate, pH4, EVAPORATION, temperature 291K
|
分辨率 2.73 Å R-free 0.278 |
| 3EZQ Crystal Structure of the Fas/FADD Death Domain Complex 提交 2008-10-23 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 N
93–208(116 aa)
片段:Fadd DD, UNP residues 93-208
链 P
93–208(116 aa)
片段:Fadd DD, UNP residues 93-208
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 3 NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 4;291 K;0.95M citric acid, 1.9M ammonium sulfate, pH4, EVAPORATION, temperature 291K
|
分辨率 2.73 Å R-free 0.278 |
| 3OQ9 Structure of the FAS/FADD death domain assembly 提交 2010-09-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致 |
链 H
93–184(92 aa)
片段:UNP residues 93-184
链 I
93–184(92 aa)
片段:UNP residues 93-184
链 J
93–184(92 aa)
片段:UNP residues 93-184
链 K
93–184(92 aa)
片段:UNP residues 93-184
链 L
93–184(92 aa)
片段:UNP residues 93-184
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
hanging drop;pH 8.5;298 K;0.1 M Tris pH 8.5, 100 mM MgCl2, 5 % glycerol and 6-10 % PEG4000, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 6.80 Å R-free 0.354 |
| 6ACI Crystal structure of EPEC effector NleB in complex with FADD death domain 提交 2018-07-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 H
93–184(92 aa)
|
未记录 | UDP URIDINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MN MANGANESE (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;4.5 M Sodium chloride, 100 mM HEPES pH 7.5
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.209 |
| 8YBX Structure of the FADD/Caspase-8/cFLIP death effector domain assembly 提交 2024-02-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致 |
链 L
1–208(208 aa)
链 Q
1–208(208 aa)
链 R
1–208(208 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.68 Å |
| 8YD7 Structure of FADD/Caspase-8/cFLIP death effector domain assembly 提交 2024-02-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致 |
链 L
1–208(208 aa)
|
突变:H9G 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | SE SELENIUM ATOM × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;HEPES, TBG, PEG8000, TCEP, sodium chloride
|
分辨率 3.32 Å R-free 0.231 |
| 8YD8 Structure of FADD/Caspase-8/cFLIP death effector domain assembly 提交 2024-02-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致 |
链 L
1–208(208 aa)
|
突变:H9G | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;HEPES, PEG 8000, TBG, TCEP, sodium chloride
|
分辨率 3.11 Å R-free 0.241 |
| 8YNI Structure of the FADD/Caspase-8/cFLIP death effector domain assembly 提交 2024-03-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 11 PDB 声明:11-meric(11) 与蛋白数一致 |
链 L
1–208(208 aa)
链 Q
1–208(208 aa)
链 R
1–208(208 aa)
|
突变:F25G 突变:F25G 突变:F25G | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.66 Å |
| 9L5W FADD-DED filaments coordinate complex IIa assembly during TNF-induced apoptosis 提交 2024-12-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 18 PDB 声明:18-meric(18) 与蛋白数一致 |
链 A
1–91(91 aa)
链 B
1–91(91 aa)
链 C
1–91(91 aa)
链 D
1–91(91 aa)
链 E
1–91(91 aa)
链 F
1–91(91 aa)
链 G
1–91(91 aa)
链 H
1–91(91 aa)
链 I
1–91(91 aa)
链 J
1–91(91 aa)
链 K
1–91(91 aa)
链 L
1–91(91 aa)
链 M
1–91(91 aa)
链 N
1–91(91 aa)
链 O
1–91(91 aa)
链 P
1–91(91 aa)
链 Q
1–91(91 aa)
链 R
1–91(91 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;25mM HEPES, 150mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 9N94 Cryo-EM structure of FADD_DED filament 提交 2025-02-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 24 PDB 声明:24-meric(24) 与蛋白数一致 |
链 A
1–208(208 aa)
链 B
1–208(208 aa)
链 C
1–208(208 aa)
链 D
1–208(208 aa)
链 E
1–208(208 aa)
链 F
1–208(208 aa)
链 G
1–208(208 aa)
链 H
1–208(208 aa)
链 I
1–208(208 aa)
链 J
1–208(208 aa)
链 K
1–208(208 aa)
链 L
1–208(208 aa)
链 M
1–208(208 aa)
链 N
1–208(208 aa)
链 O
1–208(208 aa)
链 P
1–208(208 aa)
链 Q
1–208(208 aa)
链 R
1–208(208 aa)
链 S
1–208(208 aa)
链 T
1–208(208 aa)
链 U
1–208(208 aa)
链 V
1–208(208 aa)
链 W
1–208(208 aa)
链 X
1–208(208 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.07 Å |
| 9NCQ Cryo-EM structure of Fas-FADD complex 提交 2025-02-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:12-meric(12) 与蛋白数一致 |
链 H
91–191(101 aa)
链 I
91–191(101 aa)
链 J
91–191(101 aa)
链 K
91–191(101 aa)
链 L
91–191(101 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.51 Å |
| 9U6E FADD-DED filaments coordinate complex IIa assembly during TNF-induced apoptosis 提交 2025-03-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 24 PDB 声明:24-meric(24) 与蛋白数一致 |
链 B
1–208(208 aa)
链 C
1–208(208 aa)
链 D
1–208(208 aa)
链 E
1–208(208 aa)
链 F
1–208(208 aa)
链 G
1–208(208 aa)
链 H
1–208(208 aa)
链 I
1–208(208 aa)
链 J
1–208(208 aa)
链 K
1–208(208 aa)
链 L
1–208(208 aa)
链 M
1–208(208 aa)
链 N
1–208(208 aa)
链 O
1–208(208 aa)
链 P
1–208(208 aa)
链 Q
1–208(208 aa)
链 R
1–208(208 aa)
链 S
1–208(208 aa)
链 T
1–208(208 aa)
链 U
1–208(208 aa)
链 V
1–208(208 aa)
链 W
1–208(208 aa)
链 X
1–208(208 aa)
链 Y
1–208(208 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;25mM HEPES, 150mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.40 Å |
| 9U7A FADD-DED filaments coordinate complex IIa assembly during TNF-induced apoptosis 提交 2025-03-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 24 PDB 声明:24-meric(24) 与蛋白数一致 |
链 B
1–92(92 aa)
链 C
1–92(92 aa)
链 D
1–92(92 aa)
链 E
1–92(92 aa)
链 F
1–92(92 aa)
链 G
1–92(92 aa)
链 H
1–92(92 aa)
链 I
1–92(92 aa)
链 J
1–92(92 aa)
链 K
1–92(92 aa)
链 L
1–92(92 aa)
链 M
1–92(92 aa)
链 N
1–92(92 aa)
链 O
1–92(92 aa)
链 P
1–92(92 aa)
链 Q
1–92(92 aa)
链 R
1–92(92 aa)
链 S
1–92(92 aa)
链 T
1–92(92 aa)
链 U
1–92(92 aa)
链 V
1–92(92 aa)
链 W
1–92(92 aa)
链 X
1–92(92 aa)
链 Y
1–92(92 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;25mM HEPES, 150mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.82 Å |