当前蛋白身份：Q5T4S7
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8J9Q Crystal structure of UBR box of UBR4 apo 提交 2023-05-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1660–1729（70 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291.15 K；0.1 M DL-malic acid (pH7.0) and 18% (w/v) polyethylene glycol 3350 (PEG3350)
|
分辨率 2.18 Å R-free 0.269 |
| 8J9Q Crystal structure of UBR box of UBR4 apo 提交 2023-05-04 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1660–1729（70 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291.15 K；0.1 M DL-malic acid (pH7.0) and 18% (w/v) polyethylene glycol 3350 (PEG3350)
|
分辨率 2.18 Å R-free 0.269 |
| 8J9Q Crystal structure of UBR box of UBR4 apo 提交 2023-05-04 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1660–1729（70 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291.15 K；0.1 M DL-malic acid (pH7.0) and 18% (w/v) polyethylene glycol 3350 (PEG3350)
|
分辨率 2.18 Å R-free 0.269 |
| 8J9R Crystal structure of UBR box of YIFS-UBR4 提交 2023-05-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1660–1729（70 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；0.1 M Bis-Tris (pH5.6), 29% (w/v) polyethylene glycol 3350 (PEG3350), 0.2 M lithium sulfate monohydrate
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.287 |
| 9D9Z Structure of human UBR4-KCMF1-CaM E3 ligase complex (Silencing Factor of the Integrated stress response, SiFI) 提交 2024-08-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
2–5183（5182 aa）
链 B
2–5183（5182 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 20 CA CALCIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 9HXW Cryo-EM structure of the human UBR4/KCMF1/CALM1 complex (composite map) 提交 2025-01-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–4781（4781 aa）
链 B
1–4781（4781 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 20 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9NWD Human E3 ligase UBR4-KCMF1-calmodulin complex (N-terminal) 提交 2025-03-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5183（5183 aa）
链 B
1–5183（5183 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 9NWE E3 ligase UBR4-KCMF1-calmodulin complex 提交 2025-03-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
2–5183（5182 aa）
链 B
2–5183（5182 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 CA CALCIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 9QWS Cryo-EM structure of the human UBR4/KCMF1/CALM1 complex (C-term dimer interface focused refinement) 提交 2025-04-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5183（5183 aa）
链 B
1–5183（5183 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9QWU Cryo-EM structure of the human UBR4/KCMF1/CALM1 complex (CALM1 focused refinement) 提交 2025-04-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5183（5183 aa）
链 B
1–5183（5183 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9QWX Cryo-EM structure of the human UBR4/KCMF1/CALM1 complex (N-term focused refinement) 提交 2025-04-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5183（5183 aa）
链 B
1–5183（5183 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 9QWZ Cryo-EM structure of the human UBR4/KCMF1/CALM1 complex (BP focused refinement) 提交 2025-04-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–5183（5183 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.80 Å |
| 9QX0 Cryo-EM structure of the human UBR4/KCMF1/CALM1 complex (C-term focused refinement) 提交 2025-04-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5183（5183 aa）
链 B
1–5183（5183 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |