当前蛋白身份:Q9P000 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
4NKN The Crystal Structure of the N-terminal domain of COMMD9 提交 2013-11-12 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 2–117(116 aa) 片段:N-terminal domain (UNP residues 1-116)
链 B 2–117(116 aa) 片段:N-terminal domain (UNP residues 1-116)
链 E 2–117(116 aa) 片段:N-terminal domain (UNP residues 1-116)
突变:L67M, I101M 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:L67M, I101M 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:L67M, I101M 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;291.15 K;20% PEG 3350, 0.2M Mg Nitrate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291.15K
分辨率 2.79 Å R-free 0.249
4NKN The Crystal Structure of the N-terminal domain of COMMD9 提交 2013-11-12 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 2–117(116 aa) 片段:N-terminal domain (UNP residues 1-116)
链 D 2–117(116 aa) 片段:N-terminal domain (UNP residues 1-116)
链 F 2–117(116 aa) 片段:N-terminal domain (UNP residues 1-116)
突变:L67M, I101M 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:L67M, I101M 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:L67M, I101M 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;291.15 K;20% PEG 3350, 0.2M Mg Nitrate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291.15K
分辨率 2.79 Å R-free 0.249
4OE9 The crystal structure of the n-terminal domain of COMMD9 提交 2014-01-12 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–117(117 aa) 片段:COMMD9, unp residues 1-117
突变:L67M, I101M 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) CIT CITRIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.9;291.15 K;28% mPEG 5000, 0.2M citric acid, pH 4.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291.15K
分辨率 1.55 Å R-free 0.165
4OE9 The crystal structure of the n-terminal domain of COMMD9 提交 2014-01-12 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 1–117(117 aa) 片段:COMMD9, unp residues 1-117
突变:L67M, I101M 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) CIT CITRIC ACID × 1 K POTASSIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.9;291.15 K;28% mPEG 5000, 0.2M citric acid, pH 4.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291.15K
分辨率 1.55 Å R-free 0.165
6BP6 Crystal structure of Commd9 COMM domain 提交 2017-11-22 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 115–198(84 aa)
链 B 115–198(84 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;0.1 M HEPES (pH 7.0), 6% Jeffamine M-600
分辨率 2.17 Å R-free 0.285
8ESD Crystal structure of COMMD7-COMMD9-COMMD5-COMMD10 tetramer 提交 2022-10-13 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 N 5–198(194 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;2 uM crown ether and 10% glycerol and grown in 22% ethanol and 5 mM EDTA
分辨率 3.33 Å R-free 0.278
8F2R Human CCC complex 提交 2022-11-08 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 I 1–198(198 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2;50 mM HEPES pH7.2, 150 mM NaCl, 2mM beta-mercaptoethanol, 0.01% Triton-X100
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.12 Å
8F2U Human CCC complex 提交 2022-11-08 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 I 1–198(198 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2;50 mM HEPES pH7.2, 150 mM NaCl, 2mM beta-mercaptoethanol, 0.01% Triton-X100
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.53 Å
8P0W Structure of the human Commander complex COMMD ring 提交 2023-05-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 I 1–198(198 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å