当前蛋白身份：Q7LBR1
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3JC1 Electron cryo-microscopy of the IST1-CHMP1B ESCRT-III copolymer 提交 2015-11-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 68 PDB 声明：68-meric（68） 与蛋白数一致 |
链 Ab
4–163（160 aa）
片段：UNP residues 4-163
链 Ad
4–163（160 aa）
片段：UNP residues 4-163
链 Af
4–163（160 aa）
片段：UNP residues 4-163
链 Ah
4–163（160 aa）
片段：UNP residues 4-163
链 Aj
4–163（160 aa）
片段：UNP residues 4-163
链 Al
4–163（160 aa）
片段：UNP residues 4-163
链 An
4–163（160 aa）
片段：UNP residues 4-163
链 Ap
4–163（160 aa）
片段：UNP residues 4-163
链 Ar
4–163（160 aa）
片段：UNP residues 4-163
链 At
4–163（160 aa）
片段：UNP residues 4-163
链 Av
4–163（160 aa）
片段：UNP residues 4-163
链 Ax
4–163（160 aa）
片段：UNP residues 4-163
链 Az
4–163（160 aa）
片段：UNP residues 4-163
链 Bb
4–163（160 aa）
片段：UNP residues 4-163
链 Bd
4–163（160 aa）
片段：UNP residues 4-163
链 Bf
4–163（160 aa）
片段：UNP residues 4-163
链 Bh
4–163（160 aa）
片段：UNP residues 4-163
链 Bj
4–163（160 aa）
片段：UNP residues 4-163
链 Bl
4–163（160 aa）
片段：UNP residues 4-163
链 Bn
4–163（160 aa）
片段：UNP residues 4-163
链 Bp
4–163（160 aa）
片段：UNP residues 4-163
链 Br
4–163（160 aa）
片段：UNP residues 4-163
链 Bt
4–163（160 aa）
片段：UNP residues 4-163
链 Bv
4–163（160 aa）
片段：UNP residues 4-163
链 Bx
4–163（160 aa）
片段：UNP residues 4-163
链 Bz
4–163（160 aa）
片段：UNP residues 4-163
链 Cb
4–163（160 aa）
片段：UNP residues 4-163
链 Cd
4–163（160 aa）
片段：UNP residues 4-163
链 Cf
4–163（160 aa）
片段：UNP residues 4-163
链 Ch
4–163（160 aa）
片段：UNP residues 4-163
链 Cj
4–163（160 aa）
片段：UNP residues 4-163
链 Cl
4–163（160 aa）
片段：UNP residues 4-163
链 Cn
4–163（160 aa）
片段：UNP residues 4-163
链 Cp
4–163（160 aa）
片段：UNP residues 4-163
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
25 mM Tris, pH 8.0, 25 mM sodium chloride；pH 8；25 mM Tris, pH 8.0, 25 mM sodium chloride
cryo-EM玻璃化条件
Deposited 3.5 uL sample, blotted 3-6 seconds (0 mm offset)；冷冻剂 ETHANE；Deposited 3.5 uL sample, blotted 3-6 seconds (0 mm offset), and plunged into liquid ethane (VITROBOT MARK III).
|
分辨率 4.00 Å |
| 4TXQ Crystal structure of LIP5 N-terminal domain complexed with CHMP1B MIM 提交 2014-07-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
176–199（24 aa）
片段：UNP residues 176-199
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；277.15 K；Protein mixture was added in 1:1 ratio with a solution of 16% MPD, 0.1 M Tris and equilibrated against a mother liquid of 8% MPD, 0.1 M Tris
|
分辨率 2.21 Å R-free 0.227 |
| 4TXQ Crystal structure of LIP5 N-terminal domain complexed with CHMP1B MIM 提交 2014-07-04 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
176–199（24 aa）
片段：UNP residues 176-199
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；277.15 K；Protein mixture was added in 1:1 ratio with a solution of 16% MPD, 0.1 M Tris and equilibrated against a mother liquid of 8% MPD, 0.1 M Tris
|
分辨率 2.21 Å R-free 0.227 |
| 4TXR Crystal structure of LIP5 N-terminal domain complexed with CHMP1B MIM and CHMP5 MIM 提交 2014-07-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
176–199（24 aa）
片段：UNP residues 176-199
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 9 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277.15 K；19% PEG 4000, 0.025 M sodium acetate
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.180 |
| 6E8G CryoEM reconstruction of IST1-CHMP1B copolymer filament bound to ssDNA at 2.9 Angstrom resolution 提交 2018-07-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 72 PDB 声明：72-meric（72） 与蛋白数一致 |
链 AA
1–199（199 aa）
链 AB
1–199（199 aa）
链 B
1–199（199 aa）
链 CA
1–199（199 aa）
链 CB
1–199（199 aa）
链 D
1–199（199 aa）
链 EA
1–199（199 aa）
链 EB
1–199（199 aa）
链 F
1–199（199 aa）
链 GA
1–199（199 aa）
链 GB
1–199（199 aa）
链 H
1–199（199 aa）
链 IA
1–199（199 aa）
链 IB
1–199（199 aa）
链 J
1–199（199 aa）
链 KA
1–199（199 aa）
链 KB
1–199（199 aa）
链 L
1–199（199 aa）
链 MA
1–199（199 aa）
链 MB
1–199（199 aa）
链 N
1–199（199 aa）
链 OA
1–199（199 aa）
链 OB
1–199（199 aa）
链 P
1–199（199 aa）
链 QA
1–199（199 aa）
链 QB
1–199（199 aa）
链 R
1–199（199 aa）
链 SA
1–199（199 aa）
链 SB
1–199（199 aa）
链 T
1–199（199 aa）
链 UA
1–199（199 aa）
链 UB
1–199（199 aa）
链 W
1–199（199 aa）
链 WA
1–199（199 aa）
链 Y
1–199（199 aa）
链 YA
1–199（199 aa）
|
突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；0 mm offset with 10 sec wait time and 2-4 sec blot
|
分辨率 2.90 Å |
| 6TZ4 CryoEM reconstruction of membrane-bound ESCRT-III filament composed of CHMP1B+IST1 (right-handed) 提交 2019-08-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 72 PDB 声明：72-meric（72） 与蛋白数一致 |
链 02
1–199（199 aa）
链 A
1–199（199 aa）
链 BA
1–199（199 aa）
链 BB
1–199（199 aa）
链 C
1–199（199 aa）
链 DA
1–199（199 aa）
链 DB
1–199（199 aa）
链 E
1–199（199 aa）
链 FA
1–199（199 aa）
链 FB
1–199（199 aa）
链 G
1–199（199 aa）
链 HA
1–199（199 aa）
链 HB
1–199（199 aa）
链 I
1–199（199 aa）
链 JA
1–199（199 aa）
链 JB
1–199（199 aa）
链 K
1–199（199 aa）
链 LA
1–199（199 aa）
链 LB
1–199（199 aa）
链 M
1–199（199 aa）
链 NA
1–199（199 aa）
链 NB
1–199（199 aa）
链 O
1–199（199 aa）
链 PA
1–199（199 aa）
链 PB
1–199（199 aa）
链 Q
1–199（199 aa）
链 RA
1–199（199 aa）
链 RB
1–199（199 aa）
链 S
1–199（199 aa）
链 TA
1–199（199 aa）
