当前蛋白身份:Q8TCS8 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
3U1K Crystal structure of human PNPase 提交 2011-09-30 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 46–669(624 aa) 片段:UNP residues 46-669
未记录 CIT CITRIC ACID × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;298 K;10%(v/v) 2-Propanol, 0.1M Sodium citrate tribasic dihydrate, 26%(v/v) Polyethylene glycol 400 , pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.13 Å R-free 0.223
3U1K Crystal structure of human PNPase 提交 2011-09-30 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 B 46–669(624 aa) 片段:UNP residues 46-669
链 C 46–669(624 aa) 片段:UNP residues 46-669
链 D 46–669(624 aa) 片段:UNP residues 46-669
未记录 CIT CITRIC ACID × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;298 K;10%(v/v) 2-Propanol, 0.1M Sodium citrate tribasic dihydrate, 26%(v/v) Polyethylene glycol 400 , pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.13 Å R-free 0.223
5ZF6 Crystal structure of the dimeric human PNPase 提交 2018-03-02 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 46–669(624 aa)
链 B 46–669(624 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298.15 K;0.1M citrate buffer (pH 5.0), 10% (v/v) 2-propanol, 26% (v/v) polyethylene glycol 400
分辨率 2.80 Å R-free 0.249
9KJR The cryo-EM structure of human PNPase in the open conformation 提交 2024-11-12 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 46–753(708 aa)
链 B 46–753(708 aa)
链 C 46–753(708 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.86 Å
9KJT The cryo-EM structure of human PNPase in the closed conformation 提交 2024-11-12 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 46–783(738 aa)
链 B 46–783(738 aa)
链 C 46–783(738 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.84 Å
9NJB hPNPase RNA pre-catalytic state 提交 2025-02-27 Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致
链 A 46–783(738 aa)
链 B 46–783(738 aa)
链 C 46–783(738 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.15 Å
9NJC hPNPase bound to PO4 in loop conformation 1 提交 2025-02-27 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 46–783(738 aa)
链 B 46–783(738 aa)
链 C 46–783(738 aa)
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.36 Å
9NJD hPNPase bound to PO4 in loop conformation 3 提交 2025-02-27 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 46–783(738 aa)
链 B 46–783(738 aa)
链 C 46–783(738 aa)
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.44 Å
9NJE hPNPase bound to PO4 in loop conformation 2 提交 2025-02-27 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 46–783(738 aa)
链 B 46–783(738 aa)
链 C 46–783(738 aa)
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.44 Å
9NO0 hPNPase RNA loading state 提交 2025-03-07 Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致
链 A 46–783(738 aa)
链 B 46–783(738 aa)
链 C 46–783(738 aa)
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.08 Å
9XYI hPNPase RNA loading state 提交 2025-08-26 Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致
链 A 46–783(738 aa)
链 B 46–783(738 aa)
链 C 46–783(738 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.46 Å
9XZF hPNPase RNA loading state with extended RNA in the bottom 提交 2025-08-27 Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致
链 A 46–783(738 aa)
链 B 46–783(738 aa)
链 C 46–783(738 aa)
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å