当前蛋白身份:Q9H3P2
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5L3X Crystal structure of negative elongation factor subcomplex NELF-AC 提交 2016-05-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 A
6–182(177 aa)
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291.15 K;14-14.5% (w/v) PEG 3350
200mM sodium malonate pH 6.8-7.0
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.256 |
| 6GML Structure of paused transcription complex Pol II-DSIF-NELF 提交 2018-05-27 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:21-meric(21) 与全部聚合物一致 |
链 U
1–528(528 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 9 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 7PKS Structural basis of Integrator-mediated transcription regulation 提交 2021-08-26 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 30 PDB 声明:31-meric(31) 待复核 |
链 U
1–528(528 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 10 MN MANGANESE (II) ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 7YCX The structure of INTAC-PEC complex 提交 2022-07-02 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 31 PDB 声明:34-meric(34) 与全部聚合物一致 |
链 e
1–528(528 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 10 MN MANGANESE (II) ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.18 Å |
| 8RBX Structure of Integrator-PP2A bound to a paused RNA polymerase II-DSIF-NELF-nucleosome complex 提交 2023-12-05 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 43 PDB 声明:46-meric(46) 与全部聚合物一致 |
链 u
1–528(528 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 8UHA Structure of paused transcription complex Pol II-DSIF-NELF - tilted 提交 2023-10-08 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:21-meric(21) 与全部聚合物一致 |
链 U
1–188(188 aa)
链 U
253–528(276 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 8UHD Structure of paused transcription complex Pol II-DSIF-NELF - post-translocated 提交 2023-10-08 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:21-meric(21) 与全部聚合物一致 |
链 U
1–188(188 aa)
链 U
253–528(276 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 8UHG Structure of paused transcription complex Pol II-DSIF-NELF - poised post-translocated 提交 2023-10-09 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 17 PDB 声明:eicosameric(20) 与全部聚合物一致 |
链 U
1–528(528 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 8UI0 Structure of poised transcription complex Pol II-DSIF-NELF - pre-translocated 提交 2023-10-09 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 17 PDB 声明:eicosameric(20) 与全部聚合物一致 |
链 U
1–188(188 aa)
链 U
253–528(276 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 8UIS Structure of transcription complex Pol II-DSIF-NELF-TFIIS 提交 2023-10-10 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:nonadecameric(19) 与全部聚合物一致 |
链 U
1–528(528 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.23 Å |
| 8W8E human co-transcriptional RNA capping enzyme RNGTT 提交 2023-09-02 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 19 PDB 声明:22-meric(22) 与全部聚合物一致 |
链 U
1–528(528 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 9J0N Paused elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (PEC2-nuc) 提交 2024-08-02 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:30-meric(30) 与全部聚合物一致 |
链 U
1–528(528 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 9J0O Arrested elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (AEC1-nuc) 提交 2024-08-02 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 26 PDB 声明:29-meric(29) 与全部聚合物一致 |
链 U
1–528(528 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 9J0P Arrested elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (AEC2-nuc) 提交 2024-08-02 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 26 PDB 声明:29-meric(29) 与全部聚合物一致 |
链 U
1–528(528 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 9VD9 Cryo-EM structure of the human DSS1-INTAC-PEC complex 提交 2025-06-07 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 35 PDB 声明:38-meric(38) 与全部聚合物一致 |
链 e
1–528(528 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 10 MN MANGANESE (II) ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.60 Å |