当前蛋白身份:Q8WUM0 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1XKS The crystal structure of the N-terminal domain of Nup133 reveals a beta-propeller fold common to several nucleoporins 提交 2004-09-29 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 67–514(448 aa)
突变:F345L 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.7;277 K;PEG 3350, lithium sulfate, bis-tris, pH 5.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K, pH 5.70
分辨率 2.35 Å R-free 0.236
3CQC Nucleoporin Nup107/Nup133 interaction complex 提交 2008-04-02 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 935–1156(222 aa) 片段:residues 935-1156
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;289 K;0.1M Hepes, 1.1M sodium malonate, 1-1.5% PEG MME 5000, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 2.53 Å R-free 0.245
3CQG Nucleoporin Nup107/Nup133 interaction complex, delta finger mutant 提交 2008-04-02 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 934–1156(223 aa) 片段:residues 935-1156
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.4;289 K;25-27% PEG 2000 MME, 500mM KSCN, 0.1M Hepes, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 3.00 Å R-free 0.287
3I4R Nup107(aa658-925)/Nup133(aa517-1156) complex, H.sapiens 提交 2009-07-02 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 517–1156(640 aa) 片段:HELICAL DOMAIN (UNP residues 517-1156)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.8;291 K;0.8 M sodium/potassium phosphate, 15 % glycerol, 2% PEG 3350, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.53 Å R-free 0.370
5A9Q Human nuclear pore complex 提交 2015-07-22 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 304 PDB 声明:304-meric(304) 与蛋白数一致
链 3 1–1156(1156 aa)
链 C 1–1156(1156 aa)
链 L 1–1156(1156 aa)
链 U 1–1156(1156 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20MM TRIS, 0.2-0.4% TREHALOSE;pH 7.5;20MM TRIS, 0.2-0.4% TREHALOSE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE;VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, INSTRUMENT- HOMEMADE PLUNGER,
分辨率 23.00 Å
7PEQ Model of the outer rings of the human nuclear pore complex 提交 2021-08-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 288 PDB 声明:288-meric(288) 与蛋白数一致
链 AC 1–1156(1156 aa)
链 BC 1–1156(1156 aa)
链 CC 1–1156(1156 aa)
链 DC 1–1156(1156 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Cells were grown on holey carbon, Au-mesh supports. Grids were rinsed briefly with PBS and manually blotted before plunging into liquid ethane.
分辨率 35.00 Å
7R5J Human nuclear pore complex (dilated) 提交 2022-02-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 808 PDB 声明:808-meric(808) 与蛋白数一致
链 K0 1–1156(1156 aa)
链 K1 1–1156(1156 aa)
链 K2 1–1156(1156 aa)
链 K3 1–1156(1156 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 50.00 Å
7R5K Human nuclear pore complex (constricted) 提交 2022-02-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 808 PDB 声明:808-meric(808) 与蛋白数一致
链 K0 1–1156(1156 aa)
链 K1 1–1156(1156 aa)
链 K2 1–1156(1156 aa)
链 K3 1–1156(1156 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 12.00 Å