当前蛋白身份：Q7BSW5
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2QOM The crystal structure of the E.coli EspP autotransporter Beta-domain. 提交 2007-07-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1300（277 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；294 K；0.34M Cymal-1, 1% octylglucoside,
33% PEG 1000, 0.2M NaCl, 0.1M Na cacodylate pH 6.4, 5% glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.66 Å R-free 0.284 |
| 2QOM The crystal structure of the E.coli EspP autotransporter Beta-domain. 提交 2007-07-20 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1024–1300（277 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；294 K；0.34M Cymal-1, 1% octylglucoside,
33% PEG 1000, 0.2M NaCl, 0.1M Na cacodylate pH 6.4, 5% glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.66 Å R-free 0.284 |
| 3SLJ Pre-cleavage Structure of the Autotransporter EspP - N1023A mutant 提交 2011-06-24 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
999–1300（302 aa）
片段：Autotransporter protein espP translocator (UNP residues 999-1300)
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突变：N1023A | C8E (HYDROXYETHYLOXY)TRI(ETHYLOXY)OCTANE × 9 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；294 K；20% w/v PEG8000, 20% v/v glycerol, pH 7.5, HANGING DROP, temperature 294K
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分辨率 2.48 Å R-free 0.237 |
| 3SLO Pre-cleavage Structure of the Autotransporter EspP - N1023D mutant 提交 2011-06-24 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
999–1300（302 aa）
片段：Autotransporter protein espP translocator (UNP residues 999-1300)
|
突变：N1023D | C8E (HYDROXYETHYLOXY)TRI(ETHYLOXY)OCTANE × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；294 K；18% w/v PEG8000, 20% v/v glycerol, 25 mM sodium acetate, pH 7.5, HANGING DROP, temperature 294K
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分辨率 2.52 Å R-free 0.258 |
| 3SLT Pre-cleavage Structure of the Autotransporter EspP - N1023S Mutant 提交 2011-06-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
999–1300（302 aa）
片段：Autotransporter protein espP translocator (UNP residues 999-1300)
|
突变：N1023S | C8E (HYDROXYETHYLOXY)TRI(ETHYLOXY)OCTANE × 10 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；294 K；20% w/v PEG8000, 20% v/v glycerol, sodium acetate, pH 7.5, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.46 Å R-free 0.266 |
| 3SZE Crystal structure of the passenger domain of the E. coli autotransporter EspP 提交 2011-07-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
56–1023（968 aa）
片段：passenger domain, UNP residues 56-1023
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突变：S263A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；18 22% PEG 4000, 0.1M HEPES, 0.05 0.15M tri-lithium citrate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
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分辨率 2.50 Å R-free 0.231 |
| 7TSZ BamABCDE bound to substrate EspP class 1 提交 2022-01-31 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 P
948–1298（351 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 4.50 Å |
| 7TT0 BamABCDE bound to substrate EspP class 2 提交 2022-01-31 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 P
948–1298（351 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.30 Å |
| 7TT1 BamABCDE bound to substrate EspP class 4 提交 2022-01-31 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 P
948–1298（351 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.30 Å |
| 7TT2 BamABCDE bound to substrate EspP class 3 提交 2022-01-31 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 P
948–1298（351 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 7TT3 BamABCDE bound to substrate EspP class 5 提交 2022-01-31 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 P
948–1298（351 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.30 Å |
| 7TT4 BamABCDE bound to substrate EspP class 6 提交 2022-01-31 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 P
948–1298（351 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 7TT5 BamABCDE bound to substrate EspP in the open-sheet EspP state 提交 2022-01-31 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 P
948–1298（351 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.30 Å |
| 7TT6 BamABCDE bound to substrate EspP in the intermediate-open EspP state 提交 2022-01-31 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 P
948–1298（351 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.30 Å |
| 7TT7 BamABCDE bound to substrate EspP in the barrelized EspP/continuous open BamA state 提交 2022-01-31 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 P
948–1298（351 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.80 Å |
| 7TTC BamABCDE bound to substrate EspP 提交 2022-02-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 P
1024–1298（275 aa）
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未记录 | K33 2,3-dideoxy-6-O-[2-deoxy-4-O-phosphono-2-(tetradecanoylamino)-alpha-L-gulopyranosyl]-1-O-phosphono-beta-D-threo-hexopyranose × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 7YE4 BAM-EspP complex structure with BamA-G431C and G781C/EspP-N1293C and A1043C mutations in nanodisc 提交 2022-07-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 P
948–1300（353 aa）
|
突变：N1293C, A1043C | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8；20 mM Tris-HCl, pH 7.8, 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 7YE6 BAM-EspP complex structure with BamA-N427C/EspP-R1297C mutations in nanodisc 提交 2022-07-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 P
948–1300（353 aa）
|
突变：R1297C | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8；20 mM Tris-HCl, pH 7.8, 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 8BNZ BAM-EspP complex structure with BamA-G431C/EspP-N1293C mutations in nanodisc 提交 2022-11-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 P
948–1300（353 aa）
|
突变：N1293C | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 8BO2 BAM-EspP complex structure with BamA-S425C/EspP-S1299C mutations in nanodisc 提交 2022-11-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 P
948–1300（353 aa）
|
突变：S1299C | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8Q0G Release Complex: BAM bound EspP and Compact SurA 提交 2023-07-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 P
948–1300（353 aa）
|
突变：S1299C | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.30 Å |
| 8QP5 Release Complex: BAM bound EspP (SurA released) 提交 2023-09-29 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 P
948–1300（353 aa）
|
突变：S1299C | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.40 Å |
| 8QPU Release Complex: BAM bound EspP and Extended SurA 提交 2023-10-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 P
948–1300（353 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.20 Å |
| 8SPR The cryo-EM structure of the EcBAM/EspP(beta1-12) complex 提交 2023-05-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 F
949–1300（352 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 8SQA The cryo-EM structure of the EcBAM/EspP(beta8-12) complex 提交 2023-05-04 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 F
1195–1300（106 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |