当前蛋白身份：Q8C6L5
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4K8V Structure of cyclic GMP-AMP Synthase (cGAS) 提交 2013-04-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
147–507（361 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN, UNP residues 147-507
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；277 K；0.1 M HEPES, 0.1 M MgAc2, 20% PEG3350, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.208 |
| 4K8V Structure of cyclic GMP-AMP Synthase (cGAS) 提交 2013-04-18 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
147–507（361 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN, UNP residues 147-507
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；277 K；0.1 M HEPES, 0.1 M MgAc2, 20% PEG3350, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.208 |
| 4K8V Structure of cyclic GMP-AMP Synthase (cGAS) 提交 2013-04-18 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
147–507（361 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN, UNP residues 147-507
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；277 K；0.1 M HEPES, 0.1 M MgAc2, 20% PEG3350, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.208 |
| 4K8V Structure of cyclic GMP-AMP Synthase (cGAS) 提交 2013-04-18 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
147–507（361 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN, UNP residues 147-507
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；277 K；0.1 M HEPES, 0.1 M MgAc2, 20% PEG3350, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.208 |
| 4K96 Structure of Binary Complex of cGAS with Bound dsDNA 提交 2013-04-19 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
147–507（361 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN, UNP residues 147-507
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；293 K；0.1 M MES, 8% MPD, pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.08 Å R-free 0.226 |
| 4K96 Structure of Binary Complex of cGAS with Bound dsDNA 提交 2013-04-19 | Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 B
147–507（361 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN, UNP residues 147-507
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；293 K；0.1 M MES, 8% MPD, pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.08 Å R-free 0.226 |
| 4K97 Structure of Ternary Complex of cGAS with dsDNA and Bound ATP 提交 2013-04-19 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
147–507（361 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN, UNP residues 147-507
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.7；293 K；0.1 M HEPES, 0.2 M CaAc2, 20% PEG300, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.41 Å R-free 0.236 |
| 4K98 Structure of Ternary Complex of cGAS with dsDNA and Bound 5 -pppG(2 ,5 )pG 提交 2013-04-19 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
147–507（361 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN, UNP residues 147-507
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；0.1 M NaAc, 10% MPD, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.199 |
| 4K99 Structure of Ternary Complex of cGAS with dsDNA and Bound 5 -pppdG(2 ,5 )pdG 提交 2013-04-19 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
147–507（361 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN, UNP residues 147-507
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 GH3 3'-DEOXY-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDO 3'-deoxy-guanosine 5'-monophosphate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.2；293 K；0.1 M NaAc, 12% MPD, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.212 |
| 4K9A Structure of Ternary Complex of cGAS with dsDNA and Bound 5 -pG(2 ,5 )pA 提交 2013-04-19 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
147–507（361 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN, UNP residues 147-507
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；0.1 M MES, 40% MPD, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.26 Å R-free 0.210 |
| 4K9B Structure of Ternary Complex of cGAS with dsDNA and Bound c[G(2 ,5 )pA(3 ,5 )p] 提交 2013-04-19 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
147–507（361 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN, UNP residues 147-507
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES, 0.2 M MgCl2, 30% PEG300, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.26 Å R-free 0.217 |
| 4LEY Structure of mouse cGAS bound to 18 bp DNA 提交 2013-06-26 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
142–507（366 aa）
片段：Catalytic domain, UNP residues 142-507
链 C
142–507（366 aa）
片段：Catalytic domain, UNP residues 142-507
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；24-36% MPD, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.191 |
| 4LEY Structure of mouse cGAS bound to 18 bp DNA 提交 2013-06-26 | Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 B
142–507（366 aa）
片段：Catalytic domain, UNP residues 142-507
链 D
142–507（366 aa）
片段：Catalytic domain, UNP residues 142-507
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；24-36% MPD, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.191 |
| 4LEZ Structure of mouse cGAS bound to an 18bp DNA and cGAS product 提交 2013-06-26 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
142–507（366 aa）
片段：mouse cGAS catalytic domain, UNP residues 142-507
链 C
142–507（366 aa）
片段：mouse cGAS catalytic domain, UNP residues 142-507
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 1SY cGAMP × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；24-36% MPD, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.36 Å R-free 0.247 |
| 4O6A Mouse cyclic GMP-AMP synthase (cGAS) in complex with DNA 提交 2013-12-20 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
147–507（361 aa）
片段：UNP residues 147-507
链 B
147–507（361 aa）
片段：UNP residues 147-507
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；25% Methanol, 0.1M Tris-HCl, pH 8.0, 0.01M MgCl2., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.218 |
| 5N6I Crystal structure of mouse cGAS in complex with 39 bp DNA 提交 2017-02-15 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：tetradecameric（14） 与全部聚合物一致 |
链 A
139–507（369 aa）
链 B
139–507（369 aa）
链 C
139–507（369 aa）
链 D
139–507（369 aa）
链 E
139–507（369 aa）
链 F
139–507（369 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293.15 K；0.1M Tris pH 8, 0.2M ammonium citrate pH 7, 27,5% w/v PEG3350
|
分辨率 3.60 Å R-free 0.256 |
| 5XZB Mouse cGAS bound to the inhibitor RU365 提交 2017-07-12 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
149–505（357 aa）
片段：UNP residues 149-505
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 A9Y (3R)-3-[1-(1H-benzimidazol-2-yl)-5-hydroxy-3-methyl-1H-pyrazol-4-yl]-2-benzofuran-1(3H)-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M MES, pH 6.3, 26% PEG400, 0.1 M magnesium chloride
|
分辨率 2.13 Å R-free 0.247 |
| 5XZE Mouse cGAS bound to the inhibitor RU332 提交 2017-07-12 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
147–507（361 aa）
片段：UNP residues 147-505
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 AE7 (3R)-3-[1-(3H-1lambda~4~,3-benzothiazol-2-yl)-5-hydroxy-3-methyl-1H-pyrazol-4-yl]-2-benzofuran-1(3H)-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M MES, pH 6.3, 25% PEG400, 0.1 M magnesium chloride
|
分辨率 2.18 Å R-free 0.281 |
| 5XZG Mouse cGAS bound to the inhibitor RU521 提交 2017-07-12 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
147–507（361 aa）
片段：UNP residues 147-505
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 AEV 2-(4,5-dichloro-1H-benzimidazol-2-yl)-5-methyl-4-[(1R)-3-oxo-1,3-dihydro-2-benzofuran-1-yl]-1,2-dihydro-3H-pyrazol-3-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M MES, pH 6.9, 22.5% PEG400, 0.08 M magnesium chloride
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.232 |
| 6X59 The mouse cGAS catalytic domain binding to human assembled nucleosome 提交 2020-05-25 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric（11） 与全部聚合物一致 |
链 K
142–507（366 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.98 Å |
| 6X5A The mouse cGAS catalytic domain binding to human nucleosome that purified from HEK293T cells 提交 2020-05-25 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric（11） 与全部聚合物一致 |
链 K
142–507（366 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.36 Å |
| 6XJD Two mouse cGAS catalytic domain binding to human assembled nucleosome 提交 2020-06-23 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric（12） 与全部聚合物一致 |
链 K
142–507（366 aa）
链 L
142–507（366 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.80 Å |
| 7A08 CryoEM Structure of cGAS Nucleosome complex 提交 2020-08-07 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric（11） 与全部聚合物一致 |
链 a
139–507（369 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.11 Å |
| 7BUJ mcGAS bound with pppGpG 提交 2020-04-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
61–507（447 aa）
链 B
61–507（447 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MN MANGANESE (II) ION × 4 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.15 M Ammonium sulfate, 0.1 M Sodium HEPES, 20 % w/v PEG-4000, pH 6.8
|
分辨率 2.13 Å R-free 0.278 |
| 7BUM mcGAS bound with pGpA 提交 2020-04-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–507（507 aa）
链 B
1–507（507 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 2 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M MES, 30 % w/v PEG-5000 MME, pH 6.5
|
分辨率 3.05 Å R-free 0.280 |
| 7BUQ mcGAS bound with 23-cGAMP 提交 2020-04-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–507（507 aa）
链 B
1–507（507 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 1SY cGAMP × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M BIS-Tris, 25 % w/v PEG-3350, pH 6.5
|
分辨率 3.09 Å R-free 0.296 |
| 7JO9 1:1 cGAS-nucleosome complex 提交 2020-08-06 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric（11） 与全部聚合物一致 |
链 K
142–507（366 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 7JOA 2:1 cGAS-nucleosome complex 提交 2020-08-06 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric（11） 与全部聚合物一致 |
链 K
142–507（366 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 7KXS Computational design of constitutively active cGAS 提交 2020-12-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
147–507（361 aa）
链 B
147–507（361 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20 % w/v Polyethylene glycol 3,350
200 mM Potassium thiocyanate
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.261 |
| 7UTT Structure of Non-hydrolyzable ATP (ApCpp) binds to Cyclic GMP AMP synthase (cGAS) through Mn coordination 提交 2022-04-27 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
147–507（361 aa）
链 C
147–507（361 aa）
|
未记录 | APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 2 ZN ZINC ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M ammonium acetate, 32% MPD, with 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 2.04 Å R-free 0.210 |
| 7UUX ATP binds to Cyclic GMP AMP synthase (cGAS) through Mg coordination 提交 2022-04-29 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
147–507（361 aa）
链 C
147–507（361 aa）
|
突变：E211Q, D213N 突变：E211Q, D213N | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M ammonium acetate, 32% MPD, with 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 2.26 Å R-free 0.234 |
| 7UXW Structure of ATP and GTP bind to Cyclic GMP AMP synthase (cGAS) through Mg coordination 提交 2022-05-06 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
147–507（361 aa）
链 C
147–507（361 aa）
|
突变：E211Q, D213N 突变：E211Q, D213N | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M ammonium acetate, 32% MPD, with 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 2.57 Å R-free 0.248 |
| 7UYQ Structure of GTP binds to Cyclic GMP AMP synthase (cGAS) through Mg coordination 提交 2022-05-07 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
147–507（361 aa）
链 C
147–507（361 aa）
|
突变：E211Q, D213N 突变：E211Q, D213N | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M ammonium acetate, 32% MPD, with 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 2.57 Å R-free 0.241 |
| 7UYZ Structure of Ternary Complex of cGAS with dsDNA and Bound 5 -pppG(2 ,5 )pG 提交 2022-05-07 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
147–507（361 aa）
链 C
147–507（361 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 2 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M ammonium acetate, 32% MPD, with 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 2.49 Å R-free 0.251 |
| 7UZR Structure of Ternary Complex of cGAS with dsDNA and Bound 5 -pppG(2 ,5 )pG 提交 2022-05-09 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
147–507（361 aa）
片段：catalytic domain, residues 147-507
链 C
147–507（361 aa）
片段：catalytic domain, residues 147-507
|
未记录 | OKR [[(2~{R},3~{R},4~{R},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-1~{H}-purin-9-yl)-4-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-1~{H}-purin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-3-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 2 ZN ZINC ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M ammonium acetate, 32% MPD, with 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.245 |
| 7V0C Structure of Ternary Complex of cGAS with dsDNA and Bound 5 -pppG(2 ,5 )pG 提交 2022-05-10 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
147–507（361 aa）
片段：catalytic domain
链 C
147–507（361 aa）
片段：catalytic domain
|
未记录 | OKR [[(2~{R},3~{R},4~{R},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-1~{H}-purin-9-yl)-4-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-1~{H}-purin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-3-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 2 ZN ZINC ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M ammonium acetate, 32% MPD, with 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 2.57 Å R-free 0.240 |
| 7V0R Structure of Ternary Complex of cGAS with dsDNA and Bound 5 -ppcpG(2 ,5 )pA 提交 2022-05-10 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
147–507（361 aa）
片段：catalytic domain
链 C
147–507（361 aa）
片段：catalytic domain
|
未记录 | OKX [(2~{R},3~{R},4~{R},5~{R})-4-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-1~{H}-purin-9-yl)-3-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-[[oxidanyl(phosphonooxy)phosphoryl]methyl]phosphinic acid × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M ammonium acetate, 32% MPD, with 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 2.51 Å R-free 0.250 |
| 7V0W Structure of Ternary Complex of cGAS with dsDNA and Bound 5 -pppG(2,5 )pA 提交 2022-05-11 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
147–507（361 aa）
链 C
147–507（361 aa）
|
突变：E211Q, D213N 突变：E211Q, D213N | ZN ZINC ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 2 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M ammonium acetate, 32% MPD, with 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 2.66 Å R-free 0.238 |
| 8EAE Structure of Ternary Complex of cGAS with dsDNA and Bound 5-pppG(2,5)pI 提交 2022-08-29 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
147–507（361 aa）
链 C
147–507（361 aa）
|
未记录 | VLO [[(2~{R},3~{R},4~{R},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-1~{H}-purin-9-yl)-4-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-3,4-bis(oxidanyl)-5-(6-oxidanylidene-1~{H}-purin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-3-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 2 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M ammonium acetate, 32% MPD, with 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 2.56 Å R-free 0.233 |
| 8ECC Structure of Ternary Complex of cGAS with dsDNA and Bound 5-pppI(2,5)pA 提交 2022-09-01 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
147–507（361 aa）
链 C
147–507（361 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 VWX [[(2~{R},3~{R},4~{R},5~{R})-4-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-3-oxidanyl-5-(6-oxidanylidene-1~{H}-purin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M ammonium acetate, 32% MPD, with 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 2.44 Å R-free 0.259 |
| 8G10 Structure of Ternary Complex of cGAS with dsDNA and Bound ITP and GTP 提交 2023-02-01 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
147–507（361 aa）
片段：catalytic domain, residues 147-507
链 C
147–507（361 aa）
片段：catalytic domain, residues 147-507
|
突变：E211Q, D213N 突变：E211Q, D213N | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M ammonium acetate,32%MPD, with 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 2.47 Å R-free 0.227 |
| 8G1J Structure of Ternary Complex of cGAS with dsDNA and Bound ATP and ITP 提交 2023-02-02 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
147–507（361 aa）
片段：catalytic domain, residues 147-507
链 C
147–507（361 aa）
片段：catalytic domain, residues 147-507
|
突变：E211Q, D213N 突变：E211Q, D213N | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M ammonium acetate, 32% MPD, with 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.234 |
| 8G23 Structure of Ternary Complex of cGAS with dsDNA and Bound pppIpA 提交 2023-02-03 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
147–507（361 aa）
片段：catalytic domain, residues 147-507
链 C
147–507（361 aa）
片段：catalytic domain, residues 147-507
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 VWX [[(2~{R},3~{R},4~{R},5~{R})-4-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-3-oxidanyl-5-(6-oxidanylidene-1~{H}-purin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M ammonium acetate, 32% MPD, with 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 2.71 Å R-free 0.248 |
| 8G2P Structure of Ternary Complex of cGAS with dsDNA and Bound ATP and GTP 提交 2023-02-06 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
147–507（361 aa）
链 C
147–507（361 aa）
|
突变：D307N 突变：D307N | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M ammonium acetate, 32% MPD, with 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 2.52 Å R-free 0.242 |
| 8G2Q Structure of Ternary Complex of mouse cGAS with dsDNA and Bound GTP 提交 2023-02-06 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
147–507（361 aa）
链 C
147–507（361 aa）
|
突变：D307N 突变：D307N | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M ammonium acetate, 32% MPD, with 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 2.37 Å R-free 0.244 |
| 8GIM Structure of Ternary Complex of mouse cGAS with dsDNA and Bound ATP: with 10mM Mg2+ 提交 2023-03-14 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
147–507（361 aa）
片段：catalytic domain, residues 147-507
链 C
147–507（361 aa）
片段：catalytic domain, residues 147-507
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277.15 K；0.2 M ammonium acetate, 32% MPD, with 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 2.63 Å R-free 0.230 |
| 8GIN Structure of Ternary Complex of mouse cGAS with dsDNA and Bound ATP: with 10mM Mg2+ and 0.015mM Mn2+ 提交 2023-03-14 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
147–507（361 aa）
片段：catalytic domain, residues 147-507
链 C
147–507（361 aa）
片段：catalytic domain, residues 147-507
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M ammonium acetate, 32% MPD, with 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.225 |
| 8GIO Structure of Ternary Complex of mouse cGAS with dsDNA and Bound ATP: with 10mM Mg2+ and 0.1mM Mn2+ 提交 2023-03-14 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
147–507（361 aa）
片段：catalytic domain, residues 147-507
链 C
147–507（361 aa）
片段：catalytic domain, residues 147-507
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M ammonium acetate, 32% MPD, with 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 2.67 Å R-free 0.241 |
| 8GIP Structure of Ternary Complex of mouse cGAS with dsDNA and Bound ATP: with 10mM Mg2+ and 0.040mM Mn2+ 提交 2023-03-14 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
147–507（361 aa）
片段：catalytic domain, residues 147-507
链 C
147–507（361 aa）
片段：catalytic domain, residues 147-507
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M ammonium acetate, 32% MPD, with 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.242 |
| 8GIR Structure of Ternary Complex of mouse cGAS with dsDNA and Bound ATP: with 10mM Mg2+ and 0.2mM Mn2+ 提交 2023-03-14 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
147–507（361 aa）
片段：catalytic domain, residues 147-507
链 C
147–507（361 aa）
片段：catalytic domain, residues 147-507
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M ammonium acetate, 32% MPD, with 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.229 |
| 8GIS Structure of Ternary Complex of mouse cGAS with dsDNA and Bound ATP: with 10mM Mg2+ and 0.5mM Mn2+ 提交 2023-03-14 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
147–507（361 aa）
片段：catalytic domain, residues 147-507
链 C
147–507（361 aa）
片段：catalytic domain, residues 147-507
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M ammonium acetate, 32% MPD, with 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 2.46 Å R-free 0.230 |
| 8GIT Structure of Ternary Complex of mouse cGAS with dsDNA and Bound ATP: with 10mM Mg2+ and 1mM Mn2+ 提交 2023-03-14 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
147–507（361 aa）
片段：catalytic domain, residues 147-507
链 C
147–507（361 aa）
片段：catalytic domain, residues 147-507
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M ammonium acetate, 32% MPD, with 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 2.72 Å R-free 0.230 |
| 8SHK Structure of binary complex of mouse cGAS and bound ATP 提交 2023-04-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
147–507（361 aa）
片段：catalytic domain (UNP residues 147-507)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M magnesium acetate tetrahydrate, 0.1 M sodium cacodylate trihydrate, pH 6.5, 20% w/v PEG8000
|
分辨率 1.71 Å R-free 0.228 |
| 8SHU Structure of mouse cGAS 提交 2023-04-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
147–507（361 aa）
片段：catalytic domain (UNP residues 147-507)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M magnesium acetate tetrahydrate, 0.1 M sodium cacodylate trihydrate, pH 6.5, 20% w/v PEG8000
|
分辨率 1.71 Å R-free 0.211 |
| 8SHY Structure of binary complex of mouse cGAS QN and bound ATP 提交 2023-04-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
147–507（361 aa）
片段：catalytic domain (UNP residues 147-507)
|
突变：E211Q, D213N | ZN ZINC ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M magnesium acetate tetrahydrate, 0.1 M sodium cacodylate trihydrate, pH 6.5, 20% w/v PEG8000
|
分辨率 1.77 Å R-free 0.214 |
| 8SJ0 Structure of ternary complex of cGAS with dsDNA and bound 2'-dATP 提交 2023-04-17 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
147–507（361 aa）
片段：catalytic domain (UNP residues 147-507)
链 C
147–507（361 aa）
片段：catalytic domain (UNP residues 147-507)
|
未记录 | DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M ammonium acetate, 32% MPD, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 2.55 Å R-free 0.237 |
| 8SJ1 Structure of ternary complex of cGAS with dsDNA and bound 3'-dATP 提交 2023-04-17 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
147–507（361 aa）
片段：catalytic domain (UNP residues 147-507)
链 C
147–507（361 aa）
片段：catalytic domain (UNP residues 147-507)
|
未记录 | 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M ammonium acetate, 32% MPD, 0.1 M Bis-Tris, pH 6.5
|
分辨率 2.81 Å R-free 0.240 |
| 8SJ2 Structure of ternary complex of cGAS with dsDNA and bound ATP and 2'-dGTP 提交 2023-04-17 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
147–507（361 aa）
片段：catalytic domain (UNP residues 147-507)
链 C
147–507（361 aa）
片段：catalytic domain (UNP residues 147-507)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 DGT 2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M ammonium acetate, 32% MPD, 0.1 M Bis-Tris, pH 6.5
|
分辨率 2.23 Å R-free 0.234 |
| 8SKT Structure of ternary complex of mouse cGAS with dsDNA and bound ATP with 5 mM Mn2+ 提交 2023-04-20 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
147–507（361 aa）
片段：catalytic domain (UNP residues 147-507)
链 C
147–507（361 aa）
片段：catalytic domain (UNP residues 147-507)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M ammonium acetate, 32% MPD, 0.1 M Bis-Tris, pH 6.5
|
分辨率 2.69 Å R-free 0.247 |
| 9J2Z mouse cGAS catalytic domain bound with RU.521 提交 2024-08-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
146–507（362 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；277 K；0.1 M HEPES, 0.1 M MgAc2, 20% PEG3350
|
分辨率 2.39 Å R-free 0.263 |
| 9J2Z mouse cGAS catalytic domain bound with RU.521 提交 2024-08-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
146–507（362 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 A1EAM (4~{S},5~{R})-2-[4,5-bis(chloranyl)-1~{H}-benzimidazol-2-yl]-5-methyl-4-[(1~{S})-3-oxidanylidene-1~{H}-2-benzofuran-1-yl]pyrazolidin-3-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；277 K；0.1 M HEPES, 0.1 M MgAc2, 20% PEG3350
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分辨率 2.39 Å R-free 0.263 |
| 9J2Z mouse cGAS catalytic domain bound with RU.521 提交 2024-08-07 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
146–507（362 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 1 A1EAM (4~{S},5~{R})-2-[4,5-bis(chloranyl)-1~{H}-benzimidazol-2-yl]-5-methyl-4-[(1~{S})-3-oxidanylidene-1~{H}-2-benzofuran-1-yl]pyrazolidin-3-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；277 K；0.1 M HEPES, 0.1 M MgAc2, 20% PEG3350
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分辨率 2.39 Å R-free 0.263 |
| 9J2Z mouse cGAS catalytic domain bound with RU.521 提交 2024-08-07 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
146–507（362 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 1 A1EAM (4~{S},5~{R})-2-[4,5-bis(chloranyl)-1~{H}-benzimidazol-2-yl]-5-methyl-4-[(1~{S})-3-oxidanylidene-1~{H}-2-benzofuran-1-yl]pyrazolidin-3-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；277 K；0.1 M HEPES, 0.1 M MgAc2, 20% PEG3350
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分辨率 2.39 Å R-free 0.263 |
| 9OH4 Cryo-EM structure of cGAS tetramer in complex with BuDNA (bubble DNA) 提交 2025-05-02 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 A
149–505（357 aa）
片段：UNP residues 149-505
链 B
149–505（357 aa）
片段：UNP residues 149-505
链 C
149–505（357 aa）
片段：UNP residues 149-505
链 D
149–505（357 aa）
片段：UNP residues 149-505
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未记录 | ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；20mM Tris pH 7.5, 150mM NaCl, and 0.5mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Filter paper blotted with blot force 2 and blot time 2s, and plunge-frozen in liquid ethane using a Vitrobot Mark IV at 4 degree Celsius and 100% humidity.
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分辨率 3.48 Å |