当前蛋白身份:Q2MKA7
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4BSO Crystal structure of R-spondin 1 (Fu1Fu2) - Native 提交 2013-06-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
31–146(116 aa)
片段:FU1FU2, RESIDUES 31-146
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.20 Å R-free 0.250 |
| 4BSP Crystal structure of R-spondin 1 (Fu1Fu2) - Holmium soak 提交 2013-06-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
31–146(116 aa)
片段:FU1FU2, RESIDUES 31-146
|
未记录 | HO HOLMIUM ATOM × 2 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.00 Å R-free 0.260 |
| 4BSR Structure of the ectodomain of LGR5 in complex with R-spondin-1 (Fu1Fu2) in P22121 crystal form 提交 2013-06-11 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 C
31–146(116 aa)
片段:FU1FU2, RESIDUES 31-146
链 D
31–146(116 aa)
片段:FU1FU2, RESIDUES 31-146
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.20 Å R-free 0.258 |
| 4BSS Structure of the ectodomain of LGR5 in complex with R-spondin-1 (Fu1Fu2) in P21 crystal form 提交 2013-06-11 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 C
31–146(116 aa)
片段:FU1FU2, RESIDUES 31-146
链 D
31–146(116 aa)
片段:FU1FU2, RESIDUES 31-146
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.20 Å R-free 0.290 |
| 4BSS Structure of the ectodomain of LGR5 in complex with R-spondin-1 (Fu1Fu2) in P21 crystal form 提交 2013-06-11 | Assembly 2 其他组合 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 G
31–146(116 aa)
片段:FU1FU2, RESIDUES 31-146
链 H
31–146(116 aa)
片段:FU1FU2, RESIDUES 31-146
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.20 Å R-free 0.290 |
| 4BST Structure of the ectodomain of LGR5 in complex with R-spondin-1 (Fu1Fu2) in P6122 crystal form 提交 2013-06-11 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 C
31–146(116 aa)
片段:FU1FU2, RESIDUES 31-146
链 D
31–146(116 aa)
片段:FU1FU2, RESIDUES 31-146
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 4.30 Å R-free 0.268 |
| 4BSU Structure of the ectodomain of LGR5 in complex with R-spondin-1 (Fu1Fu2) in C2 crystal form 提交 2013-06-11 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 G
31–146(116 aa)
链 H
31–146(116 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.20 Å R-free 0.287 |
| 4BSU Structure of the ectodomain of LGR5 in complex with R-spondin-1 (Fu1Fu2) in C2 crystal form 提交 2013-06-11 | Assembly 2 其他组合 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 C
31–146(116 aa)
链 D
31–146(116 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.20 Å R-free 0.287 |
| 4CDK Structure of ZNRF3-RSPO1 提交 2013-11-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 E
31–145(115 aa)
片段:FURIN-LIKE DOMAIN, RESIDUES 31-145
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
0.2M SODIUM BROMIDE AND 20% W/V PEG 3350
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.246 |
| 4CDK Structure of ZNRF3-RSPO1 提交 2013-11-01 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 G
31–145(115 aa)
片段:FURIN-LIKE DOMAIN, RESIDUES 31-145
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
0.2M SODIUM BROMIDE AND 20% W/V PEG 3350
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.246 |
| 4CDK Structure of ZNRF3-RSPO1 提交 2013-11-01 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 H
31–145(115 aa)
片段:FURIN-LIKE DOMAIN, RESIDUES 31-145
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
0.2M SODIUM BROMIDE AND 20% W/V PEG 3350
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.246 |
| 4CDK Structure of ZNRF3-RSPO1 提交 2013-11-01 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 F
31–145(115 aa)
片段:FURIN-LIKE DOMAIN, RESIDUES 31-145
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
0.2M SODIUM BROMIDE AND 20% W/V PEG 3350
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分辨率 2.80 Å R-free 0.246 |
| 4KNG Crystal structure of human LGR5-RSPO1-RNF43 提交 2013-05-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 M
35–144(110 aa)
片段:furin repeats
链 P
35–144(110 aa)
片段:furin repeats
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 NI NICKEL (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;293 K;10% PEG4000, 0.2M ammonium sulfate, 7% Sucrose and 0.1 M TRIS pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.276 |
| 4KT1 Complex of R-spondin 1 with LGR4 extracellular domain 提交 2013-05-19 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 E
39–128(90 aa)
片段:UNP residues 39-128
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;PEG, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.209 |
| 4LI2 Crystal Structures of Lgr4 and its complex with R-spondin1 提交 2013-07-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
33–144(112 aa)
片段:FU 1 and FU 2 repeat residues 33-144
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 5.7;298 K;22% PEG3350, 200 mM MgCl2 and 100 mM BisTris pH 5.7, vapor diffusion, temperature 298K
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分辨率 3.19 Å R-free 0.284 |
| 4QXF crystal structure of human LGR4 and Rspo1 提交 2014-07-20 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 C
34–135(102 aa)
片段:UNP residues 34-135
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;289 K;0.1M MES pH 6.5, 0.2M sodium thiocyanate, 22% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.243 |
| 4QXF crystal structure of human LGR4 and Rspo1 提交 2014-07-20 | Assembly 2 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 E
34–135(102 aa)
片段:UNP residues 34-135
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;289 K;0.1M MES pH 6.5, 0.2M sodium thiocyanate, 22% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.243 |
| 8WVU Cryo-EM structure of LGR4 in complex with Rspo1 and RNF43 提交 2023-10-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 B
35–144(110 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 PROPANE
|
分辨率 3.61 Å |