当前蛋白身份:Q8N1F7 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
5IJN Composite structure of the inner ring of the human nuclear pore complex (32 copies of Nup205) 提交 2016-03-02 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 208 PDB 声明:208-meric(208) 与蛋白数一致
链 C 1–819(819 aa)
链 I 1–819(819 aa)
链 O 1–819(819 aa)
链 U 1–819(819 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 21.40 Å
5IJO Alternative composite structure of the inner ring of the human nuclear pore complex (16 copies of Nup188, 16 copies of Nup205) 提交 2016-03-02 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 208 PDB 声明:208-meric(208) 与蛋白数一致
链 C 1–819(819 aa)
链 I 1–819(819 aa)
链 O 1–819(819 aa)
链 U 1–819(819 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 21.40 Å
7MW0 Crystal structure of Homo sapiens NUP93 solenoid (residues 174-819) 提交 2021-05-15 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 174–819(646 aa)
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;294 K;0.075 M TRIS pH 8.5, 19 % (w/v) PEG 20000
分辨率 2.00 Å R-free 0.254
7MW1 Crystal structure of the Homo sapiens NUP93-NUP53 complex (NUP93 residues 174-819; NUP53 residues 84-150) 提交 2021-05-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 174–819(646 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;294 K;0.075 M TRIS pH 8.5, 17% (w/v) PEG 20000
分辨率 3.40 Å R-free 0.276
7MW1 Crystal structure of the Homo sapiens NUP93-NUP53 complex (NUP93 residues 174-819; NUP53 residues 84-150) 提交 2021-05-15 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 174–819(646 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;294 K;0.075 M TRIS pH 8.5, 17% (w/v) PEG 20000
分辨率 3.40 Å R-free 0.276
7PER Model of the inner ring of the human nuclear pore complex 提交 2021-08-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 192 PDB 声明:192-meric(192) 与蛋白数一致
链 C 1–819(819 aa)
链 I 1–819(819 aa)
链 O 1–819(819 aa)
链 U 1–819(819 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Cells were grown on holey carbon, Au-mesh supports. Grids were rinsed briefly with PBS and manually blotted before plunging into liquid ethane.
分辨率 35.00 Å
7R5J Human nuclear pore complex (dilated) 提交 2022-02-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 808 PDB 声明:808-meric(808) 与蛋白数一致
链 A0 1–819(819 aa)
链 A1 1–819(819 aa)
链 A2 1–819(819 aa)
链 A3 1–819(819 aa)
链 A4 1–819(819 aa)
链 A5 1–819(819 aa)
链 A6 1–819(819 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 50.00 Å
7R5K Human nuclear pore complex (constricted) 提交 2022-02-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 808 PDB 声明:808-meric(808) 与蛋白数一致
链 A0 1–819(819 aa)
链 A1 1–819(819 aa)
链 A2 1–819(819 aa)
链 A3 1–819(819 aa)
链 A4 1–819(819 aa)
链 A5 1–819(819 aa)
链 A6 1–819(819 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 12.00 Å