当前蛋白身份：Q9P0J7
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9D9Z Structure of human UBR4-KCMF1-CaM E3 ligase complex (Silencing Factor of the Integrated stress response, SiFI) 提交 2024-08-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 E
1–381（381 aa）
链 F
1–381（381 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 20 CA CALCIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 9HXW Cryo-EM structure of the human UBR4/KCMF1/CALM1 complex (composite map) 提交 2025-01-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 C
1–331（331 aa）
链 D
1–331（331 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 20 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9JNI KCMF1 Zn-coordinating domains with RCKG peptide (Sulfonic Cysteine) 提交 2024-09-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–55（54 aa）
链 A
77–142（66 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M HEPES, pH 7.0
1 M Magnesium chloride hexahydrate
20 % w/v PEG 6000
10 % v/v Ethylene glycol
|
分辨率 1.92 Å R-free 0.229 |
| 9NWE E3 ligase UBR4-KCMF1-calmodulin complex 提交 2025-03-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 E
1–381（381 aa）
链 F
1–381（381 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 CA CALCIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 9QWS Cryo-EM structure of the human UBR4/KCMF1/CALM1 complex (C-term dimer interface focused refinement) 提交 2025-04-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 C
1–381（381 aa）
链 D
1–381（381 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9QWU Cryo-EM structure of the human UBR4/KCMF1/CALM1 complex (CALM1 focused refinement) 提交 2025-04-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 C
1–381（381 aa）
链 D
1–381（381 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9QWZ Cryo-EM structure of the human UBR4/KCMF1/CALM1 complex (BP focused refinement) 提交 2025-04-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
1–381（381 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.80 Å |
| 9QX0 Cryo-EM structure of the human UBR4/KCMF1/CALM1 complex (C-term focused refinement) 提交 2025-04-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 C
1–381（381 aa）
链 D
1–381（381 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 9UPZ KCMF1 Zn-coordinating domains with RTGG peptide 提交 2025-04-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–55（54 aa）
链 A
77–136（60 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；0.3 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.3M Calcium chloride dihydrate, 12.5% MPD, 12.5% PEG1000, 12.5% PEG 3350
|
分辨率 1.71 Å R-free 0.236 |