当前蛋白身份:Q3MHR7 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

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PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1K8K Crystal Structure of Arp2/3 Complex 提交 2001-10-24 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 D 1–300(300 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;PEG 8000, KSCN, Hepes at pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.251
2P9I Crystal Structure of bovine Arp2/3 Complex co-crystallized with ADP and crosslinked with gluteraldehyde 提交 2007-03-26 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 D 1–300(300 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;7.5% PEG 3350 50mM HEPES 100mM KSCN 10% Sucrose, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.46 Å R-free 0.261
2P9K Crystal structure of bovine Arp2/3 complex co-crystallized with ATP and crosslinked with glutaraldehyde 提交 2007-03-26 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 D 1–300(300 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;278 K;7.5% PEG 3350, 50mM HEPES, 100mM KSCN, 10% Sucrose, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K
分辨率 2.59 Å R-free 0.260
2P9L Crystal Structure of bovine Arp2/3 complex 提交 2007-03-26 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 D 1–300(300 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;7.5% PEG3350 50mM HEPES 100mM KSCN 10% Sucrose, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.65 Å R-free 0.266
2P9N Crystal Structure of bovine Arp2/3 complex co-crystallized with ADP 提交 2007-03-26 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 D 1–300(300 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;6% PEG 8000 100mM HEPES 100mM KSCN, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.85 Å R-free 0.272
2P9P Crystal Structure of bovine Arp2/3 complex co-crystallized with ADP 提交 2007-03-26 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 D 1–300(300 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;7.5% PEG 3350 50mM HEPES 100mM KSCN 10% Sucrose, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.90 Å R-free 0.288
2P9S Structure of bovine Arp2/3 complex co-crystallized with ATP/Mg2+ 提交 2007-03-26 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 D 1–300(300 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;7.5% PEG3350 50mM HEPES 100mM KSCN 10% Sucrose, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.68 Å R-free 0.261
2P9U Crystal structure of bovine Arp2/3 complex co-crystallized with AMP-PNP and calcium 提交 2007-03-26 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 D 1–300(300 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;7.5% PEG3350 50mM HEPES 100mM KSCN 10% Sucrose, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.75 Å R-free 0.265
3DXK Structure of Bos Taurus Arp2/3 Complex with Bound Inhibitor CK0944636 提交 2008-07-24 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 D 1–300(300 aa)
未记录 N23 N-[2-(2-methyl-1H-indol-3-yl)ethyl]thiophene-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;277 K;8% PEG 8000, 50 mM HEPES, pH 7.5, 100 mM KSCN, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.70 Å R-free 0.262
3DXM Structure of Bos taurus Arp2/3 Complex with Bound Inhibitor CK0993548 提交 2008-07-24 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 D 1–300(300 aa)
未记录 N24 (2S)-2-(3-bromophenyl)-3-(5-chloro-2-hydroxyphenyl)-1,3-thiazolidin-4-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;277 K;8% PEG 8000, 50 mM HEPES, pH 7.5,100 mM KSCN, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.85 Å R-free 0.258
3RSE Structural and biochemical characterization of two binding sites for nucleation promoting factor WASp-VCA on Arp2/3 complex 提交 2011-05-02 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 D 1–300(300 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;277 K;100 mM HEPES 7.5, 8% PEG 8000, 200 mM KCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.65 Å R-free 0.259
3UKR Crystal structure of Bos taurus Arp2/3 complex with bound inhibitor CK-666 提交 2011-11-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 D 1–300(300 aa)
未记录 CKH 2-fluoro-N-[2-(2-methyl-1H-indol-3-yl)ethyl]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;277 K;0.1M Hepes (pH 7.5), 0.2M KSCN, 16% PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.48 Å R-free 0.261
3UKU Structure of Arp2/3 complex with bound inhibitor CK-869 提交 2011-11-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 D 1–300(300 aa)
未记录 C69 (2S)-2-(3-bromophenyl)-3-(2,4-dimethoxyphenyl)-1,3-thiazolidin-4-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;278 K;8% PEG 8000, 50 mM HEPES, pH 7.5, 100 mM KSCN, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K
