当前蛋白身份:Q9UBD5 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
5UJ8 Human Origin Recognition Complex subunits 2 and 3 提交 2017-01-17 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–712(712 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;290 K;9.5% PEG20000 50mM tri-Sodium-citrate 60mM Citric Acid 10mg/ml HO23 Ratio 1:1
分辨率 6.00 Å R-free 0.368
5UJ8 Human Origin Recognition Complex subunits 2 and 3 提交 2017-01-17 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 1–712(712 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;290 K;9.5% PEG20000 50mM tri-Sodium-citrate 60mM Citric Acid 10mg/ml HO23 Ratio 1:1
分辨率 6.00 Å R-free 0.368
5UJ8 Human Origin Recognition Complex subunits 2 and 3 提交 2017-01-17 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 1–712(712 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;290 K;9.5% PEG20000 50mM tri-Sodium-citrate 60mM Citric Acid 10mg/ml HO23 Ratio 1:1
分辨率 6.00 Å R-free 0.368
5UJ8 Human Origin Recognition Complex subunits 2 and 3 提交 2017-01-17 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 D 1–712(712 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;290 K;9.5% PEG20000 50mM tri-Sodium-citrate 60mM Citric Acid 10mg/ml HO23 Ratio 1:1
分辨率 6.00 Å R-free 0.368
5UJ8 Human Origin Recognition Complex subunits 2 and 3 提交 2017-01-17 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 1–712(712 aa)
链 C 1–712(712 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;290 K;9.5% PEG20000 50mM tri-Sodium-citrate 60mM Citric Acid 10mg/ml HO23 Ratio 1:1
分辨率 6.00 Å R-free 0.368
5UJ8 Human Origin Recognition Complex subunits 2 and 3 提交 2017-01-17 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 B 1–712(712 aa)
链 D 1–712(712 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;290 K;9.5% PEG20000 50mM tri-Sodium-citrate 60mM Citric Acid 10mg/ml HO23 Ratio 1:1
分辨率 6.00 Å R-free 0.368
5UJM Structure of the active form of human Origin Recognition Complex and its ATPase motor module 提交 2017-01-18 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 C 1–712(712 aa)
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 18.00 Å
7CTE Human Origin Recognition Complex, ORC2-5 提交 2020-08-18 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 C 1–711(711 aa)
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7CTF Human origin recognition complex 1-5 State II 提交 2020-08-18 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 C 1–711(711 aa)
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
7CTG Human Origin Recognition Complex, ORC1-5 State I 提交 2020-08-18 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 C 1–711(711 aa)
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.00 Å
7JPO ORC-O1AAA: Human Origin Recognition Complex (ORC) with dynamic/unresolved ORC2 WH 提交 2020-08-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 C 1–712(712 aa)
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7JPP ORC-O2WH: Human Origin Recognition Complex (ORC) with dynamic/unresolved ORC1 AAA+ domain 提交 2020-08-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 C 1–712(712 aa)
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
7JPQ ORC-O2-5: Human Origin Recognition Complex (ORC) with subunits 2,3,4,5 提交 2020-08-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 C 1–712(712 aa)
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7JPR ORC-OPEN: Human Origin Recognition Complex (ORC) in an open conformation 提交 2020-08-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 C 1–712(712 aa)
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7JPS ORC-DNA: Human Origin Recognition Complex (ORC) with DNA bound in the core 提交 2020-08-09 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:heptameric(7) 与全部聚合物一致
链 C 1–712(712 aa)
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
8RWV Human OCCM DNA licensing intermediate 提交 2024-02-05 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:14-meric(14) 与全部聚合物一致
链 C 1–712(712 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.68 Å
8S0C H. sapiens ORC1-5 bound to double stranded DNA as part of the MCM-ORC complex 提交 2024-02-13 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:heptameric(7) 与全部聚合物一致
链 C 1–712(712 aa)
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S0D H. sapiens MCM bound to double stranded DNA and ORC1-6 提交 2024-02-13 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:tetradecameric(14) 与全部聚合物一致
链 C 1–712(712 aa)
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8S0E H. sapiens OCCM bound to double stranded DNA 提交 2024-02-13 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 13 PDB 声明:pentadecameric(15) 与全部聚合物一致
链 C 1–711(711 aa)
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8S0F H. sapiens OC1M bound to double stranded DNA 提交 2024-02-13 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:tetradecameric(14) 与全部聚合物一致
链 C 1–711(711 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 1 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å