当前蛋白身份:Q8NFH3 重新检索
本组结构的主要差异维度
组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
4I79 Crystal structure of human NUP43 提交 2012-11-30 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–380(380 aa)
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 13 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 7.5;291 K;25% PEG-3350, 0.1 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K
分辨率 1.75 Å R-free 0.212
4I79 Crystal structure of human NUP43 提交 2012-11-30 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 1–380(380 aa)
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 19 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 7.5;291 K;25% PEG-3350, 0.1 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K
分辨率 1.75 Å R-free 0.212
5A9Q Human nuclear pore complex 提交 2015-07-22 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 304 PDB 声明:304-meric(304) 与蛋白数一致
链 0 1–380(380 aa)
链 9 1–380(380 aa)
链 I 1–380(380 aa)
链 R 1–380(380 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20MM TRIS, 0.2-0.4% TREHALOSE;pH 7.5;20MM TRIS, 0.2-0.4% TREHALOSE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE;VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, INSTRUMENT- HOMEMADE PLUNGER,
分辨率 23.00 Å
7PEQ Model of the outer rings of the human nuclear pore complex 提交 2021-08-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 288 PDB 声明:288-meric(288) 与蛋白数一致
链 AI 1–380(380 aa)
链 BI 1–380(380 aa)
链 CI 1–380(380 aa)
链 DI 1–380(380 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Cells were grown on holey carbon, Au-mesh supports. Grids were rinsed briefly with PBS and manually blotted before plunging into liquid ethane.
分辨率 35.00 Å
7R5J Human nuclear pore complex (dilated) 提交 2022-02-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 808 PDB 声明:808-meric(808) 与蛋白数一致
链 Q0 1–380(380 aa)
链 Q1 1–380(380 aa)
链 Q2 1–380(380 aa)
链 Q3 1–380(380 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 50.00 Å
7R5K Human nuclear pore complex (constricted) 提交 2022-02-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 808 PDB 声明:808-meric(808) 与蛋白数一致
链 Q0 1–380(380 aa)
链 Q1 1–380(380 aa)
链 Q2 1–380(380 aa)
链 Q3 1–380(380 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 12.00 Å