当前蛋白身份：Q76NL8
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3S5H Crystal structures of falcilysin, a M16 metalloprotease from the malaria parasite Plasmodium falciparum 提交 2011-05-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1193（1193 aa）
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未记录 | CO COBALT (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.2；298 K；11% PEG6000,10%PEG400,0.1M ADA, 20mM Mg acetate,20 mM Co acetate, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
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分辨率 1.60 Å R-free 0.257 |
| 3S5I Crystal structures of falcilysin, a M16 metalloprotease from the malaria parasite Plasmodium falciparum 提交 2011-05-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1193（1193 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.2；11% PEG6000, 10%PEG400, 0.1M ADA, 20mM Mg acetate, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 100K
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分辨率 1.74 Å R-free 0.197 |
| 3S5K Crystal structures of falcilysin, a M16 metalloprotease from the malaria parasite Plasmodium falciparum 提交 2011-05-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1193（1193 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；298 K；20% PEG6000, 0.1M MES, 5 M Zn acetate,0.1% - mercaptoethanol, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
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分辨率 3.20 Å R-free 0.316 |
| 3S5M Crystal structures of falcilysin, a M16 metalloprotease from the malaria parasite Plasmodium falciparum 提交 2011-05-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1193（1193 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.2；298 K；11% PEG6000, 10% PEG400, 0.1M ADA, 20 mM Mg acetate, 20 mM Zn acetate, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
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分辨率 1.55 Å R-free 0.214 |
| 7DI7 Falcilysin in complex with chloroquine 提交 2020-11-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
59–1193（1135 aa）
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未记录 | ACT ACETATE ION × 2 CLQ N4-(7-CHLORO-QUINOLIN-4-YL)-N1,N1-DIETHYL-PENTANE-1,4-DIAMINE × 1 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M sodium acetate trihydrate pH 8.0, 20% w/v PEG 3,350
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分辨率 1.82 Å R-free 0.198 |
| 7DIA Falcilysin in complex with mefloquine 提交 2020-11-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
59–1193（1135 aa）
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未记录 | H8O (S)-[2,8-bis(trifluoromethyl)quinolin-4-yl]-[(2S)-piperidin-2-yl]methanol × 1 GOL GLYCEROL × 1 ACT ACETATE ION × 3 YMZ (11R,12S)- Mefloquine × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M sodium acetate trihydrate pH 7.0, 20% w/v PEG 3,350
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分辨率 1.55 Å R-free 0.197 |
| 7DIJ Falcilysin in complex with MK-4815 提交 2020-11-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
59–1193（1135 aa）
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未记录 | GOL GLYCEROL × 1 ACT ACETATE ION × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 H8F 2-(aminomethyl)-3,5-ditert-butyl-phenol × 1 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M Tris pH 8.5, 25% w/v PEG 3,350
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分辨率 1.90 Å R-free 0.206 |
| 8HO4 Falcilysin in complex with MMV000848 提交 2022-12-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
59–1193（1135 aa）
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未记录 | XUH (2R)-1-(9H-carbazol-9-yl)-3-(cyclopentylamino)propan-2-ol × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293.15 K；0.05 M Sodium HEPES, 0.05M MOPS pH 7.5, 0.03 M sodium nitrate, 0.03 M sodium phosphate dibasic, 0.03 M ammonium sulfate, 20% (v/v) PEG 500 MME, 10% (w/v) PEG 20,000
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分辨率 1.96 Å R-free 0.206 |
| 8HO5 Falcilysin in complex with MMV665806 提交 2022-12-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
59–1193（1135 aa）
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未记录 | XUN (2S)-1-(2,3-dimethyl-1H-indol-1-yl)-3-{[(1S,2S)-2-methylcyclohexyl]amino}propan-2-ol × 1 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293.15 K；0.039M Bicine, 0.061M TRIZMA base pH 8.5, 0.03 M sodium nitrate, 0.03 M sodium phosphate dibasic, 0.03 M ammonium sulfate, 20% (v/v) PEG 500 MME, 10% (w/v) PEG 20,000
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分辨率 2.00 Å R-free 0.189 |
| 8WXW Falcilysin in complex with hemoglobin alpha chain peptide 提交 2023-10-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
59–1193（1135 aa）
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突变：E132Q | GOL GLYCEROL × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；4% w/v PEG 1500, 20% v/v glycerol
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分辨率 1.86 Å R-free 0.210 |
| 8WXZ Falcilysin in complex with hemoglobin beta chain peptide 提交 2023-10-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
59–1193（1135 aa）
|
突变：E132Q | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 ACY ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.12M monosaccharides, 0.1M imidazole/MES monohydrate pH 6.5, 20% v/v PEG 500, 10% w/v PEG 20000
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分辨率 2.30 Å R-free 0.251 |
| 8WYT Partially closed Falcilysin bound to MK-4815, from MK-4815-treated dataset 提交 2023-10-31 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
59–1193（1135 aa）
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未记录 | H8F 2-(aminomethyl)-3,5-ditert-butyl-phenol × 1 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；20 mM Na HEPES, 300 mM NaCl, 0.5 mM TCEP, pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.70 Å |
| 8WYU Open Falcilysin, from MK-4815-treated dataset 提交 2023-10-31 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
61–1193（1133 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；20 mM Na HEPES, 300 mM NaCl, 0.5 mM TCEP, pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8WYX Partially closed falcilysin, from free falcilysin dataset 提交 2023-10-31 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
59–1192（1134 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；20 mM Na HEPES, 300 mM NaCl, 0.5 mM TCEP, pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 8WYY Open falcilysin, from free falcilysin dataset 提交 2023-10-31 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
61–1193（1133 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；20 mM Na HEPES, 300 mM NaCl, 0.5 mM TCEP, pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |