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蛋白结构与聚集状态

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当前蛋白身份：Q9UBL9 重新检索
18PDB条目
18Biological assembly
50链与assembly记录
本组结构的主要差异维度
构建体不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果；所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
9DDV Cryo-EM structure of the human P2X2 receptor in the apo closed state 提交 2024-08-28 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致
链 A 1–471（471 aa）
链 B 1–471（471 aa）
链 C 1–471（471 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.71 Å
9DDW Cryo-EM structure of the human P2X2 receptor in conformation I of the ATP-bound desensitized state 提交 2024-08-28 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致
链 A 1–471（471 aa）
链 B 1–471（471 aa）
链 C 1–471（471 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.49 Å
9DDX Cryo-EM structure of the human P2X2 receptor in conformation II of the ATP-bound desensitized state 提交 2024-08-28 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致
链 A 43–361（319 aa）
链 B 43–361（319 aa）
链 C 43–361（319 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.55 Å
9OGH Human P2X2 apo structure in lipid nanodiscs 提交 2025-04-30 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致
链 A 1–471（471 aa）
链 B 1–471（471 aa）
链 C 1–471（471 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 24 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
9OHK Human P2X2 receptor channel in lipid nanodiscs with 0.5mM Suramin 提交 2025-05-05 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致
链 A 1–471（471 aa）
链 B 1–471（471 aa）
链 C 1–471（471 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9 SVR 8,8'-[CARBONYLBIS[IMINO-3,1-PHENYLENECARBONYLIMINO(4-METHYL-3,1-PHENYLENE)CARBONYLIMINO]]BIS-1,3,5-NAPHTHALENETRISULFON IC ACID × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9OIR Human P2X2 receptor channel in detergent with residual ATP 提交 2025-05-06 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致
链 A 1–471（471 aa）
链 B 1–471（471 aa）
链 C 1–471（471 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9OJK The open state structure of human P2X2 receptor channel in lipid nanodiscs with free ATP and sodium 提交 2025-05-07 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致
链 A 1–471（471 aa）
链 B 1–471（471 aa）
链 C 1–471（471 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
9OM0 The pre-desensitized state structure of human P2X2 receptor channel in lipid nanodiscs with free ATP and sodium 提交 2025-05-13 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致
链 A 1–471（471 aa）
链 B 1–471（471 aa）
链 C 1–471（471 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.58 Å
9OMR The desensitized state structure of human P2X2 receptor channel in lipid nanodiscs with free ATP and sodium 提交 2025-05-14 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致
链 A 1–471（471 aa）
链 B 1–471（471 aa）
链 C 1–471（471 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.68 Å
9ON5 The pre-open state 1 structure of human P2X2 receptor channel in lipid nanodiscs with free ATP and sodium 提交 2025-05-14 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致
链 A 1–471（471 aa）
链 B 1–471（471 aa）
链 C 1–471（471 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
9ON6 The pre-open state 2 structure of human P2X2 receptor channel in lipid nanodiscs with free ATP and sodium 提交 2025-05-14 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致
链 A 1–471（471 aa）
链 B 1–471（471 aa）
链 C 1–471（471 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
9UWW Cryo-EM structure of the human P2X2 receptor in the apo closed state 提交 2025-05-13 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致
链 A 1–471（471 aa）
链 B 1–471（471 aa）
链 C 1–471（471 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 PG8 1,2-DIOCTANOYL-SN-GLYCERO-3-[PHOSPHO-RAC-(1-GLYCEROL) × 3 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.19 Å
9UWX Cryo-EM structure of the human P2X2 receptor in the ATP-bound open state 提交 2025-05-13 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致
链 A 1–471（471 aa）
链 B 1–471（471 aa）
链 C 1–471（471 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.41 Å
9UWY Cryo-EM structure of the human P2X2 receptor in the ATP-bound desensitised state 提交 2025-05-13 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致
链 A 1–471（471 aa）
链 B 1–471（471 aa）
链 C 1–471（471 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.48 Å
9UX1 Cryo-EM structure of the human P2X2/3 heteromer receptor - class 1 (1:2) 提交 2025-05-13 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致
链 C 1–471（471 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.98 Å
9UX2 Cryo-EM structure of the human P2X2/3 heteromer receptor - class 2 (2:1) 提交 2025-05-13 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致
链 B 1–471（471 aa）
链 C 1–471（471 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.73 Å
9UX3 Cryo-EM structure of the human P2X2/3 heteromer receptor bound to AF-219 提交 2025-05-13 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致
链 B 1–471（471 aa）
链 C 1–471（471 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 AF9 5-[2,4-bis(azanyl)pyrimidin-5-yl]oxy-2-methoxy-4-propan-2-yl-benzenesulfonamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.64 Å
9Z32 The structure of short splice variant (Q9UBL9-2) of human P2X2 receptor channel in lipid nanodiscs with Mg-ATP 提交 2025-11-05 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致
链 A 1–404（404 aa）
链 B 1–404（404 aa）
链 C 1–404（404 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.83 Å

页面展示的是PDB/mmCIF中的结构证据。“未记录非水小分子”不等于实验样品绝对无配体； 实验环境属于整个PDB实验记录，配体与拷贝数按具体biological assembly展示。