当前蛋白身份:Q8TCS8
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3U1K Crystal structure of human PNPase 提交 2011-09-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
46–669(624 aa)
片段:UNP residues 46-669
|
未记录 | CIT CITRIC ACID × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;298 K;10%(v/v) 2-Propanol, 0.1M Sodium citrate tribasic dihydrate, 26%(v/v) Polyethylene glycol 400 , pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.13 Å R-free 0.223 |
| 3U1K Crystal structure of human PNPase 提交 2011-09-30 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 B
46–669(624 aa)
片段:UNP residues 46-669
链 C
46–669(624 aa)
片段:UNP residues 46-669
链 D
46–669(624 aa)
片段:UNP residues 46-669
|
未记录 | CIT CITRIC ACID × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;298 K;10%(v/v) 2-Propanol, 0.1M Sodium citrate tribasic dihydrate, 26%(v/v) Polyethylene glycol 400 , pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.13 Å R-free 0.223 |
| 5ZF6 Crystal structure of the dimeric human PNPase 提交 2018-03-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
46–669(624 aa)
链 B
46–669(624 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298.15 K;0.1M citrate buffer (pH 5.0), 10% (v/v) 2-propanol, 26% (v/v) polyethylene glycol 400
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.249 |
| 9KJR The cryo-EM structure of human PNPase in the open conformation 提交 2024-11-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
46–753(708 aa)
链 B
46–753(708 aa)
链 C
46–753(708 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.86 Å |
| 9KJT The cryo-EM structure of human PNPase in the closed conformation 提交 2024-11-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
46–783(738 aa)
链 B
46–783(738 aa)
链 C
46–783(738 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.84 Å |
| 9NJB hPNPase RNA pre-catalytic state 提交 2025-02-27 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致 |
链 A
46–783(738 aa)
链 B
46–783(738 aa)
链 C
46–783(738 aa)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.15 Å |
| 9NJC hPNPase bound to PO4 in loop conformation 1 提交 2025-02-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
46–783(738 aa)
链 B
46–783(738 aa)
链 C
46–783(738 aa)
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.36 Å |
| 9NJD hPNPase bound to PO4 in loop conformation 3 提交 2025-02-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
46–783(738 aa)
链 B
46–783(738 aa)
链 C
46–783(738 aa)
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.44 Å |
| 9NJE hPNPase bound to PO4 in loop conformation 2 提交 2025-02-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
46–783(738 aa)
链 B
46–783(738 aa)
链 C
46–783(738 aa)
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.44 Å |
| 9NO0 hPNPase RNA loading state 提交 2025-03-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致 |
链 A
46–783(738 aa)
链 B
46–783(738 aa)
链 C
46–783(738 aa)
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.08 Å |
| 9XYI hPNPase RNA loading state 提交 2025-08-26 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致 |
链 A
46–783(738 aa)
链 B
46–783(738 aa)
链 C
46–783(738 aa)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.46 Å |
| 9XZF hPNPase RNA loading state with extended RNA in the bottom 提交 2025-08-27 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致 |
链 A
46–783(738 aa)
链 B
46–783(738 aa)
链 C
46–783(738 aa)
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.65 Å |