当前蛋白身份:Q8WUM0
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1XKS The crystal structure of the N-terminal domain of Nup133 reveals a beta-propeller fold common to several nucleoporins 提交 2004-09-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
67–514(448 aa)
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突变:F345L | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.7;277 K;PEG 3350, lithium sulfate, bis-tris, pH 5.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K, pH 5.70
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分辨率 2.35 Å R-free 0.236 |
| 3CQC Nucleoporin Nup107/Nup133 interaction complex 提交 2008-04-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
935–1156(222 aa)
片段:residues 935-1156
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;289 K;0.1M Hepes, 1.1M sodium malonate, 1-1.5% PEG MME 5000, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
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分辨率 2.53 Å R-free 0.245 |
| 3CQG Nucleoporin Nup107/Nup133 interaction complex, delta finger mutant 提交 2008-04-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
934–1156(223 aa)
片段:residues 935-1156
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.4;289 K;25-27% PEG 2000 MME, 500mM KSCN, 0.1M Hepes, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
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分辨率 3.00 Å R-free 0.287 |
| 3I4R Nup107(aa658-925)/Nup133(aa517-1156) complex, H.sapiens 提交 2009-07-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
517–1156(640 aa)
片段:HELICAL DOMAIN (UNP residues 517-1156)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.8;291 K;0.8 M sodium/potassium phosphate, 15 % glycerol, 2% PEG 3350, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
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分辨率 3.53 Å R-free 0.370 |
| 5A9Q Human nuclear pore complex 提交 2015-07-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 304 PDB 声明:304-meric(304) 与蛋白数一致 |
链 3
1–1156(1156 aa)
链 C
1–1156(1156 aa)
链 L
1–1156(1156 aa)
链 U
1–1156(1156 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
20MM TRIS, 0.2-0.4% TREHALOSE;pH 7.5;20MM TRIS, 0.2-0.4% TREHALOSE
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE;VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, INSTRUMENT- HOMEMADE PLUNGER,
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分辨率 23.00 Å |
| 7PEQ Model of the outer rings of the human nuclear pore complex 提交 2021-08-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 288 PDB 声明:288-meric(288) 与蛋白数一致 |
链 AC
1–1156(1156 aa)
链 BC
1–1156(1156 aa)
链 CC
1–1156(1156 aa)
链 DC
1–1156(1156 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Cells were grown on holey carbon, Au-mesh supports. Grids were rinsed briefly with PBS and manually blotted before plunging into liquid ethane.
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分辨率 35.00 Å |
| 7R5J Human nuclear pore complex (dilated) 提交 2022-02-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 808 PDB 声明:808-meric(808) 与蛋白数一致 |
链 K0
1–1156(1156 aa)
链 K1
1–1156(1156 aa)
链 K2
1–1156(1156 aa)
链 K3
1–1156(1156 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
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分辨率 50.00 Å |
| 7R5K Human nuclear pore complex (constricted) 提交 2022-02-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 808 PDB 声明:808-meric(808) 与蛋白数一致 |
链 K0
1–1156(1156 aa)
链 K1
1–1156(1156 aa)
链 K2
1–1156(1156 aa)
链 K3
1–1156(1156 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 12.00 Å |