当前蛋白身份：Q99PJ1
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11IY Protocadherin-15 extracellular domains 1-7 提交 2026-02-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
28–817（790 aa）
链 D
28–817（790 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.57 Å |
| 4APX CRYSTAL STRUCTURE OF MOUSE CADHERIN-23 EC1-2 AND PROTOCADHERIN-15 EC1- 2 FORM I 提交 2012-04-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
27–259（233 aa）
片段：EC1-2, RESIDUES 27-259
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 7 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 CL CHLORIDE ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；0.1M MES, 8% PEG8000, PH6.5
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.193 |
| 4AQ8 CRYSTAL STRUCTURE OF MOUSE CADHERIN-23 EC1-2 AND PROTOCADHERIN-15 EC1- 2 FORM II 提交 2012-04-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
27–259（233 aa）
片段：EC1-2, RESIDUES 27-259
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 7 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；0.1 MES, 10% PEG 8000, PH 7.5
|
分辨率 2.63 Å R-free 0.243 |
| 4AQ8 CRYSTAL STRUCTURE OF MOUSE CADHERIN-23 EC1-2 AND PROTOCADHERIN-15 EC1- 2 FORM II 提交 2012-04-13 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
27–259（233 aa）
片段：EC1-2, RESIDUES 27-259
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 7 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；0.1 MES, 10% PEG 8000, PH 7.5
|
分辨率 2.63 Å R-free 0.243 |
| 4AQA CRYSTAL STRUCTURE OF DEAFNESS ASSOCIATED MUTANT MOUSE CADHERIN-23 EC1- 2D124G AND PROTOCADHERIN-15 EC1-2 FORM I 提交 2012-04-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
27–259（233 aa）
片段：EC1-2, RESIDUES 27-259
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 7 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 CL CHLORIDE ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；0.1 MES, 8% PEG 20000, PH 6.5
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.228 |
| 4AQE CRYSTAL STRUCTURE OF DEAFNESS ASSOCIATED MUTANT MOUSE CADHERIN-23 EC1- 2S70P AND PROTOCADHERIN-15 EC1-2 FORM I 提交 2012-04-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
27–259（233 aa）
片段：EC1-2, RESIDUES 27-259
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 7 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 K POTASSIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；0.1 M MES, 12% PEG 4000, PH 6.5
|
分辨率 2.27 Å R-free 0.239 |
| 4XXW Crystal structure of mouse Cadherin-23 EC1-2 and Protocadherin-15 EC1-2 splice variant 提交 2015-01-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
27–254（228 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 7 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2 M Ammonium Acetate
0.1 M HEPES, pH 7.5
25% (v/v) isopropanol
|
分辨率 2.26 Å R-free 0.233 |
| 4XXW Crystal structure of mouse Cadherin-23 EC1-2 and Protocadherin-15 EC1-2 splice variant 提交 2015-01-31 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
27–254（228 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 7 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2 M Ammonium Acetate
0.1 M HEPES, pH 7.5
25% (v/v) isopropanol
|
分辨率 2.26 Å R-free 0.233 |
| 5KJ4 Crystal Structure of Mouse Protocadherin-15 EC9-10 提交 2016-06-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
924–1149（226 aa）
片段：Cadherin 9 and 10, residues 924-1149
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277.15 K；0.095M HEPES (pH7.5), 0.19M CaCl2, 26.6% v/v PEG 400
|
分辨率 3.35 Å R-free 0.196 |
| 5KJ4 Crystal Structure of Mouse Protocadherin-15 EC9-10 提交 2016-06-17 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
924–1149（226 aa）
片段：Cadherin 9 and 10, residues 924-1149
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277.15 K；0.095M HEPES (pH7.5), 0.19M CaCl2, 26.6% v/v PEG 400
|
分辨率 3.35 Å R-free 0.196 |
| 5KJ4 Crystal Structure of Mouse Protocadherin-15 EC9-10 提交 2016-06-17 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
924–1149（226 aa）
片段：Cadherin 9 and 10, residues 924-1149
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277.15 K；0.095M HEPES (pH7.5), 0.19M CaCl2, 26.6% v/v PEG 400
|
分辨率 3.35 Å R-free 0.196 |
| 5KJ4 Crystal Structure of Mouse Protocadherin-15 EC9-10 提交 2016-06-17 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
924–1149（226 aa）
片段：Cadherin 9 and 10, residues 924-1149
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277.15 K；0.095M HEPES (pH7.5), 0.19M CaCl2, 26.6% v/v PEG 400
|
分辨率 3.35 Å R-free 0.196 |
| 5TPK Crystal Structure of Mouse Protocadherin-15 EC7-8 V875A 提交 2016-10-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
