当前蛋白身份：Q16595
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1EKG MATURE HUMAN FRATAXIN 提交 2000-03-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
84–210（127 aa）
片段：RESIDUES 88-210
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；2.5 M ammonium sulfate, 0.1 sodium citrate, 2% sucrose, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 18K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.220 |
| 1LY7 The solution structure of the the c-terminal domain of frataxin, the protein responsible for friedreich ataxia 提交 2002-06-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
91–210（120 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN (91-210)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.8；300 K；离子强度（mmCIF原始值）10 mM phosphate；压力 ambient
NMR样品组成
1 MM FRATAXIN. U-15N 10
MM PHOSPHATE BUFFER (PH
6.8)90% H2O, 10% D2O | h2o
|
分辨率未提供 |
| 3S4M Crystal structure of wild-type human frataxin 提交 2011-05-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
82–210（129 aa）
片段：mature form (UNP residues 82-210)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；295 K；30% MPD, 0.1 M sodium citrate, 0.2 M ammonium acetate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.187 |
| 3S5D Crystal structure of human frataxin variant W155A 提交 2011-05-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
82–210（129 aa）
片段：mature form (UNP residues 82-210)
|
突变：W155A | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；295 K；1.8 M ammonium sulfate, 0.2 M potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.192 |
| 3S5E Crystal structure of human frataxin variant W155R, one of the Friedreich's ataxia point mutations 提交 2011-05-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
82–210（129 aa）
片段：mature form (UNP residues 82-210)
|
突变：W155R | MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；295 K；16% PEG2000 MME, 0.1 M MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.31 Å R-free 0.197 |
| 3S5F Crystal structure of human frataxin variant W155F 提交 2011-05-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
82–210（129 aa）
片段：mature form (UNP residues 82-210)
|
突变：W155F | MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；295 K；0.2 M sodium acetate trihydrate, 0.1 M Tris hydrochloride, 30% PEG4000, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.213 |
| 3S5F Crystal structure of human frataxin variant W155F 提交 2011-05-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
82–210（129 aa）
片段：mature form (UNP residues 82-210)
|
突变：W155F | MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；295 K；0.2 M sodium acetate trihydrate, 0.1 M Tris hydrochloride, 30% PEG4000, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.213 |
| 3T3J 1.70 A structure of Friedreich's ataxia frataxin variant N146K 提交 2011-07-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
82–210（129 aa）
片段：mature form (UNP residues 82-210)
|
突变：N146K | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；28% PEG2000 MME, 0.1 M Tris, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.245 |
| 3T3K 1.24 A Structure of Friedreich's ataxia frataxin variant Q148R 提交 2011-07-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
82–210（129 aa）
片段：mature form (UNP residues 82-210)
|
突变：Q148R | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；295 K；20% PEG3000, 0.1 M sodium citrate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.24 Å R-free 0.197 |
| 3T3L 1.15 A structure of human frataxin variant Q153A 提交 2011-07-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
82–210（129 aa）
片段：mature form (UNP residues 82-210)
|
突变：Q153A | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；295 K；2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate, 0.2 M potassium sodium tartrate tetrahydrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.179 |
| 3T3T 1.38 A structure of human frataxin variant Q148G 提交 2011-07-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
82–210（129 aa）
片段：mature form (UNP residues 82-210)
|
突变：Q148G | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；295 K；2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M citrate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.38 Å R-free 0.227 |
| 3T3T 1.38 A structure of human frataxin variant Q148G 提交 2011-07-25 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
82–210（129 aa）
片段：mature form (UNP residues 82-210)
|
突变：Q148G | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；295 K；2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M citrate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.38 Å R-free 0.227 |
| 3T3T 1.38 A structure of human frataxin variant Q148G 提交 2011-07-25 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
82–210（129 aa）
片段：mature form (UNP residues 82-210)
|