分辨率 2.75 Å R-free 0.301
3ULE Structure of Bos taurus Arp2/3 complex with bound inhibitor CK-869 and ATP 提交 2011-11-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 D 1–300(300 aa)
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 C69 (2S)-2-(3-bromophenyl)-3-(2,4-dimethoxyphenyl)-1,3-thiazolidin-4-one × 1 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5;277 K;8% PEG 8000, 50 mM HEPES, pH 7.5,100 mM KSCN, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.274
4JD2 Crystal structure of Bos taurus Arp2/3 complex binding with Mus musculus GMF 提交 2013-02-22 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 D 1–300(300 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.08 Å R-free 0.248
4XEI Orthorhombic isomorph of bovine Arp2/3 complex 提交 2014-12-23 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 D 1–300(300 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.4;277 K;Ethanol 10%, 1,4-butanediol 15%, 100 mM Tris 7.4
分辨率 3.87 Å R-free 0.329
4XF2 Tetragonal structure of Arp2/3 complex 提交 2014-12-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 D 1–300(300 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;277 K;100 mM Tris 7.0, 15% ethanol
分辨率 5.00 Å R-free 0.303
4XF2 Tetragonal structure of Arp2/3 complex 提交 2014-12-25 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 W 1–300(300 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;277 K;100 mM Tris 7.0, 15% ethanol
分辨率 5.00 Å R-free 0.303
6DEC Crystal structure of Bos taurus Arp2/3 complex binding with C-terminus of Homo sapiens SPIN90 提交 2018-05-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 D 1–300(300 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;50 mM HEPES, pH 7.5, 5% PEG3350, 50 mM L-Proline, 0.5 mM ATP, 0.5 mM calcium chloride, 1 mM DTT
分辨率 4.60 Å R-free 0.314
6DEC Crystal structure of Bos taurus Arp2/3 complex binding with C-terminus of Homo sapiens SPIN90 提交 2018-05-11 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 K 1–300(300 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;50 mM HEPES, pH 7.5, 5% PEG3350, 50 mM L-Proline, 0.5 mM ATP, 0.5 mM calcium chloride, 1 mM DTT
分辨率 4.60 Å R-free 0.314
7JPN Cryo-EM structure of Arpin-bound Arp2/3 complex 提交 2020-08-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 D 1–300(300 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Grids were manually blotted for 3 seconds with Whatman 41 filter paper and manually plunged using a Leica EM CPC manual plunger.
分辨率 3.24 Å
7T5Q Cryo-EM Structure of a Transition State of Arp2/3 Complex Activation 提交 2021-12-13 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 D 1–300(300 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Grids were manually blotted for 3 seconds with Whatman 41 filter paper and manually plunged using a Leica EM CPC manual plunger.
分辨率 3.40 Å
7TPT Single-particle Cryo-EM structure of Arp2/3 complex at branched-actin junction. 提交 2022-01-26 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 36 PDB 声明:36-meric(36) 与蛋白数一致
链 D 1–300(300 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 16 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 16 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8TAH Cryo-EM structure of Cortactin-bound to Arp2/3 complex 提交 2023-06-27 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 D 1–300(300 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7;10 mM imidazole pH 7.0, 50 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.89 Å
9DLX Bovine Arp2/3 complex with N-WASP CA bound to Arp3 and Arp2-ArpC1 提交 2024-09-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric(9) 与蛋白数一致
链 D 1–285(285 aa)
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.91 Å
9DLZ Bovine Arp2/3 complex with N-WASP CA bound to Arp3 提交 2024-09-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric(9) 与蛋白数一致
链 D 1–285(285 aa)
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9EAM Coronin-7 CA bound to Arp2/3 complex 提交 2024-11-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 D 1–300(300 aa)
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.97 Å
9M5E Structure of SPIN90 dimer-Arp2/3 complex-nucleated actin filament (singlet complex) 提交 2025-03-05 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:12-meric(12) 与蛋白数一致
链 D 1–300(300 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.55 Å
9M64 Structure of SPIN90 dimer-Arp2/3 complexes-nucleated actin filaments (Doublet Complex) 提交 2025-03-07 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 24 PDB 声明:24-meric(24) 与蛋白数一致
链 D 1–300(300 aa)
链 d 1–300(300 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 12 MG MAGNESIUM ION × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å