715–923（209 aa）
片段：Extracellular domain residues 715-924
|
突变：V875A | CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；0.2M AMMONIUM CHLORIDE, 10% PEG3350
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.229 |
| 5W1D Crystal Structure of Mouse Protocadherin-15 EC4-7 提交 2017-06-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
401–818（418 aa）
片段：residues 401-818
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 6 K POTASSIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；0.1 M Tris pH 8.5
2.0 M MgAc
23% PEG 400
|
分辨率 3.35 Å R-free 0.279 |
| 6BWN Crystal Structure of Mouse Protocadherin-15 EC6-7 提交 2017-12-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
615–818（204 aa）
片段：Cadherin domains 6-7, residues 615-818
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 K POTASSIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；30% PEG1500
|
分辨率 2.94 Å R-free 0.242 |
| 6BXU Crystal Structure of Mouse Protocadherin-15 EC5-7 I582T 提交 2017-12-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
507–818（312 aa）
片段：CADHERIN DOMAINS 5-7, RESIDUES 507-818
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M Na formate, 40% MPD
|
分辨率 3.79 Å R-free 0.283 |
| 6BXU Crystal Structure of Mouse Protocadherin-15 EC5-7 I582T 提交 2017-12-19 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
507–818（312 aa）
片段：CADHERIN DOMAINS 5-7, RESIDUES 507-818
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M Na formate, 40% MPD
|
分辨率 3.79 Å R-free 0.283 |
| 6C10 Crystal structure of mouse PCDH15 EC11-EL 提交 2018-01-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1151–1388（238 aa）
|
未记录 | MAN alpha-D-mannopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.2 M Lithium sulfate, 30% (w/v) PEG4000, 0.1 M Tris pH 8.5
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.195 |
| 6C13 CryoEM structure of mouse PCDH15-4EC-LHFPL5 complex 提交 2018-01-03 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
821–1465（645 aa）
链 B
821–1465（645 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 11.33 Å |
| 6C14 CryoEM structure of mouse PCDH15-1EC-LHFPL5 complex 提交 2018-01-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1144–1465（322 aa）
链 C
1144–1465（322 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 6CV7 Mouse Protocadherin-15 Extracellular Cadherin Domains 1 through 3 提交 2018-03-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
27–395（369 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 10 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 MAN alpha-D-mannopyranose × 10 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；35% Ethylene glycol
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.188 |
| 6EET Crystal structure of mouse Protocadherin-15 EC9-MAD12 提交 2018-08-15 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
919–1374（456 aa）
|
未记录 | MAN alpha-D-mannopyranose × 3 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.1 M HEPES sodium salt, 30% (w/v) MPD, 5% (w/v) PEG4000
|
分辨率 3.23 Å R-free 0.234 |
| 6N22 Crystal structure of mouse Protocadherin-15 EC1-2 BAP 提交 2018-11-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
27–265（239 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；277 K；0.02 M calcium chloride, 0.1 M sodium acetate, 30% (v/v) MPD
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.233 |
| 8TON Crystal Structure of Engineered Mouse Protocadherin-15 EC3-EC7 Connection 提交 2023-08-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
262–396（135 aa）
链 A
719–820（102 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；15% w/v PEG 20000, 0.1 M Tris HCl pH 8.5, 0.6 uM Spermine Tetrahydrochloride
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.223 |
| 8UMZ Crystal Structure of Engineered Mouse Protocadherin-15 EC4-EC7 Connection 提交 2023-10-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
392–510（119 aa）
链 A
719–820（102 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 5 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.1 M Sodium cacodylate pH 6.5,40% v/v MPD,5% w/v PEG 8000
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.274 |
| 8UMZ Crystal Structure of Engineered Mouse Protocadherin-15 EC4-EC7 Connection 提交 2023-10-18 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
392–510（119 aa）
链 B
719–820（102 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 5 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.1 M Sodium cacodylate pH 6.5,40% v/v MPD,5% w/v PEG 8000
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.274 |