突变：Q148G | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；295 K；2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M citrate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.38 Å R-free 0.227 |
| 3T3T 1.38 A structure of human frataxin variant Q148G 提交 2011-07-25 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
82–210（129 aa）
片段：mature form (UNP residues 82-210)
|
突变：Q148G | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；295 K；2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M citrate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.38 Å R-free 0.227 |
| 3T3X 1.57 A structure of Friedreich's ataxia frataxin variant R165C 提交 2011-07-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
82–210（129 aa）
片段：mature form (UNP residues 82-210)
|
突变：R165C | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；295 K；1.9 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium citrate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.251 |
| 3T3X 1.57 A structure of Friedreich's ataxia frataxin variant R165C 提交 2011-07-25 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
82–210（129 aa）
片段：mature form (UNP residues 82-210)
|
突变：R165C | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；295 K；1.9 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium citrate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.251 |
| 5KZ5 Architecture of the Human Mitochondrial Iron-Sulfur Cluster Assembly Machinery: the Complex Formed by the Iron Donor, the Sulfur Donor, and the Scaffold 提交 2016-07-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric（36） 与蛋白数一致 |
链 A
42–210（169 aa）
链 B
42–210（169 aa）
链 C
42–210（169 aa）
链 D
42–210（169 aa）
链 E
42–210（169 aa）
链 F
42–210（169 aa）
链 G
42–210（169 aa）
链 H
42–210（169 aa）
链 I
42–210（169 aa）
链 J
42–210（169 aa）
链 K
42–210（169 aa）
链 L
42–210（169 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
|
分辨率 14.30 Å |
| 6NZU Structure of the human frataxin-bound iron-sulfur cluster assembly complex 提交 2019-02-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 I
81–210（130 aa）
片段：UNP residues 81-210
链 J
81–210（130 aa）
片段：UNP residues 81-210
|
未记录 | PLP PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE × 2 8Q1 S-[2-({N-[(2R)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] dodecanethioate × 2 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8PK8 Structure of the human mitochondrial iron-sulfur cluster biosynthesis complex during persulfide transfer (persulfide on ISCU2) 提交 2023-06-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 E
81–210（130 aa）
|
未记录 | PLP PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE × 1 8Q1 S-[2-({N-[(2R)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] dodecanethioate × 1 FE2 FE (II) ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.49 Å |
| 8PK9 Structure of the human mitochondrial iron-sulfur cluster biosynthesis complex during persulfide transfer (persulfide on NFS1 and ISCU2) 提交 2023-06-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 E
81–210（130 aa）
|
未记录 | PLP PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE × 1 8Q1 S-[2-({N-[(2R)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] dodecanethioate × 1 FE2 FE (II) ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.58 Å |
| 8RME Structure of the core ISC complex under turnover conditions (frataxin-bound) 提交 2024-01-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 I
81–210（130 aa）
|
未记录 | FE2 FE (II) ION × 2 8Q1 S-[2-({N-[(2R)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] dodecanethioate × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.49 Å |
| 9HO4 Crystal Structure of the Human Frataxin protein in complex with a tailored Camelid Nanobody 6B1 提交 2024-12-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
93–206（114 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1M HEPES pH 7.0
0.8M Potassium Sodium Tartrate
|
分辨率 1.76 Å R-free 0.175 |
| 9HO5 Crystal Structure of the Human Frataxin protein in complex with a tailored Camelid Nanobody 4A7 提交 2024-12-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
90–210（121 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M Sodium Thiocyanate pH 6.9
20% PEG 3350
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.210 |
| 9HO6 Crystal Structure of the Human Frataxin protein in complex with a tailored Camelid Nanobody 16C10 提交 2024-12-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
90–210（121 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；15% PEG 10K
0.1M Ammonium acetate
0.1M Bis-Tris pH 5.5
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.227 |
| 9HO6 Crystal Structure of the Human Frataxin protein in complex with a tailored Camelid Nanobody 16C10 提交 2024-12-11 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
90–210（121 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；15% PEG 10K
0.1M Ammonium acetate
0.1M Bis-Tris pH 5.5
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.227 |