链 V
1–199（199 aa）
链 VA
1–199（199 aa）
链 X
1–199（199 aa）
链 XA
1–199（199 aa）
链 Z
1–199（199 aa）
链 ZA
1–199（199 aa）
|
突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted with Whatman No. 1 filter paper for 4-8 seconds with a 0 mm offset at 19C and 100 percent humidity before plunging into liquid ethane
|
分辨率 3.20 Å |
| 6TZ5 CryoEM reconstruction of membrane-bound ESCRT-III filament composed of CHMP1B+IST1 (left-handed) 提交 2019-08-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 68 PDB 声明：68-meric（68） 与蛋白数一致 |
链 AA
1–199（199 aa）
链 AB
1–199（199 aa）
链 B
1–199（199 aa）
链 CA
1–199（199 aa）
链 CB
1–199（199 aa）
链 D
1–199（199 aa）
链 EA
1–199（199 aa）
链 EB
1–199（199 aa）
链 F
1–199（199 aa）
链 GA
1–199（199 aa）
链 GB
1–199（199 aa）
链 H
1–199（199 aa）
链 IA
1–199（199 aa）
链 IB
1–199（199 aa）
链 J
1–199（199 aa）
链 KA
1–199（199 aa）
链 KB
1–199（199 aa）
链 L
1–199（199 aa）
链 MA
1–199（199 aa）
链 MB
1–199（199 aa）
链 N
1–199（199 aa）
链 OA
1–199（199 aa）
链 OB
1–199（199 aa）
链 P
1–199（199 aa）
链 QA
1–199（199 aa）
链 QB
1–199（199 aa）
链 R
1–199（199 aa）
链 SA
1–199（199 aa）
链 T
1–199（199 aa）
链 UA
1–199（199 aa）
链 W
1–199（199 aa）
链 WA
1–199（199 aa）
链 Y
1–199（199 aa）
链 YA
1–199（199 aa）
|
突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted with Whatman No. 1 filter paper for 4-8 seconds with a 0 mm offset at 19C and 100 percent humidity before plunging into liquid ethane
|
分辨率 3.10 Å |
| 6TZ9 CryoEM reconstruction of membrane-bound ESCRT-III filament composed of CHMP1B only 提交 2019-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 26 PDB 声明：26-meric（26） 与蛋白数一致 |
链 A
1–199（199 aa）
链 AA
1–199（199 aa）
链 B
1–199（199 aa）
链 C
1–199（199 aa）
链 D
1–199（199 aa）
链 E
1–199（199 aa）
链 F
1–199（199 aa）
链 G
1–199（199 aa）
链 H
1–199（199 aa）
链 I
1–199（199 aa）
链 J
1–199（199 aa）
链 K
1–199（199 aa）
链 L
1–199（199 aa）
链 M
1–199（199 aa）
链 N
1–199（199 aa）
链 O
1–199（199 aa）
链 P
1–199（199 aa）
链 Q
1–199（199 aa）
链 R
1–199（199 aa）
链 S
1–199（199 aa）
链 T
1–199（199 aa）
链 V
1–199（199 aa）
链 W
1–199（199 aa）
链 X
1–199（199 aa）
链 Y
1–199（199 aa）
链 Z
1–199（199 aa）
|
突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E 突变：K37E | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted with Whatman No. 1 filter paper for 4-8 seconds with a 0 mm offset at 19C and 100 percent humidity before plunging into liquid ethane
|
分辨率 6.20 Å |
| 8V2Q CHMP1B/IST1 ssRNA bound copolymer 提交 2023-11-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 182 PDB 声明：182-meric（182） 与蛋白数一致 |
链 A
1–199（199 aa）
|
突变：M136V | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.95 Å |
| 8V2R CryoEM of ssDNA bound CHMP1B/IST1 copolymer assembly 提交 2023-11-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 192 PDB 声明：192-meric（192） 与蛋白数一致 |
链 A
1–199（199 aa）
|
突变：M136V | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.01 Å |
| 8V2S CHMP1B/IST1 dsDNA bound copolymer 提交 2023-11-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 192 PDB 声明：192-meric（192） 与蛋白数一致 |
链 A
1–199（199 aa）
|
突变：M136V | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.72 Å |