当前蛋白身份：Q9NR28
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1FEW CRYSTAL STRUCTURE OF SMAC/DIABLO 提交 2000-07-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
56–239（184 aa）
片段：SMAC/DIABLO
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；276 K；Dioxane, Ammonium Sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 276.0K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.259 |
| 1FEW CRYSTAL STRUCTURE OF SMAC/DIABLO 提交 2000-07-23 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
56–239（184 aa）
片段：SMAC/DIABLO
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；276 K；Dioxane, Ammonium Sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 276.0K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.259 |
| 1G3F NMR STRUCTURE OF A 9 RESIDUE PEPTIDE FROM SMAC/DIABLO COMPLEXED TO THE BIR3 DOMAIN OF XIAP 提交 2000-10-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
56–64（9 aa）
片段：9 RESIDUE PEPTIDE
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.2；300 K；压力 1
NMR样品组成
1 mM protein/peptide complex, 120 mM NaCl, 1mM DTT, 10mM phosphate | 90% h20, 10% d20
|
分辨率未提供 |
| 1G73 CRYSTAL STRUCTURE OF SMAC BOUND TO XIAP-BIR3 DOMAIN 提交 2000-11-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
56–217（162 aa）
片段：RESIDUES 1-162
|
突变：F33D | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；297 K；100 mM Citrate, pH5.5
5% PEG4000
10% Isopropanol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.268 |
| 1G73 CRYSTAL STRUCTURE OF SMAC BOUND TO XIAP-BIR3 DOMAIN 提交 2000-11-08 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
56–217（162 aa）
片段：RESIDUES 1-162
|
突变：F33D | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；297 K；100 mM Citrate, pH5.5
5% PEG4000
10% Isopropanol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.268 |
| 1TW6 Structure of an ML-IAP/XIAP chimera bound to a 9mer peptide derived from Smac 提交 2004-06-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
56–64（9 aa）
片段：Smac residues 1-9
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；lithium sulfate, Bis-tris, PEG 3350, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.71 Å R-free 0.171 |
| 1TW6 Structure of an ML-IAP/XIAP chimera bound to a 9mer peptide derived from Smac 提交 2004-06-30 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
56–64（9 aa）
片段：Smac residues 1-9
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 LI LITHIUM ION × 1 BTB 2-[BIS-(2-HYDROXY-ETHYL)-AMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；lithium sulfate, Bis-tris, PEG 3350, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.71 Å R-free 0.171 |
| 1TW6 Structure of an ML-IAP/XIAP chimera bound to a 9mer peptide derived from Smac 提交 2004-06-30 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 C
56–64（9 aa）
片段：Smac residues 1-9
链 D
56–64（9 aa）
片段：Smac residues 1-9
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 LI LITHIUM ION × 2 BTB 2-[BIS-(2-HYDROXY-ETHYL)-AMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；lithium sulfate, Bis-tris, PEG 3350, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.71 Å R-free 0.171 |
| 1TW6 Structure of an ML-IAP/XIAP chimera bound to a 9mer peptide derived from Smac 提交 2004-06-30 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
56–64（9 aa）
片段：Smac residues 1-9
链 D
56–64（9 aa）
片段：Smac residues 1-9
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 LI LITHIUM ION × 1 BTB 2-[BIS-(2-HYDROXY-ETHYL)-AMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；lithium sulfate, Bis-tris, PEG 3350, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.71 Å R-free 0.171 |
| 1TW6 Structure of an ML-IAP/XIAP chimera bound to a 9mer peptide derived from Smac 提交 2004-06-30 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
56–64（9 aa）
片段：Smac residues 1-9
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；lithium sulfate, Bis-tris, PEG 3350, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.71 Å R-free 0.171 |
| 1XB0 Structure of the BIR domain of IAP-like protein 2 提交 2004-08-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 G
56–62（7 aa）
链 H
56–62（7 aa）
链 I
56–62（7 aa）
链 J
56–62（7 aa）
链 K
56–62（7 aa）
链 L
56–62（7 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 24 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；295 K；5% PEG3000, 100mM sodium acetate, 100mM Zinc acetate, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.244 |
| 1XB1 The Structure of the BIR domain of IAP-like protein 2 提交 2004-08-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 G
56–62（7 aa）
链 H
56–62（7 aa）
链 I
56–62（7 aa）
链 J
56–62（7 aa）
链 K
56–62（7 aa）
链 L
56–62（7 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 23 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；295 K；5% PEG3000, 100mM Na acetate, 100mM Zinc acetate, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.277 |
| 1XB1 The Structure of the BIR domain of IAP-like protein 2 提交 2004-08-27 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 G
56–62（7 aa）
链 H
56–62（7 aa）
链 I
56–62（7 aa）
链 J
56–62（7 aa）
链 K
56–62（7 aa）
链 L
56–62（7 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 46 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；295 K；5% PEG3000, 100mM Na acetate, 100mM Zinc acetate, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.277 |
| 3UIH crystal structure of human Survivin in complex with Smac/DIABLO(1-15) peptide 提交 2011-11-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 P
56–70（15 aa）
片段：unp residues 1-15
链 Q
56–70（15 aa）
片段：unp residues 1-15
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.2 M potassium thiocyanate, 10% PEG 3350, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.245 |
| 3UIJ Crystal structure of human Survivin K62Y/H80W mutant in complex with Smac/DIABLO(1-15) peptide 提交 2011-11-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 P
56–70（15 aa）
片段：unp residues 1-15
链 Q
56–70（15 aa）
片段：unp residues 1-15
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.2 M sodium bromide, 12% PEG 3350, pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.71 Å R-free 0.242 |
| 4TX5 Crystal structure of Smac-DIABLO (in space group P65) 提交 2014-07-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
56–239（184 aa）
片段：UNP Residues 56-239
链 B
56–239（184 aa）
片段：UNP Residues 56-239
|
未记录 | MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 6 ACT ACETATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；293 K；30% MPD, 0.1 M Sodium Acetate, 0.02 M Calcium Chloride.
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.202 |
| 6JX6 Tetrameric form of Smac 提交 2019-04-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
56–239（184 aa）
链 B
56–239（184 aa）
链 C
56–239（184 aa）
链 D
56–239（184 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；296 K；200mM Potassium Phosphate Monobasic, 20% PEG 3350
|
分辨率 2.81 Å R-free 0.264 |
| 8ATO Structure of the giant inhibitor of apoptosis, BIRC6 bound to the regulator SMAC 提交 2022-08-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
56–239（184 aa）
链 D
56–239（184 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8AUW Cryo-EM structure of human BIRC6 in complex with SMAC. 提交 2022-08-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
56–239（184 aa）
链 D
56–239（184 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.20 Å |
| 8E2I Cryo-EM structure of BIRC6/Smac 提交 2022-08-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 E
56–239（184 aa）
链 F
56–239（184 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.04 Å |
| 8E2J Cryo-EM structure of BIRC6/Smac (from local refinement 1) 提交 2022-08-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
56–239（184 aa）
链 B
56–239（184 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.44 Å |