当前蛋白身份:Q9P000
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4NKN The Crystal Structure of the N-terminal domain of COMMD9 提交 2013-11-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
2–117(116 aa)
片段:N-terminal domain (UNP residues 1-116)
链 B
2–117(116 aa)
片段:N-terminal domain (UNP residues 1-116)
链 E
2–117(116 aa)
片段:N-terminal domain (UNP residues 1-116)
|
突变:L67M, I101M 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:L67M, I101M 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:L67M, I101M 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;291.15 K;20% PEG 3350, 0.2M Mg Nitrate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291.15K
|
分辨率 2.79 Å R-free 0.249 |
| 4NKN The Crystal Structure of the N-terminal domain of COMMD9 提交 2013-11-12 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 C
2–117(116 aa)
片段:N-terminal domain (UNP residues 1-116)
链 D
2–117(116 aa)
片段:N-terminal domain (UNP residues 1-116)
链 F
2–117(116 aa)
片段:N-terminal domain (UNP residues 1-116)
|
突变:L67M, I101M 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:L67M, I101M 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:L67M, I101M 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;291.15 K;20% PEG 3350, 0.2M Mg Nitrate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291.15K
|
分辨率 2.79 Å R-free 0.249 |
| 4OE9 The crystal structure of the n-terminal domain of COMMD9 提交 2014-01-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–117(117 aa)
片段:COMMD9, unp residues 1-117
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突变:L67M, I101M 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CIT CITRIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.9;291.15 K;28% mPEG 5000, 0.2M citric acid, pH 4.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291.15K
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分辨率 1.55 Å R-free 0.165 |
| 4OE9 The crystal structure of the n-terminal domain of COMMD9 提交 2014-01-12 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 B
1–117(117 aa)
片段:COMMD9, unp residues 1-117
|
突变:L67M, I101M 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CIT CITRIC ACID × 1 K POTASSIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.9;291.15 K;28% mPEG 5000, 0.2M citric acid, pH 4.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291.15K
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.165 |
| 6BP6 Crystal structure of Commd9 COMM domain 提交 2017-11-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致 |
链 A
115–198(84 aa)
链 B
115–198(84 aa)
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;0.1 M HEPES (pH 7.0), 6% Jeffamine M-600
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分辨率 2.17 Å R-free 0.285 |
| 8ESD Crystal structure of COMMD7-COMMD9-COMMD5-COMMD10 tetramer 提交 2022-10-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 N
5–198(194 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;2 uM crown ether and 10% glycerol and grown in 22% ethanol and 5 mM EDTA
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分辨率 3.33 Å R-free 0.278 |
| 8F2R Human CCC complex 提交 2022-11-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致 |
链 I
1–198(198 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2;50 mM HEPES pH7.2, 150 mM NaCl, 2mM beta-mercaptoethanol, 0.01% Triton-X100
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.12 Å |
| 8F2U Human CCC complex 提交 2022-11-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致 |
链 I
1–198(198 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2;50 mM HEPES pH7.2, 150 mM NaCl, 2mM beta-mercaptoethanol, 0.01% Triton-X100
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.53 Å |
| 8P0W Structure of the human Commander complex COMMD ring 提交 2023-05-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致 |
链 I
1–198(198 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.90 Å |