当前蛋白身份:Q13158 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1A1W FADD DEATH EFFECTOR DOMAIN, F25Y MUTANT, NMR MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE 提交 1997-12-18 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–83(83 aa) 片段:DEATH EFFECTOR DOMAIN
突变:F25Y 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 4;288 K
分辨率未提供
1A1Z FADD DEATH EFFECTOR DOMAIN, F25G MUTANT, NMR MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE 提交 1997-12-18 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–83(83 aa) 片段:DEATH EFFECTOR DOMAIN
突变:F25G 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 4;288 K;离子强度(mmCIF原始值)100 mM;压力 1
NMR样品组成 H2O
分辨率未提供
1E3Y Death domain from human FADD/MORT1 提交 2000-06-26 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 93–192(100 aa) 片段:DEATH DOMAIN RESIDUES 93-192
突变:YES 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.2;298 K;离子强度(mmCIF原始值)50 MM PHOSPHATE BUFFER, 150MM NACL;压力 1
分辨率未提供
1E41 Death domain from human FADD/MORT1 提交 2000-06-27 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 93–192(100 aa) 片段:DEATH DOMAIN RESIDUES 93-192
突变:YES 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.2;298 K;离子强度(mmCIF原始值)50 MM PHOSPHATE BUFFER, 150MM NACL;压力 1
分辨率未提供
2GF5 Structure of intact FADD (MORT1) 提交 2006-03-21 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 2–191(190 aa)
突变:F25Y 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;288 K;离子强度(mmCIF原始值)200mM phosphate;压力 1
NMR样品组成 200mM phosphate buffer, 95% H2O 5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
3EZQ Crystal Structure of the Fas/FADD Death Domain Complex 提交 2008-10-23 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 B 93–208(116 aa) 片段:Fadd DD, UNP residues 93-208
链 D 93–208(116 aa) 片段:Fadd DD, UNP residues 93-208
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION;pH 4;291 K;0.95M citric acid, 1.9M ammonium sulfate, pH4, EVAPORATION, temperature 291K
分辨率 2.73 Å R-free 0.278
3EZQ Crystal Structure of the Fas/FADD Death Domain Complex 提交 2008-10-23 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 F 93–208(116 aa) 片段:Fadd DD, UNP residues 93-208
链 H 93–208(116 aa) 片段:Fadd DD, UNP residues 93-208
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION;pH 4;291 K;0.95M citric acid, 1.9M ammonium sulfate, pH4, EVAPORATION, temperature 291K
分辨率 2.73 Å R-free 0.278
3EZQ Crystal Structure of the Fas/FADD Death Domain Complex 提交 2008-10-23 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 J 93–208(116 aa) 片段:Fadd DD, UNP residues 93-208
链 L 93–208(116 aa) 片段:Fadd DD, UNP residues 93-208
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION;pH 4;291 K;0.95M citric acid, 1.9M ammonium sulfate, pH4, EVAPORATION, temperature 291K
分辨率 2.73 Å R-free 0.278
3EZQ Crystal Structure of the Fas/FADD Death Domain Complex 提交 2008-10-23 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 N 93–208(116 aa) 片段:Fadd DD, UNP residues 93-208
链 P 93–208(116 aa) 片段:Fadd DD, UNP residues 93-208
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION;pH 4;291 K;0.95M citric acid, 1.9M ammonium sulfate, pH4, EVAPORATION, temperature 291K
分辨率 2.73 Å R-free 0.278
3OQ9 Structure of the FAS/FADD death domain assembly 提交 2010-09-02 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 H 93–184(92 aa) 片段:UNP residues 93-184
链 I 93–184(92 aa) 片段:UNP residues 93-184
链 J 93–184(92 aa) 片段:UNP residues 93-184
链 K 93–184(92 aa) 片段:UNP residues 93-184
链 L 93–184(92 aa) 片段:UNP residues 93-184
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 hanging drop;pH 8.5;298 K;0.1 M Tris pH 8.5, 100 mM MgCl2, 5 % glycerol and 6-10 % PEG4000, hanging drop, temperature 298K
分辨率 6.80 Å R-free 0.354
6ACI Crystal structure of EPEC effector NleB in complex with FADD death domain 提交 2018-07-26 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 H 93–184(92 aa)
未记录 UDP URIDINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MN MANGANESE (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;4.5 M Sodium chloride, 100 mM HEPES pH 7.5
分辨率 1.87 Å R-free 0.209
