当前蛋白身份:Q2MKA7 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
4BSO Crystal structure of R-spondin 1 (Fu1Fu2) - Native 提交 2013-06-11 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 31–146(116 aa) 片段:FU1FU2, RESIDUES 31-146
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.20 Å R-free 0.250
4BSP Crystal structure of R-spondin 1 (Fu1Fu2) - Holmium soak 提交 2013-06-11 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 31–146(116 aa) 片段:FU1FU2, RESIDUES 31-146
未记录 HO HOLMIUM ATOM × 2 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.00 Å R-free 0.260
4BSR Structure of the ectodomain of LGR5 in complex with R-spondin-1 (Fu1Fu2) in P22121 crystal form 提交 2013-06-11 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 C 31–146(116 aa) 片段:FU1FU2, RESIDUES 31-146
链 D 31–146(116 aa) 片段:FU1FU2, RESIDUES 31-146
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.20 Å R-free 0.258
4BSS Structure of the ectodomain of LGR5 in complex with R-spondin-1 (Fu1Fu2) in P21 crystal form 提交 2013-06-11 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 C 31–146(116 aa) 片段:FU1FU2, RESIDUES 31-146
链 D 31–146(116 aa) 片段:FU1FU2, RESIDUES 31-146
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.20 Å R-free 0.290
4BSS Structure of the ectodomain of LGR5 in complex with R-spondin-1 (Fu1Fu2) in P21 crystal form 提交 2013-06-11 Assembly 2 其他组合 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 G 31–146(116 aa) 片段:FU1FU2, RESIDUES 31-146
链 H 31–146(116 aa) 片段:FU1FU2, RESIDUES 31-146
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.20 Å R-free 0.290
4BST Structure of the ectodomain of LGR5 in complex with R-spondin-1 (Fu1Fu2) in P6122 crystal form 提交 2013-06-11 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 C 31–146(116 aa) 片段:FU1FU2, RESIDUES 31-146
链 D 31–146(116 aa) 片段:FU1FU2, RESIDUES 31-146
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 4.30 Å R-free 0.268
4BSU Structure of the ectodomain of LGR5 in complex with R-spondin-1 (Fu1Fu2) in C2 crystal form 提交 2013-06-11 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 G 31–146(116 aa)
链 H 31–146(116 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.20 Å R-free 0.287
4BSU Structure of the ectodomain of LGR5 in complex with R-spondin-1 (Fu1Fu2) in C2 crystal form 提交 2013-06-11 Assembly 2 其他组合 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 C 31–146(116 aa)
链 D 31–146(116 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.20 Å R-free 0.287
4CDK Structure of ZNRF3-RSPO1 提交 2013-11-01 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 E 31–145(115 aa) 片段:FURIN-LIKE DOMAIN, RESIDUES 31-145
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.2M SODIUM BROMIDE AND 20% W/V PEG 3350
分辨率 2.80 Å R-free 0.246
4CDK Structure of ZNRF3-RSPO1 提交 2013-11-01 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 G 31–145(115 aa) 片段:FURIN-LIKE DOMAIN, RESIDUES 31-145
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.2M SODIUM BROMIDE AND 20% W/V PEG 3350
分辨率 2.80 Å R-free 0.246
4CDK Structure of ZNRF3-RSPO1 提交 2013-11-01 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 H 31–145(115 aa) 片段:FURIN-LIKE DOMAIN, RESIDUES 31-145
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.2M SODIUM BROMIDE AND 20% W/V PEG 3350
分辨率 2.80 Å R-free 0.246
4CDK Structure of ZNRF3-RSPO1 提交 2013-11-01 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 F 31–145(115 aa) 片段:FURIN-LIKE DOMAIN, RESIDUES 31-145
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.2M SODIUM BROMIDE AND 20% W/V PEG 3350
分辨率 2.80 Å R-free 0.246
4KNG Crystal structure of human LGR5-RSPO1-RNF43 提交 2013-05-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 M 35–144(110 aa) 片段:furin repeats
链 P 35–144(110 aa) 片段:furin repeats
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 NI NICKEL (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;293 K;10% PEG4000, 0.2M ammonium sulfate, 7% Sucrose and 0.1 M TRIS pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.50 Å R-free 0.276
4KT1 Complex of R-spondin 1 with LGR4 extracellular domain 提交 2013-05-19 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 E 39–128(90 aa) 片段:UNP residues 39-128
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;PEG, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
分辨率 2.50 Å R-free 0.209
4LI2 Crystal Structures of Lgr4 and its complex with R-spondin1 提交 2013-07-02 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 33–144(112 aa) 片段:FU 1 and FU 2 repeat residues 33-144
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 5.7;298 K;22% PEG3350, 200 mM MgCl2 and 100 mM BisTris pH 5.7, vapor diffusion, temperature 298K
分辨率 3.19 Å R-free 0.284
4QXF crystal structure of human LGR4 and Rspo1 提交 2014-07-20 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 34–135(102 aa) 片段:UNP residues 34-135
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;289 K;0.1M MES pH 6.5, 0.2M sodium thiocyanate, 22% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 2.25 Å R-free 0.243
4QXF crystal structure of human LGR4 and Rspo1 提交 2014-07-20 Assembly 2 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 E 34–135(102 aa) 片段:UNP residues 34-135
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;289 K;0.1M MES pH 6.5, 0.2M sodium thiocyanate, 22% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 2.25 Å R-free 0.243
8WVU Cryo-EM structure of LGR4 in complex with Rspo1 and RNF43 提交 2023-10-24 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 B 35–144(110 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 PROPANE
分辨率 3.61 Å