当前蛋白身份:Q96RN5 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2GUT Solution structure of the trans-activation domain of the human co-activator ARC105 提交 2006-05-01 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 5–78(74 aa) 片段:ARC/MEDIATOR KIX domain, residues 5-78
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.8;298 K;离子强度(mmCIF原始值)30 mM NaCl;压力 ambient
NMR样品组成 1mM arc105 U-15N, 13C, 30mM NaCl, 10mM phosphate buffer, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
7EMF Human Mediator (deletion of MED1-IDR) in a Tail-extended conformation 提交 2021-04-13 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric(27) 与蛋白数一致
链 O 1–788(788 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7ENA TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in pre-assembled state (pre-hPIC-MED) 提交 2021-04-16 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 74 PDB 声明:76-meric(76) 与全部聚合物一致
链 o 1–788(788 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.07 Å
7ENC TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in fully-assembled state (hPIC-MED) 提交 2021-04-16 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 74 PDB 声明:76-meric(76) 与全部聚合物一致
链 o 1–788(788 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.13 Å
7ENJ Human Mediator (deletion of MED1-IDR) in a Tail-bent conformation (MED-B) 提交 2021-04-17 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 26 PDB 声明:26-meric(26) 与蛋白数一致
链 O 1–788(788 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
7LBM Structure of the human Mediator-bound transcription pre-initiation complex 提交 2021-01-08 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 54 PDB 声明:56-meric(56) 与全部聚合物一致
链 z 1–788(788 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 83 PDB 声明:87-meric(87) 与全部聚合物一致
链 o 1–788(788 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.04 Å
8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 83 PDB 声明:87-meric(87) 与全部聚合物一致
链 o 1–788(788 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.16 Å
8J9A Solution structure of ABD3 (residues 453-561) of human MED15 isoform 2 提交 2023-05-03 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 453–561(109 aa) 片段:activator-binding domain 3
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.5;298 K;离子强度(mmCIF原始值)200;压力 1
NMR样品组成 1 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] MED15_ABD3, 20 mM HEPES, 200 mM sodium chloride, 1 mM TCEP, 6 % v/v D2O, 94% H2O/6% D2O | 94% H2O/6% D2O
分辨率未提供
8T9D CryoEM structure of TR-TRAP 提交 2023-06-23 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 26 PDB 声明:26-meric(26) 与蛋白数一致
链 J 1–788(788 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.66 Å
8TQW Structure of human transcriptional Mediator complex 提交 2023-08-08 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 29 PDB 声明:29-meric(29) 与蛋白数一致
链 O 1–788(788 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.20 Å
8TRH The IDRc bound human core Mediator complex 提交 2023-08-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 26 PDB 声明:26-meric(26) 与蛋白数一致
链 O 1–788(788 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å