8YBX Structure of the FADD/Caspase-8/cFLIP death effector domain assembly 提交 2024-02-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 L 1–208(208 aa)
链 Q 1–208(208 aa)
链 R 1–208(208 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.68 Å
8YD7 Structure of FADD/Caspase-8/cFLIP death effector domain assembly 提交 2024-02-19 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 L 1–208(208 aa)
突变:H9G 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) SE SELENIUM ATOM × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;HEPES, TBG, PEG8000, TCEP, sodium chloride
分辨率 3.32 Å R-free 0.231
8YD8 Structure of FADD/Caspase-8/cFLIP death effector domain assembly 提交 2024-02-19 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 L 1–208(208 aa)
突变:H9G 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;HEPES, PEG 8000, TBG, TCEP, sodium chloride
分辨率 3.11 Å R-free 0.241
8YNI Structure of the FADD/Caspase-8/cFLIP death effector domain assembly 提交 2024-03-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 11 PDB 声明:11-meric(11) 与蛋白数一致
链 L 1–208(208 aa)
链 Q 1–208(208 aa)
链 R 1–208(208 aa)
突变:F25G 突变:F25G 突变:F25G 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.66 Å
9L5W FADD-DED filaments coordinate complex IIa assembly during TNF-induced apoptosis 提交 2024-12-23 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 18 PDB 声明:18-meric(18) 与蛋白数一致
链 A 1–91(91 aa)
链 B 1–91(91 aa)
链 C 1–91(91 aa)
链 D 1–91(91 aa)
链 E 1–91(91 aa)
链 F 1–91(91 aa)
链 G 1–91(91 aa)
链 H 1–91(91 aa)
链 I 1–91(91 aa)
链 J 1–91(91 aa)
链 K 1–91(91 aa)
链 L 1–91(91 aa)
链 M 1–91(91 aa)
链 N 1–91(91 aa)
链 O 1–91(91 aa)
链 P 1–91(91 aa)
链 Q 1–91(91 aa)
链 R 1–91(91 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4;25mM HEPES, 150mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
9N94 Cryo-EM structure of FADD_DED filament 提交 2025-02-10 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 24 PDB 声明:24-meric(24) 与蛋白数一致
链 A 1–208(208 aa)
链 B 1–208(208 aa)
链 C 1–208(208 aa)
链 D 1–208(208 aa)
链 E 1–208(208 aa)
链 F 1–208(208 aa)
链 G 1–208(208 aa)
链 H 1–208(208 aa)
链 I 1–208(208 aa)
链 J 1–208(208 aa)
链 K 1–208(208 aa)
链 L 1–208(208 aa)
链 M 1–208(208 aa)
链 N 1–208(208 aa)
链 O 1–208(208 aa)
链 P 1–208(208 aa)
链 Q 1–208(208 aa)
链 R 1–208(208 aa)
链 S 1–208(208 aa)
链 T 1–208(208 aa)
链 U 1–208(208 aa)
链 V 1–208(208 aa)
链 W 1–208(208 aa)
链 X 1–208(208 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.07 Å
9NCQ Cryo-EM structure of Fas-FADD complex 提交 2025-02-17 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:12-meric(12) 与蛋白数一致
链 H 91–191(101 aa)
链 I 91–191(101 aa)
链 J 91–191(101 aa)
链 K 91–191(101 aa)
链 L 91–191(101 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.51 Å
9U6E FADD-DED filaments coordinate complex IIa assembly during TNF-induced apoptosis 提交 2025-03-23 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 24 PDB 声明:24-meric(24) 与蛋白数一致
链 B 1–208(208 aa)
链 C 1–208(208 aa)
链 D 1–208(208 aa)
链 E 1–208(208 aa)
链 F 1–208(208 aa)
链 G 1–208(208 aa)
链 H 1–208(208 aa)
链 I 1–208(208 aa)
链 J 1–208(208 aa)
链 K 1–208(208 aa)
链 L 1–208(208 aa)
链 M 1–208(208 aa)
链 N 1–208(208 aa)
链 O 1–208(208 aa)
链 P 1–208(208 aa)
链 Q 1–208(208 aa)
链 R 1–208(208 aa)
链 S 1–208(208 aa)
链 T 1–208(208 aa)
链 U 1–208(208 aa)
链 V 1–208(208 aa)
链 W 1–208(208 aa)
链 X 1–208(208 aa)
链 Y 1–208(208 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;25mM HEPES, 150mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.40 Å
9U7A FADD-DED filaments coordinate complex IIa assembly during TNF-induced apoptosis 提交 2025-03-24 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 24 PDB 声明:24-meric(24) 与蛋白数一致
链 B 1–92(92 aa)
链 C 1–92(92 aa)
链 D 1–92(92 aa)
链 E 1–92(92 aa)
链 F 1–92(92 aa)
链 G 1–92(92 aa)
链 H 1–92(92 aa)
链 I 1–92(92 aa)
链 J 1–92(92 aa)
链 K 1–92(92 aa)
链 L 1–92(92 aa)
链 M 1–92(92 aa)
链 N 1–92(92 aa)
链 O 1–92(92 aa)
链 P 1–92(92 aa)
链 Q 1–92(92 aa)
链 R 1–92(92 aa)
链 S 1–92(92 aa)
链 T 1–92(92 aa)
链 U 1–92(92 aa)
链 V 1–92(92 aa)
链 W 1–92(92 aa)
链 X 1–92(92 aa)
链 Y 1–92(92 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;25mM HEPES, 150mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å